seq1 = pF1KB7089.tfa, 456 bp
seq2 = pF1KB7089/gi568815587r_2828909.tfa (gi568815587r:2828909_3029364), 200456 bp

>pF1KB7089 456
>gi568815587r:2828909_3029364 (Chr11)

(complement)

1-456  (100001-100456)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAATCCCCCGACGAGGTGCTACGCGAGGGCGAGTTGGAGAAGCGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAATCCCCCGACGAGGTGCTACGCGAGGGCGAGTTGGAGAAGCGCAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGACAGCCTCTTCCAGCTATGGAAGAAGAAGCGCGGGGTGCTCACCTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGACAGCCTCTTCCAGCTATGGAAGAAGAAGCGCGGGGTGCTCACCTCCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACCGCCTGAGCCTGTTCCCCGCCAGCCCCCGCGCGCGCCCCAAGGAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACCGCCTGAGCCTGTTCCCCGCCAGCCCCCGCGCGCGCCCCAAGGAGCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGCTTCCACTCCATCCTCAAGGTGGACTGCGTGGAGCGCACGGGCAAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CGCTTCCACTCCATCCTCAAGGTGGACTGCGTGGAGCGCACGGGCAAGTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGTGTACTTCACCATCGTCACCACCGACCACAAGGAGATCGACTTCCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGTGTACTTCACCATCGTCACCACCGACCACAAGGAGATCGACTTCCGCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCGCGGGCGAGAGCTGCTGGAACGCGGCCATCGCGCTGGCGCTCATCGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCGCGGGCGAGAGCTGCTGGAACGCGGCCATCGCGCTGGCGCTCATCGAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTCCAGAACCGCCGCGCCCTGCAGGACTTTCGCAGCCGCCAGGAACGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTCCAGAACCGCCGCGCCCTGCAGGACTTTCGCAGCCGCCAGGAACGCAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CGCACCCGCCGCACCCGCCGAGGACGCCGTGGCTGCCGCGGCCGCCGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CGCACCCGCCGCACCCGCCGAGGACGCCGTGGCTGCCGCGGCCGCCGCAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCTCCGAGCCCTCGGAGCCCTCCAGGCCATCCCCGCAGCCCAAACCCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CCTCCGAGCCCTCGGAGCCCTCCAGGCCATCCCCGCAGCCCAAACCCCGC

    450     .
    451 ACGCCA
        ||||||
 100451 ACGCCA