seq1 = pF1KB7090.tfa, 510 bp
seq2 = pF1KB7090/gi568815596f_222952831.tfa (gi568815596f:222952831_223153340), 200510 bp

>pF1KB7090 510
>gi568815596f:222952831_223153340 (Chr2)

1-510  (100001-100510)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTGAAAATGGAGCCTCTGAACAGCACGCACCCCGGCACCGCCGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTGAAAATGGAGCCTCTGAACAGCACGCACCCCGGCACCGCCGCCTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAGCAGCCCCCTGGAGTCCCGTGCGGCCGGTGGCGGCAGCGGCAATGGCA
        |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
 100051 CAGCAGCCCCCTGGAGTCCCGTGCGGCCGGCGGCGGCAGCGGCAATGGCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACGAGTACTTCTACATTCTGGTTGTCATGTCCTTCTACGGCATTTTCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACGAGTACTTCTACATTCTGGTTGTCATGTCCTTCTACGGCATTTTCTTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATCGGAATCATGCTGGGCTACATGAAATCCAAGAGGCGGGAGAAGAAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATCGGAATCATGCTGGGCTACATGAAATCCAAGAGGCGGGAGAAGAAGTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAGCCTCCTGCTGCTGTACAAAGACGAGGAGCGGCTCTGGGGGGAGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAGCCTCCTGCTGCTGTACAAAGACGAGGAGCGGCTCTGGGGGGAGGCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGAAGCCGCTGCCCGTGGTGTCGGGCCTGAGGTCGGTGCAGGTGCCCCTG
        ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGAAGCCGCTGCCTGTGGTGTCGGGCCTGAGGTCGGTGCAGGTGCCCCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATGCTGAACATGCTGCAGGAGAGCGTGGCGCCCGCGCTGTCCTGCACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ATGCTGAACATGCTGCAGGAGAGCGTGGCGCCCGCGCTGTCCTGCACCCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTGTTCCATGGAAGGGGACAGCGTGAGCTCCGAGTCCTCCTCCCCGGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTGTTCCATGGAAGGGGACAGCGTGAGCTCCGAGTCCTCCTCCCCGGACG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGCACCTCACCATTCAGGAGGAGGGGGCAGACGAGGAGCTGGAGGAGACC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
 100401 TGCACCTCACCATTCAGGAGGAGGGGGCAGACGATGAGCTGGAGGAGACC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TCGGAGACGCCCCTCAACGAGAGCAGCGAAGGGTCCTCGGAGAACATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TCGGAGACGCCCCTCAACGAGAGCAGCGAAGGGTCCTCGGAGAACATCCA

    500     .    :
    501 TCAGAATTCC
        ||||||||||
 100501 TCAGAATTCC