seq1 = pF1KB6991.tfa, 663 bp
seq2 = pF1KB6991/gi568815579f_39291360.tfa (gi568815579f:39291360_39497696), 206337 bp

>pF1KB6991 663
>gi568815579f:39291360_39497696 (Chr19)

1-279  (100001-100279)   100% ->
280-338  (101105-101163)   100% ->
339-423  (102194-102278)   100% ->
424-663  (106098-106337)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTGAAAAGCAACGGGGAGAGACGCAGTCGTAACGCACTTCCGGCGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTGAAAAGCAACGGGGAGAGACGCAGTCGTAACGCACTTCCGGCGGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTACGCGAGGAAGATGGCTGCATCCCAGCAGCAAGCTTCAGCGGCTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTACGCGAGGAAGATGGCTGCATCCCAGCAGCAAGCTTCAGCGGCTTCCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CAGCTGCTGGTGTATCGGGTCCTAGTTCGGCTGGCGGCCCGGGTCCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CAGCTGCTGGTGTATCGGGTCCTAGTTCGGCTGGCGGCCCGGGTCCCCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CAGCAGCCGCAACCGCCAGCACAACTGGTGGGCCCTGCCCAGAGCGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CAGCAGCCGCAACCGCCAGCACAACTGGTGGGCCCTGCCCAGAGCGGCCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCTGCAGCAACAGCAACAGGACTTCGATCCTGTGCAGCGTTATAAGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCTGCAGCAACAGCAACAGGACTTCGATCCTGTGCAGCGTTATAAGATGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCATCCCGCAGCTGAAGGAGAGTCTACAG         ACCTTGATGAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100251 TCATCCCGCAGCTGAAGGAGAGTCTACAGGTG...TAGACCTTGATGAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GTTGCGGCCCAAAACTTGATTCAGAACACTAACATCGACAATGGACA   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 101117 GTTGCGGCCCAAAACTTGATTCAGAACACTAACATCGACAATGGACAGTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    339       AAAGAGCAGTGATGGACCCATACAGCGCTTTGACAAGTGCCTGG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101167 ...TAGAAAGAGCAGTGATGGACCCATACAGCGCTTTGACAAGTGCCTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AAGAGTTCTATGCACTCTGTGACCAGCTGGAGCTGTGCCTG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 102238 AAGAGTTCTATGCACTCTGTGACCAGCTGGAGCTGTGCCTGGTA...CAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CGCCTGGCGCATGAGTGCCTGTCACAGAGTTGTGACAGTGCCAAGCACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106098 CGCCTGGCGCATGAGTGCCTGTCACAGAGTTGTGACAGTGCCAAGCACTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TCCAACGTTGGTGCCCACAGCCACCAAGCCCGACGCAGTGCAGCCTGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106148 TCCAACGTTGGTGCCCACAGCCACCAAGCCCGACGCAGTGCAGCCTGACA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GCCTCCCCTACCCACAGTACCTGGCGGTCATCAAAGCCCAGATTTCCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106198 GCCTCCCCTACCCACAGTACCTGGCGGTCATCAAAGCCCAGATTTCCTGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GCCAAGGACATTCACACCGCCCTGCTGGACTGTGCCAACAAGGTCACGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106248 GCCAAGGACATTCACACCGCCCTGCTGGACTGTGCCAACAAGGTCACGGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CAAGACACCCGCACCACCTGCTGGCCCTGGGGGCACTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106298 CAAGACACCCGCACCACCTGCTGGCCCTGGGGGCACTCTG