seq1 = pF1KB7065.tfa, 2349 bp
seq2 = pF1KB7065/gi568815591f_64606321.tfa (gi568815591f:64606321_64808653), 202333 bp

>pF1KB7065 2349
>gi568815591f:64606321_64808653 (Chr7)

1-19  (85622-85640)   100% ->
20-2349  (100004-102333)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTAGCCAAACCCCCAG         TAATGTCTTTTCATTTTGCCCA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
  85622 ATGGTAGCCAAACCCCCAGGTA...CAGTAATGTCTTTTCATTTTGCCCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 AGACCTTTGGCCAGAGCAGAACATAAAAGATTCTTTCCAGAAAGTGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100026 AGACCTTTGGCCAGAGCAGAACATAAAAGATTCTTTCCAGAAAGTGACAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGAGAAGATACGGAAAATGTGAATATGAGAATTTACAGTTAAGAAAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100076 TGAGAAGATACGGAAAATGTGAATATGAGAATTTACAGTTAAGAAAAGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TGTAAACATGTGGATGAGTGTACGGGGCACAAAGGAGGTCATAATACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100126 TGTAAACATGTGGATGAGTGTACGGGGCACAAAGGAGGTCATAATACAGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TAACCAATGTTTGACAGCTACCCCAAGCAAAATATTCCAGTGTAATAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100176 TAACCAATGTTTGACAGCTACCCCAAGCAAAATATTCCAGTGTAATAAAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ATGTGAAAGTCTTTGATAAATTTTCAAATTCAAATAGATATAAGAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100226 ATGTGAAAGTCTTTGATAAATTTTCAAATTCAAATAGATATAAGAGAAGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CATACAGGAAACAAACACTTCAAATGTAAAGAATGTAGCAAATCATTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100276 CATACAGGAAACAAACACTTCAAATGTAAAGAATGTAGCAAATCATTTTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CGTGCTTTCACAACTAACTCAGCATAGAAGAATTCATACTAGAGTGAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100326 CGTGCTTTCACAACTAACTCAGCATAGAAGAATTCATACTAGAGTGAATT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CCTACAAATGTGAAGAATGTGGAAAAGCCTTTAACTGGTTCTCAACTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100376 CCTACAAATGTGAAGAATGTGGAAAAGCCTTTAACTGGTTCTCAACTCTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 ACTAAACATAAGAGAATTCATACTGGAGAAAAGCCCTACAAATGTGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100426 ACTAAACATAAGAGAATTCATACTGGAGAAAAGCCCTACAAATGTGAAGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 ATGTGGCAAAGCCTTTAACCAGTCCTCACAACTTACTAGGCATAAGATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100476 ATGTGGCAAAGCCTTTAACCAGTCCTCACAACTTACTAGGCATAAGATAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 TTCATACTGAAGAGAAACCCAACAAATGTGAAGAATGTGGCAAGGCCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100526 TTCATACTGAAGAGAAACCCAACAAATGTGAAGAATGTGGCAAGGCCTTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 AAACAGGCCTCACACCTTACTATACATAAAATAATTCATACTGGAGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100576 AAACAGGCCTCACACCTTACTATACATAAAATAATTCATACTGGAGAAAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 ACCTTACAAATATGAAGAATGTGGCAAAGTCTTTAGCCAGTCCTCACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100626 ACCTTACAAATATGAAGAATGTGGCAAAGTCTTTAGCCAGTCCTCACACC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TTACTACACAAAAGATACTTCACACTGGAGAGAACCTCTACAAGTGTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100676 TTACTACACAAAAGATACTTCACACTGGAGAGAACCTCTACAAGTGTAAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 GAATGTGGAAAAGCTTTTAACCTATTCTCAAATCTTACTAACCATAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100726 GAATGTGGAAAAGCTTTTAACCTATTCTCAAATCTTACTAACCATAAGAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 AATTCATGCTGGGGAGAAACCCTACAAATGTAAAGAATGTGGCAGAGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100776 AATTCATGCTGGGGAGAAACCCTACAAATGTAAAGAATGTGGCAGAGCTT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 TTAACATATCCTCAAACCTTAATAAACAGGAGAAAATTCATACTGGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100826 TTAACATATCCTCAAACCTTAATAAACAGGAGAAAATTCATACTGGAGGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 AAACTCAACAAATGTGAAGAATGTGACAAAGCTTTTAACCGATCCTTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100876 AAACTCAACAAATGTGAAGAATGTGACAAAGCTTTTAACCGATCCTTAAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 ACTTACTGCACATAAGAAAATTCTAATGGAAGAGAAACCCTACAAATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100926 ACTTACTGCACATAAGAAAATTCTAATGGAAGAGAAACCCTACAAATGTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 AAGAATGTGGCAAAGTCTTTAACCAGTTCTCAACTCTTACTAGACATAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100976 AAGAATGTGGCAAAGTCTTTAACCAGTTCTCAACTCTTACTAGACATAAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 ATAATTCATACTGGAGAGAAACCCTACAAATGTAAAGAATGTGGCAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101026 ATAATTCATACTGGAGAGAAACCCTACAAATGTAAAGAATGTGGCAAAGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 TTTTAACCAATCTTCAAACCTTACTGAACATAAGAAAATTCATACTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101076 TTTTAACCAATCTTCAAACCTTACTGAACATAAGAAAATTCATACTGCAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 