seq1 = pF1KB6981.tfa, 654 bp
seq2 = pF1KB6981/gi568815579f_34930821.tfa (gi568815579f:34930821_35139698), 208878 bp

>pF1KB6981 654
>gi568815579f:34930821_35139698 (Chr19)

1-40  (100001-100040)   100% ->
41-207  (101708-101874)   99% ->
208-448  (102679-102919)   100% ->
449-590  (108297-108438)   100% ->
591-654  (108815-108878)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGAGGCTGCTGGCCTTAGTGGTCGGCGCGGCACTGG         T
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 100001 ATGGGGAGGCTGCTGGCCTTAGTGGTCGGCGCGGCACTGGGTG...CAGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 GTCCTCAGCCTGCGGGGGCTGTGTGGAGGTGGACTCGGAGACCGAGGCCG
        ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
 101709 GTCCTCAGCCTGCGGGGGCTGCGTGGAGGTGGACTCGGAGACCGAGGCCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGTATGGGATGACCTTCAAAATTCTTTGCATCTCCTGCAAGCGCCGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101759 TGTATGGGATGACCTTCAAAATTCTTTGCATCTCCTGCAAGCGCCGCAGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAGACCAACGCTGAGACCTTCACCGAGTGGACCTTCCGCCAGAAGGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101809 GAGACCAACGCTGAGACCTTCACCGAGTGGACCTTCCGCCAGAAGGGCAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGAGGAGTTTGTCAAG         ATCCTGCGCTATGAGAATGAGGTGT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 101859 TGAGGAGTTTGTCAAGGTG...TAGATCCTGCGCTATGAGAATGAGGTGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TGCAGCTGGAGGAGGATGAGCGCTTCGAGGGCCGCGTGGTGTGGAATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102704 TGCAGCTGGAGGAGGATGAGCGCTTCGAGGGCCGCGTGGTGTGGAATGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AGCCGGGGCACCAAAGACCTGCAGGATCTGTCTATCTTCATCACCAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102754 AGCCGGGGCACCAAAGACCTGCAGGATCTGTCTATCTTCATCACCAATGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CACCTACAACCACTCGGGCGACTACGAGTGCCACGTCTACCGCCTGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102804 CACCTACAACCACTCGGGCGACTACGAGTGCCACGTCTACCGCCTGCTCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TCTTCGAAAACTACGAGCACAACACCAGCGTCGTCAAGAAGATCCACATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102854 TCTTCGAAAACTACGAGCACAACACCAGCGTCGTCAAGAAGATCCACATT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GAGGTAGTGGACAAAG         CCAACAGAGACATGGCATCCATCGT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 102904 GAGGTAGTGGACAAAGGTG...CAGCCAACAGAGACATGGCATCCATCGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GTCTGAGATCATGATGTATGTGCTCATTGTGGTGTTGACCATATGGCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108322 GTCTGAGATCATGATGTATGTGCTCATTGTGGTGTTGACCATATGGCTCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TGGCAGAGATGATTTACTGCTACAAGAAGATCGCTGCCGCCACGGAGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108372 TGGCAGAGATGATTTACTGCTACAAGAAGATCGCTGCCGCCACGGAGACT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GCTGCACAGGAGAATGC         CTCGGAATACCTGGCCATCACCTC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 108422 GCTGCACAGGAGAATGCGTG...CAGCTCGGAATACCTGGCCATCACCTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TGAAAGCAAAGAGAACTGCACGGGCGTCCAGGTGGCCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108839 TGAAAGCAAAGAGAACTGCACGGGCGTCCAGGTGGCCGAA