seq1 = pF1KB7016.tfa, 2505 bp
seq2 = pF1KB7016/gi568815579f_58444822.tfa (gi568815579f:58444822_58650550), 172795 bp

>pF1KB7016 2505
>gi568815579f:58444822_58650550 (Chr19)

1-340  (99937-100276)   100% ->
341-453  (100604-100716)   100% ->
454-586  (100943-101075)   100% ->
587-722  (102555-102690)   100% ->
723-839  (102776-102892)   100% ->
840-954  (102971-103085)   100% ->
955-1101  (103213-103359)   100% ->
1102-1216  (103473-103587)   100% ->
1217-1323  (103665-103771)   100% ->
1324-1360  (103919-103955)   100% ->
1361-1409  (104041-104089)   100% ->
1410-1662  (104167-104419)   100% ->
1663-1982  (104510-104829)   100% ->
1983-2106  (104916-105039)   100% ->
2107-2193  (105128-105214)   100% ->
2194-2331  (105326-105463)   100% ->
2332-2505  (105556-105729)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCCTCCGCGGCGGCAGCCTCGGCAGCAGCGGCCTCGGCCGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99937 ATGGCGGCCTCCGCGGCGGCAGCCTCGGCAGCAGCGGCCTCGGCCGCCTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGGCAGCCCGGGCCCGGGCGAGGGCTCCGCTGGCGGCGAAAAGCGCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99987 TGGCAGCCCGGGCCCGGGCGAGGGCTCCGCTGGCGGCGAAAAGCGCTCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCGCCCCTTCGGCCGCAGCCTCGGCCTCTGCCTCAGCCGCGGCGTCGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100037 CCGCCCCTTCGGCCGCAGCCTCGGCCTCTGCCTCAGCCGCGGCGTCGTCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCCGCGGGGGGCGGCGCCGAGGCGCTGGAGCTGCTGGAGCACTGCGGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100087 CCCGCGGGGGGCGGCGCCGAGGCGCTGGAGCTGCTGGAGCACTGCGGCGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GTGCAGAGAGCGCCTGCGACCCGAGAGGGAGCCCCGCCTGCTGCCCTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100137 GTGCAGAGAGCGCCTGCGACCCGAGAGGGAGCCCCGCCTGCTGCCCTGTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGCACTCGGCCTGTAGTGCCTGCTTAGGGCCCGCGGCCCCCGCCGCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100187 TGCACTCGGCCTGTAGTGCCTGCTTAGGGCCCGCGGCCCCCGCCGCCGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AACAGCTCGGGGGACGGCGGGGCGGCGGGCGACGGCACCG         T
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 100237 AACAGCTCGGGGGACGGCGGGGCGGCGGGCGACGGCACCGGTA...AAGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GGTGGACTGTCCCGTGTGCAAGCAACAGTGCTTCTCCAAAGACATCGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100605 GGTGGACTGTCCCGTGTGCAAGCAACAGTGCTTCTCCAAAGACATCGTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 AGAATTATTTCATGCGTGATAGTGGCAGCAAGGCTGCCACCGACGCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100655 AGAATTATTTCATGCGTGATAGTGGCAGCAAGGCTGCCACCGACGCCCAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GATGCGAACCAG         TGCTGCACTAGCTGTGAGGATAATGCCCC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 100705 GATGCGAACCAGGTG...CAGTGCTGCACTAGCTGTGAGGATAATGCCCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 AGCCACCAGCTACTGTGTGGAGTGCTCGGAGCCTCTGTGTGAGACCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100972 AGCCACCAGCTACTGTGTGGAGTGCTCGGAGCCTCTGTGTGAGACCTGTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TAGAGGCGCACCAGCGGGTGAAGTACACCAAGGACCATACTGTGCGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101022 TAGAGGCGCACCAGCGGGTGAAGTACACCAAGGACCATACTGTGCGCTCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 ACTG         GGCCAGCCAAGTCTCGGGATGGTGAACGTACTGTCTA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101072 ACTGGTA...CAGGGCCAGCCAAGTCTCGGGATGGTGAACGTACTGTCTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 TTGCAACGTACACAAGCATGAACCCCTTGTGCTGTTTTGTGAGAGCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102592 TTGCAACGTACACAAGCATGAACCCCTTGTGCTGTTTTGTGAGAGCTGTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 ATACTCTCACCTGCCGAGACTGCCAGCTCAATGCCCACAAGGACCACCA 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 102642 ATACTCTCACCTGCCGAGACTGCCAGCTCAATGCCCACAAGGACCACCAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    723         