seq1 = pF1KB7012.tfa, 3120 bp
seq2 = pF1KB7012/gi568815597f_204953186.tfa (gi568815597f:204953186_205173762), 220577 bp

>pF1KB7012 3120
>gi568815597f:204953186_205173762 (Chr1)

1-70  (100001-100070)   100% ->
71-215  (104736-104880)   100% ->
216-391  (104996-105171)   100% ->
392-487  (105383-105478)   100% ->
488-697  (105899-106108)   100% ->
698-797  (106398-106497)   100% ->
798-973  (108060-108235)   100% ->
974-1110  (108680-108816)   99% ->
1111-1240  (109255-109384)   100% ->
1241-1391  (111137-111287)   100% ->
1392-1519  (111438-111565)   100% ->
1520-1695  (111902-112077)   100% ->
1696-1816  (112604-112724)   100% ->
1817-1975  (113256-113414)   100% ->
1976-2125  (113916-114065)   100% ->
2126-2196  (116306-116376)   100% ->
2197-2431  (116642-116876)   100% ->
2432-2544  (117241-117353)   100% ->
2545-2731  (118762-118948)   100% ->
2732-2844  (119298-119410)   100% ->
2845-3013  (119883-120051)   100% ->
3014-3120  (120471-120577)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGACAGCCACCAGGAGGAAGCCACACCTGCTGCTGGTAGCTGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGACAGCCACCAGGAGGAAGCCACACCTGCTGCTGGTAGCTGCTGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCCCTTGTCTCCTCTTCAG         CTTGGAGTTCAGCCCTGGGAT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100051 GGCCCTTGTCTCCTCTTCAGGTA...CAGCTTGGAGTTCAGCCCTGGGAT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CCCAAACCACCTTCGGGCCTGTCTTTGAAGACCAGCCCCTCAGTGTGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104757 CCCAAACCACCTTCGGGCCTGTCTTTGAAGACCAGCCCCTCAGTGTGCTA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TTCCCAGAGGAGTCCACGGAGGAGCAGGTGTTGCTGGCATGCCGCGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104807 TTCCCAGAGGAGTCCACGGAGGAGCAGGTGTTGCTGGCATGCCGCGCCCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGCCAGCCCTCCAGCCACCTATCG         GTGGAAGATGAATGGTA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 104857 GGCCAGCCCTCCAGCCACCTATCGGTA...CAGGTGGAAGATGAATGGTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CCGAGATGAAGCTGGAGCCAGGTTCCCGTCACCAGCTGGTGGGGGGCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105013 CCGAGATGAAGCTGGAGCCAGGTTCCCGTCACCAGCTGGTGGGGGGCAAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CTGGTCATCATGAACCCCACCAAGGCACAGGATGCCGGGGTCTACCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105063 CTGGTCATCATGAACCCCACCAAGGCACAGGATGCCGGGGTCTACCAGTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CCTGGCCTCCAACCCAGTGGGCACCGTTGTCAGCAGGGAGGCCATCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105113 CCTGGCCTCCAACCCAGTGGGCACCGTTGTCAGCAGGGAGGCCATCCTCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GCTTCGGCT         TTCTGCAGGAATTCTCCAAGGAGGAGCGAGAC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 105163 GCTTCGGCTGTG...CAGTTCTGCAGGAATTCTCCAAGGAGGAGCGAGAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CCAGTGAAAGCTCATGAAGGCTGGGGGGTGATGTTGCCCTGTAACCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105415 CCAGTGAAAGCTCATGAAGGCTGGGGGGTGATGTTGCCCTGTAACCCACC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TGCCCACTACCCAG         GCTTGTCCTACCGCTGGCTCCTCAACG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 105465 TGCCCACTACCCAGGTG...TAGGCTTGTCCTACCGCTGGCTCCTCAACG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AGTTCCCCAACTTCATCCCGACGGACGGGCGTCACTTCGTGTCCCAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105926 AGTTCCCCAACTTCATCCCGACGGACGGGCGTCACTTCGTGTCCCAGACC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 ACAGGGAACCTGTACATTGCCCGAACCAATGCCTCAGACCTGGGCAACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105976 ACAGGGAACCTGTACATTGCCCGAACCAATGCCTCAGACCTGGGCAACTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CTCCTGTTTGGCCACCAGCCACATGGACTTCTCCACCAAGAGCGTCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106026 CTCCTGTTTGGCCACCAGCCACATGGACTTCTCCACCAAGAGCGTCTTCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 GCAAGTTTGCTCAGCTCAACCTGGCTGCTGAAG         ATACCCGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 106076 GCAAGTTTGCTCAGCTCAACCTGGCTGCTGAAGGTC...CAGATACCCGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 CTCTTTGCACCCAGCATCAAGGCCCGGTTCCCAGCAGAGACCTATGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106406 