seq1 = pF1KB6949.tfa, 633 bp
seq2 = pF1KB6949/gi568815581r_7160377.tfa (gi568815581r:7160377_7362043), 201667 bp

>pF1KB6949 633
>gi568815581r:7160377_7362043 (Chr17)

(complement)

1-223  (100001-100223)   100% ->
224-388  (101059-101223)   100% ->
389-473  (101318-101402)   100% ->
474-633  (101508-101667)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCAATTCGGGCCTGCAGTTGCTGGGCTTCTCCATGGCCCTGCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCAATTCGGGCCTGCAGTTGCTGGGCTTCTCCATGGCCCTGCTGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTGGGTGGGTCTGGTGGCCTGCACCGCCATCCCGCAGTGGCAGATGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTGGGTGGGTCTGGTGGCCTGCACCGCCATCCCGCAGTGGCAGATGAGCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCTATGCGGGTGACAACATCATCACGGCCCAGGCCATGTACAAGGGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCTATGCGGGTGACAACATCATCACGGCCCAGGCCATGTACAAGGGGCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TGGATGGACTGCGTCACGCAGAGCACGGGGATGATGAGCTGCAAAATGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TGGATGGACTGCGTCACGCAGAGCACGGGGATGATGAGCTGCAAAATGTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGACTCGGTGCTCGCCCTGTCCG         CGGCCTTGCAGGCCACTC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100201 CGACTCGGTGCTCGCCCTGTCCGGTA...CAGCGGCCTTGCAGGCCACTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GAGCCCTAATGGTGGTCTCCCTGGTGCTGGGCTTCCTGGCCATGTTTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101077 GAGCCCTAATGGTGGTCTCCCTGGTGCTGGGCTTCCTGGCCATGTTTGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GCCACGATGGGCATGAAGTGCACGCGCTGTGGGGGAGACGACAAAGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101127 GCCACGATGGGCATGAAGTGCACGCGCTGTGGGGGAGACGACAAAGTGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GAAGGCCCGTATAGCCATGGGTGGAGGCATAATTTTCATCGTGGCAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 101177 GAAGGCCCGTATAGCCATGGGTGGAGGCATAATTTTCATCGTGGCAGGTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    389       GTCTTGCCGCCTTGGTAGCTTGCTCCTGGTATGGCCATCAGATT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101227 ...CAGGTCTTGCCGCCTTGGTAGCTTGCTCCTGGTATGGCCATCAGATT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GTCACAGACTTTTATAACCCTTTGATCCCTACCAACATTAA         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 101362 GTCACAGACTTTTATAACCCTTTGATCCCTACCAACATTAAGTA...CAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GTATGAGTTTGGCCCTGCCATCTTTATTGGCTGGGCAGGGTCTGCCCTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101508 GTATGAGTTTGGCCCTGCCATCTTTATTGGCTGGGCAGGGTCTGCCCTAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TCATCCTGGGAGGTGCACTGCTCTCCTGTTCCTGTCCTGGGAATGAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101558 TCATCCTGGGAGGTGCACTGCTCTCCTGTTCCTGTCCTGGGAATGAGAGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 AAGGCTGGGTACCGTGCACCCCGCTCTTACCCTAAGTCCAACTCTTCCAA
        |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
 101608 AAGGCTGGGTACCGTGTACCCCGCTCTTACCCTAAGTCCAACTCTTCCAA

    650     .    :
    624 GGAGTATGTG
        ||||||||||
 101658 GGAGTATGTG