GTACCAGTTCTTAGAGGATGCAGTGAGGAACCAGCGCAAGCT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102692 TG...CAGGTACCAGTTCTTAGAGGATGCAGTGAGGAACCAGCGCAAGCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CCTGGCCTCACTGGTGAAGCGCCTTGGGGACAAACATGCAACATTGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102818 CCTGGCCTCACTGGTGAAGCGCCTTGGGGACAAACATGCAACATTGCAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 AGAGCACCAAGGAGGTTCGCAGCTC         AATCCGCCAGGTGTCT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 102868 AGAGCACCAAGGAGGTTCGCAGCTCGTA...TAGAATCCGCCAGGTGTCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 GACGTACAGAAGCGTGTGCAAGTGGATGTCAAGATGGCCATCCTGCAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102987 GACGTACAGAAGCGTGTGCAAGTGGATGTCAAGATGGCCATCCTGCAGAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 CATGAAGGAGCTGAATAAGCGGGGCCGTGTGCTGGTCAATGATGCCCAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 103037 CATGAAGGAGCTGAATAAGCGGGGCCGTGTGCTGGTCAATGATGCCCAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    955         AAGGTGACTGAGGGGCAGCAGGAGCGCCTGGAGCGGCAGCAC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103087 TA...CAGAAGGTGACTGAGGGGCAGCAGGAGCGCCTGGAGCGGCAGCAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 TGGACCATGACCAAGATCCAGAAGCACCAGGAGCACATTCTGCGCTTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103255 TGGACCATGACCAAGATCCAGAAGCACCAGGAGCACATTCTGCGCTTTGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 CTCTTGGGCTCTGGAGAGTGACAACAACACAGCCCTTTTGCTTTCTAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103305 CTCTTGGGCTCTGGAGAGTGACAACAACACAGCCCTTTTGCTTTCTAAGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 AGTTG         ATCTACTTCCAGCTGCACCGGGCCCTCAAGATGATT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103355 AGTTGGTG...CAGATCTACTTCCAGCTGCACCGGGCCCTCAAGATGATT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 GTGGATCCCGTGGAGCCACATGGCGAGATGAAGTTTCAGTGGGACCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103509 GTGGATCCCGTGGAGCCACATGGCGAGATGAAGTTTCAGTGGGACCTCAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 TGCCTGGACCAAGAGTGCCGAGGCCTTTG         GCAAGATTGTGG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 103559 TGCCTGGACCAAGAGTGCCGAGGCCTTTGGTG...CAGGCAAGATTGTGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 CAGAGCGTCCTGGCACTAACTCAACAGGCCCTGCACCCATGGCCCCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103677 CAGAGCGTCCTGGCACTAACTCAACAGGCCCTGCACCCATGGCCCCTCCA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 AGAGCCCCAGGGCCCCTGAGCAAGCAGGGCTCTGGCAGCAGCCAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 103727 AGAGCCCCAGGGCCCCTGAGCAAGCAGGGCTCTGGCAGCAGCCAGGTG..

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1324     CCCATGGAGGTGCAGGAAGGCTATGGCTTTGGGTCAG         
        .>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 103777 .CAGCCCATGGAGGTGCAGGAAGGCTATGGCTTTGGGTCAGGTG...AAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 GAGATGATCCCTACTCAAGTGCAGAGCCCCATGTGTCAGGTGTGAAACG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 104041 GAGATGATCCCTACTCAAGTGCAGAGCCCCATGTGTCAGGTGTGAAACGG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1410         GTCCCGCTCAGGTGAGGGCGAGGTGAGCGGCCTTATGCGCAA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104091 TA...CAGGTCCCGCTCAGGTGAGGGCGAGGTGAGCGGCCTTATGCGCAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 GGTGCCACGAGTGAGCCTTGAACGCCTGGACCTGGACCTCACAGCTGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104209 GGTGCCACGAGTGAGCCTTGAACGCCTGGACCTGGACCTCACAGCTGACA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 GCCAGCCACCCGTCTTCAAGGTCTTCCCAGGCAGTACCACTGAGGACTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104259 GCCAGCCACCCGTCTTCAAGGTCTTCCCAGGCAGTACCACTGAGGACTAC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 AACCTTATTGTTATTGAACGTGGCGCTGCCGCTGCAGCTACCGGCCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104309 AACCTTATTGTTATTGAACGTGGCGCTGCCGCTGCAGCTACCGGCCAGCC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 