CTCTTTGCACCCAGCATCAAGGCCCGGTTCCCAGCAGAGACCTATGCACT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GGTGGGGCAGCAGGTCACCCTGGAGTGCTTCGCCTTTGGGAA        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 106456 GGTGGGGCAGCAGGTCACCCTGGAGTGCTTCGCCTTTGGGAAGTG...CA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    798  CCCTGTCCCCCGGATCAAGTGGCGCAAAGTGGACGGCTCCCTGTCCCCG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108059 GCCCTGTCCCCCGGATCAAGTGGCGCAAAGTGGACGGCTCCCTGTCCCCG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CAGTGGACCACAGCTGAGCCCACCCTGCAGATCCCCAGCGTCAGCTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108109 CAGTGGACCACAGCTGAGCCCACCCTGCAGATCCCCAGCGTCAGCTTTGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 GGATGAGGGCACCTACGAGTGTGAGGCGGAGAACTCCAAGGGCCGAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108159 GGATGAGGGCACCTACGAGTGTGAGGCGGAGAACTCCAAGGGCCGAGACA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 CCGTGCAGGGCCGCATCATCGTGCAGG         CTCAGCCTGAGTGG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 108209 CCGTGCAGGGCCGCATCATCGTGCAGGGTA...CAGCTCAGCCTGAGTGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 CTAAAAGTGATCTCGGACACAGAGGCTGACATTGGCTCCAACCTGCGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108694 CTAAAAGTGATCTCGGACACAGAGGCTGACATTGGCTCCAACCTGCGTTG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 GGGCTGTGCAGCCGCCGGCAAGCCCCGGCCTACAGTGCGCTGGCTGCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108744 GGGCTGTGCAGCCGCCGGCAAGCCCCGGCCTACAGTGCGCTGGCTGCGGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 ACGGGGAGCTTCTGGCCTCCCAG         AACCGGGTGGAGGTGTTG
        ||||||||| |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 108794 ACGGGGAGCCTCTGGCCTCCCAGGTA...CAGAACCGGGTGGAGGTGTTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 GCTGGGGACCTGCGGTTCTCCAAGCTGAGCCTGGAAGACTCGGGCATGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109273 GCTGGGGACCTGCGGTTCTCCAAGCTGAGCCTGGAAGACTCGGGCATGTA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 CCAGTGTGTGGCAGAGAATAAGCACGGTACCATCTACGCCAGCGCCGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109323 CCAGTGTGTGGCAGAGAATAAGCACGGTACCATCTACGCCAGCGCCGAGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 TAGCCGTGCAAG         CACTCGCCCCTGACTTCAGGCTGAATCCC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 109373 TAGCCGTGCAAGGTA...TAGCACTCGCCCCTGACTTCAGGCTGAATCCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 GTGAGGCGTCTGATCCCCGCGGCCCGCGGGGGAGAGATCCTTATCCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111166 GTGAGGCGTCTGATCCCCGCGGCCCGCGGGGGAGAGATCCTTATCCCCTG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 CCAGCCCCGGGCAGCTCCAAAGGCCGTGGTGCTCTGGAGCAAAGGCACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111216 CCAGCCCCGGGCAGCTCCAAAGGCCGTGGTGCTCTGGAGCAAAGGCACGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 AGATTTTGGTCAACAGCAGCAG         AGTGACTGTAACTCCAGAT
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 111266 AGATTTTGGTCAACAGCAGCAGGTA...CAGAGTGACTGTAACTCCAGAT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 GGCACCTTGATCATAAGAAACATCAGCCGGTCAGATGAAGGCAAATACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111457 GGCACCTTGATCATAAGAAACATCAGCCGGTCAGATGAAGGCAAATACAC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 CTGCTTTGCTGAGAACTTCATGGGCAAAGCCAACAGCACTGGAATCCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111507 CTGCTTTGCTGAGAACTTCATGGGCAAAGCCAACAGCACTGGAATCCTAT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 CTGTGCGAG         ATGCAACCAAAATCACTCTAGCCCCCTCAAGT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 111557 CTGTGCGAGGTG...CAGATGCAACCAAAATCACTCTAGCCCCCTCAAGT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 GCCGACATCAACTTGGGTGACAACCTGACCCTACAGTGCCATGCCTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111934 GCCGACATCAACTTGGGTGACAACCTGACCCTACAGTGCCATGCCTCCCA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 CGACCCCACCATGGACCTCACCTTCACCTGGACCCTGGACGACTTCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111984 CGACCCCACCATGGACCTCACCTTCACCTGGACCCTGGACGACTTCCCCA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1652 TCGACTTTGATAAGCCTGGAGGGCACTACCGGAGAACTAATGTG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 112034 TCGACTTTGATAAGCCTGGAGGGCACTACCGGAGAACTAATGTGGTG...

