seq1 = pF1KB6967.tfa, 645 bp
seq2 = pF1KB6967/gi568815577r_32476788.tfa (gi568815577r:32476788_32684304), 207517 bp

>pF1KB6967 645
>gi568815577r:32476788_32684304 (Chr21)

(complement)

1-144  (100001-100144)   100% ->
145-360  (101890-102105)   100% ->
361-498  (105474-105611)   100% ->
499-645  (107382-107528)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTGGCAGGTCAACTCGAGGCCAGGGACCCCAAAGAGGGCACCCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTGGCAGGTCAACTCGAGGCCAGGGACCCCAAAGAGGGCACCCACCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGAGGACCCGTGCCCAGGAGCTGGGGCTGTCATGGAGAAGACAGCTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGAGGACCCGTGCCCAGGAGCTGGGGCTGTCATGGAGAAGACAGCTGTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CAGCCGAGGTTCTCACGGAGGACTGCAACACTGGGGAGATGCCA      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 100101 CAGCCGAGGTTCTCACGGAGGACTGCAACACTGGGGAGATGCCAGTG...

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    145    CCATTACAGCAGCAGATCATCAGACTCCACCAAGAGCTTGGGAGACA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101887 CAGCCATTACAGCAGCAGATCATCAGACTCCACCAAGAGCTTGGGAGACA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GAAGTCTCTGTGGGCTGATGTTCATGGAAAACTCCGGAGTCATATAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101937 GAAGTCTCTGTGGGCTGATGTTCATGGAAAACTCCGGAGTCATATAGATG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CTTTGAGGGAGCAGAACATGGAGCTCCGAGAAAAGCTGAGAGCTCTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101987 CTTTGAGGGAGCAGAACATGGAGCTCCGAGAAAAGCTGAGAGCTCTGCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CTGCAGCGGTGGAAAGCCAGGAAGAAATCTGCAGCGTCCCCACACGCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102037 CTGCAGCGGTGGAAAGCCAGGAAGAAATCTGCAGCGTCCCCACACGCGGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GCAAGAATCGCACACTCTG         GCATTGGAACCTGCTTTTGGAA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 102087 GCAAGAATCGCACACTCTGGTA...TAGGCATTGGAACCTGCTTTTGGAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AAATTTCACCTCTGTCAGCTGATGAAGAGACAATACCCAAATACGCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105496 AAATTTCACCTCTGTCAGCTGATGAAGAGACAATACCCAAATACGCTGGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CACAAGAATCAGAGTGCCACTCTCCTGGGACAAAGATCGTCATCTAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105546 CACAAGAATCAGAGTGCCACTCTCCTGGGACAAAGATCGTCATCTAACAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 TTCAGCTCCTCCAAAG         CCAATGAGTTTAAAGATAGAAAGAA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 105596 TTCAGCTCCTCCAAAGGTG...CAGCCAATGAGTTTAAAGATAGAAAGAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TTAGCTCGTGGAAAACACCACCACAGGAAAATAGAGATAAAAATCTTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107407 TTAGCTCGTGGAAAACACCACCACAGGAAAATAGAGATAAAAATCTTTCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 AGGAGACGTCAAGACAGAAGAGCAACACCTACTGGAAGGCCAACTCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107457 AGGAGACGTCAAGACAGAAGAGCAACACCTACTGGAAGGCCAACTCCCTG

    650     .    :    .    :
    624 TGCAGAGAGACGGGGGGGTGTC
        ||||||||||||||||||||||
 107507 TGCAGAGAGACGGGGGGGTGTC