AGGGACTGCGCCTGCAGGAACCCCTGGTGCCCCACCCCTGGCTGGCATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104359 AGGGACTGCGCCTGCAGGAACCCCTGGTGCCCCACCCCTGGCTGGCATGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1652 CCATTGTCAAG         GAGGAGGAGACGGAGGCTGCCATTGGAGCC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 104409 CCATTGTCAAGGTA...CAGGAGGAGGAGACGGAGGCTGCCATTGGAGCC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 CCTCCTACTGCCACTGAGGGCCCTGAGACCAAACCTGTGCTTATGGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104540 CCTCCTACTGCCACTGAGGGCCCTGAGACCAAACCTGTGCTTATGGCTCT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 TGCGGAGGGTCCTGGTGCTGAGGGTCCCCGCCTGGCCTCACCTAGTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104590 TGCGGAGGGTCCTGGTGCTGAGGGTCCCCGCCTGGCCTCACCTAGTGGCA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1793 GCACCAGCTCAGGGCTGGAGGTGGTGGCTCCTGAGGGTACCTCAGCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104640 GCACCAGCTCAGGGCTGGAGGTGGTGGCTCCTGAGGGTACCTCAGCCCCA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1843 GGTGGTGGCCCGGGAACCCTGGATGACAGTGCCACCATTTGCCGTGTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104690 GGTGGTGGCCCGGGAACCCTGGATGACAGTGCCACCATTTGCCGTGTCTG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1893 CCAGAAGCCAGGCGATCTGGTTATGTGCAACCAGTGTGAGTTTTGTTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104740 CCAGAAGCCAGGCGATCTGGTTATGTGCAACCAGTGTGAGTTTTGTTTCC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1943 ACCTGGACTGTCACCTGCCGGCCCTGCAGGATGTACCAGG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 104790 ACCTGGACTGTCACCTGCCGGCCCTGCAGGATGTACCAGGGTG...TAGG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1984 GAGGAGTGGAGCTGCTCACTCTGCCATGTGCTCCCTGACCTGAAGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104917 GAGGAGTGGAGCTGCTCACTCTGCCATGTGCTCCCTGACCTGAAGGAGGA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2034 GGATGGCAGCCTCAGCCTGGATGGTGCAGACAGCACTGGCGTGGTGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104967 GGATGGCAGCCTCAGCCTGGATGGTGCAGACAGCACTGGCGTGGTGGCCA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2084 AGCTCTCACCAGCCAACCAGCGG         AAATGTGAGCGTGTACTG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 105017 AGCTCTCACCAGCCAACCAGCGGGTG...TAGAAATGTGAGCGTGTACTG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2125 CTGGCCCTATTCTGTCACGAACCCTGCCGCCCCCTGCATCAGCTGGCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105146 CTGGCCCTATTCTGTCACGAACCCTGCCGCCCCCTGCATCAGCTGGCTAC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2175 CGACTCCACCTTCTCCCTG         GACCAGCCCGGTGGCACCCTGG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 105196 CGACTCCACCTTCTCCCTGGTG...CAGGACCAGCCCGGTGGCACCCTGG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2216 ATCTGACCCTGATCCGTGCCCGCCTCCAGGAGAAGTTGTCACCTCCCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105348 ATCTGACCCTGATCCGTGCCCGCCTCCAGGAGAAGTTGTCACCTCCCTAC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2266 AGCTCCCCACAGGAGTTTGCCCAGGATGTGGGCCGCATGTTCAAGCAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105398 AGCTCCCCACAGGAGTTTGCCCAGGATGTGGGCCGCATGTTCAAGCAATT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2316 CAACAAGTTAACTGAG         GACAAGGCAGACGTGCAGTCCATCA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 105448 CAACAAGTTAACTGAGGTG...CAGGACAAGGCAGACGTGCAGTCCATCA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2357 TCGGCCTGCAGCGCTTCTTCGAGACGCGCATGAACGAGGCCTTCGGTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105581 TCGGCCTGCAGCGCTTCTTCGAGACGCGCATGAACGAGGCCTTCGGTGAC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2407 ACCAAGTTCTCTGCTGTGCTGGTGGAGCCCCCGCCGATGAGCCTGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105631 ACCAAGTTCTCTGCTGTGCTGGTGGAGCCCCCGCCGATGAGCCTGCCTGG

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   2457 TGCTGGCCTGAGTTCCCAGGAGCTGTCTGGTGGCCCTGGTGATGGCCCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105681 TGCTGGCCTGAGTTCCCAGGAGCTGTCTGGTGGCCCTGGTGATGGCCCC