seq1 = pF1KB6932.tfa, 684 bp
seq2 = pF1KB6932/gi568815596f_209902662.tfa (gi568815596f:209902662_210119788), 217127 bp

>pF1KB6932 684
>gi568815596f:209902662_210119788 (Chr2)

1-122  (100001-100122)   100% ->
123-202  (106996-107075)   100% ->
203-342  (113312-113451)   100% ->
343-477  (113846-113980)   100% ->
478-564  (114812-114898)   100% ->
565-684  (117008-117127)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGTCGGGCTGCAAGATTGGCCCGTCCATCCTCAACAGCGACCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGTCGGGCTGCAAGATTGGCCCGTCCATCCTCAACAGCGACCTGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAATTTAGGGGCCGAGTGCCTCCGGATGCTAGACTCTGGGGCCGATTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAATTTAGGGGCCGAGTGCCTCCGGATGCTAGACTCTGGGGCCGATTATC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGCACCTGGACGTAATGGACGG         GCATTTTGTTCCCAACATC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 100101 TGCACCTGGACGTAATGGACGGGTA...TAGGCATTTTGTTCCCAACATC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACCTTTGGTCACCCTGTGGTAGAAAGCCTTCGAAAGCAGCTAGGCCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107015 ACCTTTGGTCACCCTGTGGTAGAAAGCCTTCGAAAGCAGCTAGGCCAGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCCTTTCTTTG         ACATGCACATGATGGTGTCCAAGCCAGAAC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 107065 CCCTTTCTTTGGTA...TAGACATGCACATGATGGTGTCCAAGCCAGAAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGTGGGTAAAGCCAATGGCTGTAGCAGGAGCCAATCAGTACACCTTTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113342 AGTGGGTAAAGCCAATGGCTGTAGCAGGAGCCAATCAGTACACCTTTCAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CTCGAGGCTACTGAGAACCCAGGGGCTTTGATTAAAGACATTCGGGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113392 CTCGAGGCTACTGAGAACCCAGGGGCTTTGATTAAAGACATTCGGGAGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGGGATGAAG         GTTGGCCTTGCCATCAAACCAGGAACCTCAG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 113442 TGGGATGAAGGTA...CAGGTTGGCCTTGCCATCAAACCAGGAACCTCAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TTGAGTATTTGGCACCATGGGCTAATCAGATAGATATGGCCTTGGTTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113877 TTGAGTATTTGGCACCATGGGCTAATCAGATAGATATGGCCTTGGTTATG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ACAGTGGAACCGGGGTTTGGAGGGCAGAAATTCATGGAAGATATGATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113927 ACAGTGGAACCGGGGTTTGGAGGGCAGAAATTCATGGAAGATATGATGCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AAAG         GTTCACTGGTTGAGGACCCAGTTCCCATCTTTGGATA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113977 AAAGGTA...TAGGTTCACTGGTTGAGGACCCAGTTCCCATCTTTGGATA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TAGAGGTCGATGGTGGAGTAGGTCCTGACACTGTCCATAAATGTGCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114849 TAGAGGTCGATGGTGGAGTAGGTCCTGACACTGTCCATAAATGTGCAGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565          GCAGGAGCTAACATGATTGTGTCTGGCAGTGCTATTATGAG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114899 GTG...CAGGCAGGAGCTAACATGATTGTGTCTGGCAGTGCTATTATGAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GAGTGAAGACCCCAGATCTGTGATCAATCTATTAAGAAATGTTTGCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117049 GAGTGAAGACCCCAGATCTGTGATCAATCTATTAAGAAATGTTTGCTCAG

    700     .    :    .    :    .
    656 AAGCTGCTCAGAAACGTTCTCTTGATCGG
        |||||||||||||||||||||||||||||
 117099 AAGCTGCTCAGAAACGTTCTCTTGATCGG