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1696    AAGGAGACCATTGGGGATCTGACCATCCTGAACGCCCAGCTGCGCCA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112601 CAGAAGGAGACCATTGGGGATCTGACCATCCTGAACGCCCAGCTGCGCCA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 TGGGGGGAAGTACACGTGCATGGCCCAGACGGTGGTGGACAGCGCGTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112651 TGGGGGGAAGTACACGTGCATGGCCCAGACGGTGGTGGACAGCGCGTCCA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1793 AGGAGGCCACAGTCCTGGTCCGAG         GTCCGCCAGGTCCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 112701 AGGAGGCCACAGTCCTGGTCCGAGGTG...CAGGTCCGCCAGGTCCCCCA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 GGAGGTGTGGTGGTGAGGGACATTGGCGACACCACCATCCAGCTCAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113273 GGAGGTGTGGTGGTGAGGGACATTGGCGACACCACCATCCAGCTCAGCTG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1884 GAGCCGTGGCTTCGACAACCACAGCCCCATCGCTAAGTACACCCTGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113323 GAGCCGTGGCTTCGACAACCACAGCCCCATCGCTAAGTACACCCTGCAAG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1934 CTCGCACTCCACCTGCAGGGAAGTGGAAGCAGGTTCGGACCA        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 113373 CTCGCACTCCACCTGCAGGGAAGTGGAAGCAGGTTCGGACCAGTA...CA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1976  ATCCTGCAAACATCGAGGGCAATGCCGAGACTGCACAGGTGCTGGGCCT
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113915 GATCCTGCAAACATCGAGGGCAATGCCGAGACTGCACAGGTGCTGGGCCT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2025 CACCCCCTGGATGGACTATGAGTTCCGGGTCATAGCCAGCAACATTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113965 CACCCCCTGGATGGACTATGAGTTCCGGGTCATAGCCAGCAACATTCTGG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2075 GCACTGGGGAGCCTAGTGGGCCCTCCAGCAAAATCCGGACCAGGGAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114015 GCACTGGGGAGCCTAGTGGGCCCTCCAGCAAAATCCGGACCAGGGAAGCA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2125 G         CCCCCTCGGTGGCACCCTCAGGACTCAGCGGAGGAGGTGG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114065 GGTG...CAGCCCCCTCGGTGGCACCCTCAGGACTCAGCGGAGGAGGTGG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2166 AGCCCCCGGAGAGCTCATCGTCAACTGGACG         CCCATGTCAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 116346 AGCCCCCGGAGAGCTCATCGTCAACTGGACGGTA...CAGCCCATGTCAC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2207 GGGAGTACCAGAACGGAGACGGCTTCGGCTACCTGCTGTCCTTCCGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116652 GGGAGTACCAGAACGGAGACGGCTTCGGCTACCTGCTGTCCTTCCGCAGG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2257 CAGGGCAGCACTCACTGGCAGACCGCCCGGGTGCCTGGCGCCGATGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116702 CAGGGCAGCACTCACTGGCAGACCGCCCGGGTGCCTGGCGCCGATGCCCA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2307 GTACTTTGTCTACAGCAACGAGAGCGTCCGGCCCTACACGCCCTTTGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116752 GTACTTTGTCTACAGCAACGAGAGCGTCCGGCCCTACACGCCCTTTGAGG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2357 TCAAGATCCGCAGCTACAACCGCCGCGGGGATGGGCCCGAGAGCCTCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116802 TCAAGATCCGCAGCTACAACCGCCGCGGGGATGGGCCCGAGAGCCTCACT