AGAAATCCTATAAATGTGAAGAATGTGGCAAAGCTTTTAACCAACACTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101126 AGAAATCCTATAAATGTGAAGAATGTGGCAAAGCTTTTAACCAACACTCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 AACCTAATTAACCATAGGAAAATTTATTCTGGAGAGAAACCATACAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101176 AACCTAATTAACCATAGGAAAATTTATTCTGGAGAGAAACCATACAAATG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1242 TGAAGAATGTGGAAAAGCTTTTAATCGATCCTCAACCCTTACTAGACATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101226 TGAAGAATGTGGAAAAGCTTTTAATCGATCCTCAACCCTTACTAGACATA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1292 AGAAAATTCATACTGGAGAGAAACCCTACAAATGTGAAGAATGTGACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101276 AGAAAATTCATACTGGAGAGAAACCCTACAAATGTGAAGAATGTGACAGA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1342 GCTTTTAGCCAGTCTTCAAACCTTACTGAACATAAGAAAATTCATACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101326 GCTTTTAGCCAGTCTTCAAACCTTACTGAACATAAGAAAATTCATACTGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1392 AGAGAAACCCTATAAATGTGAGGAATGTGGCAAAGCTTTTAACCGATTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101376 AGAGAAACCCTATAAATGTGAGGAATGTGGCAAAGCTTTTAACCGATTCT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1442 CAACCCTTACTAAACATAAGAGAATTCATACTGGAGAAAAACCCTATAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101426 CAACCCTTACTAAACATAAGAGAATTCATACTGGAGAAAAACCCTATAAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1492 TGTGAAGAATGTGGAAAAGCCTTTAATCAATCCTATCAACTTACTAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101476 TGTGAAGAATGTGGAAAAGCCTTTAATCAATCCTATCAACTTACTAGACA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1542 TAAGATAGTTCATACTAAAGAGAAACTCAACAAATGTGAAGAATTTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101526 TAAGATAGTTCATACTAAAGAGAAACTCAACAAATGTGAAGAATTTGGCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1592 AGGCCTTTAAACAGTCCTCACACCGTACTATACATAAAATTATTCATACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101576 AGGCCTTTAAACAGTCCTCACACCGTACTATACATAAAATTATTCATACT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1642 GGAGAGAAACCCTACAAATGTGAAGAACATGGCAAAGTTTTTAACCAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101626 GGAGAGAAACCCTACAAATGTGAAGAACATGGCAAAGTTTTTAACCAGTC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1692 CTCAAACCTTACTACACAAAAGATAATTCATACTGGAGAGAACCTCTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101676 CTCAAACCTTACTACACAAAAGATAATTCATACTGGAGAGAACCTCTACA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1742 AATTTGAAGAACATGGAAAAGCTTTTAACCTATTCTCAAACATTACTAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101726 AATTTGAAGAACATGGAAAAGCTTTTAACCTATTCTCAAACATTACTAAC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1792 CATAAGATAATTTATACTGGAGAGAAACCCCACAAATGTGAAGAATGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101776 CATAAGATAATTTATACTGGAGAGAAACCCCACAAATGTGAAGAATGTGG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1842 AAAAGCTTATAACCGATTCTCAAACCTAACTATACATAAGAGAATTCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101826 AAAAGCTTATAACCGATTCTCAAACCTAACTATACATAAGAGAATTCATA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1892 CGGGAGAGAAACCTTACCAATGTGCAGAATGTGGCAAAGCCTTTAACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101876 CGGGAGAGAAACCTTACCAATGTGCAGAATGTGGCAAAGCCTTTAACTGC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1942 TCCTCAACCCTTAATAGACATAAGATAATTCATACTGGAGAGAAACCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101926 TCCTCAACCCTTAATAGACATAAGATAATTCATACTGGAGAGAAACCTTA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1992 CAAATGTAAAGAATGTGGCAAAGCTTTTAACCTATCCTCAACCCTTACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101976 CAAATGTAAAGAATGTGGCAAAGCTTTTAACCTATCCTCAACCCTTACTG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2042 CACATAAGAAAATTCATACTGGAGAGAAACCCTATAAATGTGAAGAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102026 CACATAAGAAAATTCATACTGGAGAGAAACCCTATAAATGTGAAGAATGT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2092 GGCAAAGCTTTTAACCAATCCTCAAACCTTACTACACATAAGAAAATTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102076 GGCAAAGCTTTTAACCAATCCTCAAACCTTACTACACATAAGAAAATTCA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2142 TACTTCAGAGAAACCCTACAAATGTGAAGAATGTGGCAAATCCTTTAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102126 TACTTCAGAGAAACCCTACAAATGTGAAGAATGTGGCAAATCCTTTAACC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2192 AGTTCTCATCTCTTAATATACATAAGATAATTCATACTGGAGAGAAACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102176 AGTTCTCATCTCTTAATATACATAAGATAATTCATACTGGAGAGAAACCC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2242 TACAAATGTGGAGATTATGGCAGAGCTTTCAACCTATCCTCAAATCTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102226 TACAAATGTGGAGATTATGGCAGAGCTTTCAACCTATCCTCAAATCTTAC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2292 TACACATAAGAAAATTCATACTGGAGAGAAACCCTACAAATGTGAGTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102276 TACACATAAGAAAATTCATACTGGAGAGAAACCCTACAAATGTGAGTATG

   2350     .
   2342 GCAAAACT
        ||||||||
 102326 GCAAAACT