seq1 = pF1KB6948.tfa, 645 bp
seq2 = pF1KB6948/gi568815586r_10331120.tfa (gi568815586r:10331120_10551156), 220037 bp

>pF1KB6948 645
>gi568815586r:10331120_10551156 (Chr12)

(complement)

1-187  (100001-100187)   99% ->
188-283  (100578-100673)   100% ->
284-435  (101769-101920)   100% ->
436-536  (103525-103625)   100% ->
537-645  (104495-104603)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATAACCAAGGAGTAATCTACTCAGACCTGAATCTGCCCCCAAACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATAACCAAGGAGTAATCTACTCAGACCTGAATCTGCCCCCAAACCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AAAGAGGCAGCAACGAAAACCTAAAGGCAATAAAAGCTCCATTTTAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
 100051 AAAGAGGCAGCAACGAAAACCTAAAGGCAATAAAAACTCCATTTTAGCAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTGAACAGGAAATAACCTATGCGGAATTAAACCTTCAAAAAGCTTCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTGAACAGGAAATAACCTATGCGGAATTAAACCTTCAAAAAGCTTCTCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GATTTTCAAGGGAATGACAAAACCTATCACTGCAAAG         ATTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100151 GATTTTCAAGGGAATGACAAAACCTATCACTGCAAAGGTA...CAGATTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 ACCATCAGCTCCAGAGAAGCTCATTGTTGGGATCCTGGGAATTATCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100582 ACCATCAGCTCCAGAGAAGCTCATTGTTGGGATCCTGGGAATTATCTGTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TTATCTTAATGGCCTCTGTGGTAACGATAGTTGTTATTCCCT        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 100632 TTATCTTAATGGCCTCTGTGGTAACGATAGTTGTTATTCCCTGTA...TA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    284  CACGTCATTGTGGCCATTGTCCTGAGGAGTGGATTACATATTCCAACAG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101768 GCACGTCATTGTGGCCATTGTCCTGAGGAGTGGATTACATATTCCAACAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TTGTTACTACATTGGTAAGGAAAGAAGAACTTGGGAAGAGAGTTTGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101818 TTGTTACTACATTGGTAAGGAAAGAAGAACTTGGGAAGAGAGTTTGCTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CCTGTACTTCGAAGAACTCCAGTCTGCTTTCTATAGATAATGAAGAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101868 CCTGTACTTCGAAGAACTCCAGTCTGCTTTCTATAGATAATGAAGAAGAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 ATG         AAATTTCTGTCCATCATTTCACCATCCTCATGGATTGG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101918 ATGGTA...TAGAAATTTCTGTCCATCATTTCACCATCCTCATGGATTGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TGTGTTTCGTAACAGCAGTCATCATCCATGGGTGACAATGAATGGTTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103563 TGTGTTTCGTAACAGCAGTCATCATCCATGGGTGACAATGAATGGTTTGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CTTTCAAACATGA         GATAAAAGACTCAGATAATGCTGAACTT
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 103613 CTTTCAAACATGAGTA...CAGGATAAAAGACTCAGATAATGCTGAACTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 AACTGTGCAGTGCTACAAGTAAATCGACTTAAATCAGCCCAGTGTGGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104523 AACTGTGCAGTGCTACAAGTAAATCGACTTAAATCAGCCCAGTGTGGATC

    650     .    :    .    :    .    :
    615 TTCAATAATATATCATTGTAAGCATAAGCTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||
 104573 TTCAATAATATATCATTGTAAGCATAAGCTT