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2407 GCACTCGTGTACTCAGCTGAGGAAG         AGCCCAGGGTGGCCCC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 116852 GCACTCGTGTACTCAGCTGAGGAAGGTG...CAGAGCCCAGGGTGGCCCC

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2448 TACCAAGGTGTGGGCCAAAGGGGTCTCATCCTCAGAGATGAACGTGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117257 TACCAAGGTGTGGGCCAAAGGGGTCTCATCCTCAGAGATGAACGTGACCT

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2498 GGGAACCCGTGCAGCAGGACATGAATGGTATCCTCCTGGGGTATGAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 117307 GGGAACCCGTGCAGCAGGACATGAATGGTATCCTCCTGGGGTATGAGGTG

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2545       ATCCGCTACTGGAAAGCTGGGGACAAAGAAGCAGCTGCGGACCG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117357 ...CAGATCCGCTACTGGAAAGCTGGGGACAAAGAAGCAGCTGCGGACCG

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2589 AGTGAGGACAGCAGGGCTGGACACCAGTGCCCGAGTCAGCGGCCTGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118806 AGTGAGGACAGCAGGGCTGGACACCAGTGCCCGAGTCAGCGGCCTGCATC

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2639 CCAACACCAAGTACCATGTGACCGTGAGGGCCTACAACCGGGCTGGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118856 CCAACACCAAGTACCATGTGACCGTGAGGGCCTACAACCGGGCTGGCACT

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2689 GGGCCTGCCAGCCCTTCTGCCAACGCCACGACCATGAAGCCCC       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 118906 GGGCCTGCCAGCCCTTCTGCCAACGCCACGACCATGAAGCCCCGTG...C

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2732   CTCCGCGGCGACCTCCTGGCAACATCTCCTGGACTTTCTCAAGCTCTA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119296 AGCTCCGCGGCGACCTCCTGGCAACATCTCCTGGACTTTCTCAAGCTCTA

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2780 GTCTTAGCATTAAGTGGGACCCTGTGGTCCCTTTCCGAAATGAGTCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119346 GTCTTAGCATTAAGTGGGACCCTGTGGTCCCTTTCCGAAATGAGTCTGCA

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2830 GTCACCGGCTATAAG         ATGCTGTACCAGAATGACTTACACCT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 119396 GTCACCGGCTATAAGGTG...CAGATGCTGTACCAGAATGACTTACACCT

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2871 GACTCCCACGCTCCACCTCACCGGCAAGAACTGGATAGAAATCCCAGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119909 GACTCCCACGCTCCACCTCACCGGCAAGAACTGGATAGAAATCCCAGTGC

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2921 CTGAAGACATTGGCCATGCCCTGGTACAAATTCGGACCACAGGGCCCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119959 CTGAAGACATTGGCCATGCCCTGGTACAAATTCGGACCACAGGGCCCGGA

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2971 GGGGATGGGATCCCTGCAGAAGTCCACATCGTGAGGAATGGAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 120009 GGGGATGGGATCCCTGCAGAAGTCCACATCGTGAGGAATGGAGGTG...C

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3014   GCACAAGCATGATGGTGGAGAACATGGCAGTCCGCCCAGCACCACACC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120469 AGGCACAAGCATGATGGTGGAGAACATGGCAGTCCGCCCAGCACCACACC

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3062 CTGGCACCGTCATTTCCCACTCCGTGGCGATGCTGATCCTCATAGGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120519 CTGGCACCGTCATTTCCCACTCCGTGGCGATGCTGATCCTCATAGGCTCC

   3300     .
   3112 CTGGAGCTC
        |||||||||
 120569 CTGGAGCTC