seq1 = pF1KB6927.tfa, 621 bp
seq2 = pF1KB6927/gi568815579f_49014848.tfa (gi568815579f:49014848_49218020), 203173 bp

>pF1KB6927 621
>gi568815579f:49014848_49218020 (Chr19)

1-37  (99558-99594)   100% ->
38-156  (100002-100120)   100% ->
157-228  (100413-100484)   100% ->
229-438  (101416-101625)   100% ->
439-602  (103008-103171)   100% ->
603-621  (103505-103523)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGCGCTGGTGGAGCCGCTGGGGCTGGAGCGGG         ACGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
  99558 ATGGCTGCGCTGGTGGAGCCGCTGGGGCTGGAGCGGGGTA...CAGACGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 GTCCCGGGCGGTTGAGCTCCTCGAGCGGCTCCAGCGCAGCGGGGAGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100006 GTCCCGGGCGGTTGAGCTCCTCGAGCGGCTCCAGCGCAGCGGGGAGCTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CGCCGCAGAAGCTGCAGGCCCTCCAGCGAGTTCTGCAGAGCCGCTTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100056 CGCCGCAGAAGCTGCAGGCCCTCCAGCGAGTTCTGCAGAGCCGCTTCTGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TCCGCTATCCGAGAG         GTGTATGAGCAGCTTTATGACACGCT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 100106 TCCGCTATCCGAGAGGTG...CAGGTGTATGAGCAGCTTTATGACACGCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GGACATCACCGGCAGCGCCGAGATCCGAGCCCATGCCACAGCCAAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 100439 GGACATCACCGGCAGCGCCGAGATCCGAGCCCATGCCACAGCCAAGGTG.

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    229      GCCACAGTGGCTGCCTTCACAGCCAGCGAGGGCCACGCACATCCC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100489 ..CAGGCCACAGTGGCTGCCTTCACAGCCAGCGAGGGCCACGCACATCCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 AGGGTAGTGGAGCTACCCAAGACGGATGAGGGCCTAGGCTTCAACATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101461 AGGGTAGTGGAGCTACCCAAGACGGATGAGGGCCTAGGCTTCAACATCAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GGGTGGCAAAGAGCAAAACTCGCCCATCTACATCTCCCGGGTCATCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101511 GGGTGGCAAAGAGCAAAACTCGCCCATCTACATCTCCCGGGTCATCCCAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GGGGTGTGGCTGACCGCCATGGAGGCCTCAAGCGTGGGGATCAACTGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101561 GGGGTGTGGCTGACCGCCATGGAGGCCTCAAGCGTGGGGATCAACTGTTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TCGGTGAACGGTGTG         AGCGTTGAGGGTGAGCAGCATGAGAA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 101611 TCGGTGAACGGTGTGGTG...CAGAGCGTTGAGGGTGAGCAGCATGAGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GGCGGTGGAGCTGCTGAAGGCGGCCCAGGGCTCGGTGAAGCTGGTTGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103034 GGCGGTGGAGCTGCTGAAGGCGGCCCAGGGCTCGGTGAAGCTGGTTGTCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GTTACACACCGCGAGTGCTGGAGGAGATGGAGGCCCGGTTCGAGAAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103084 GTTACACACCGCGAGTGCTGGAGGAGATGGAGGCCCGGTTCGAGAAGATG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CGCTCTGCCCGCCGGCGCCAACAGCATCAGAGCTACTC         GTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 103134 CGCTCTGCCCGCCGGCGCCAACAGCATCAGAGCTACTCGTG...CAGGTC

    650     .    :    .
    606 CTTGGAGTCTCGAGGT
        ||||||||||||||||
 103508 CTTGGAGTCTCGAGGT