seq1 = pF1KB6923.tfa, 615 bp
seq2 = pF1KB6923/gi568815594r_119960121.tfa (gi568815594r:119960121_120166734), 206614 bp

>pF1KB6923 615
>gi568815594r:119960121_120166734 (Chr4)

(complement)

1-73  (100001-100073)   100% ->
74-220  (100917-101063)   100% ->
221-341  (104640-104760)   100% ->
342-445  (105758-105861)   100% ->
446-615  (106445-106614)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGCTGCAGCTCTCCCGGGAGCAGGGAATCACCCTGCGCGGGAGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGCTGCAGCTCTCCCGGGAGCAGGGAATCACCCTGCGCGGGAGCGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGAAATCGTGGCCGAGTTCTTCT         CATTCGGCATCAACAGCA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100051 CGAAATCGTGGCCGAGTTCTTCTGTA...CAGCATTCGGCATCAACAGCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TTTTATATCAGCGTGGCATATATCCATCTGAAACCTTTACTCGAGTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100935 TTTTATATCAGCGTGGCATATATCCATCTGAAACCTTTACTCGAGTGCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AAATACGGACTCACCTTGCTTGTAACTACTGATCTTGAGCTCATAAAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100985 AAATACGGACTCACCTTGCTTGTAACTACTGATCTTGAGCTCATAAAATA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCTAAATAATGTGGTGGAACAACTGAAAG         ATTGGTTATACA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 101035 CCTAAATAATGTGGTGGAACAACTGAAAGGTA...CAGATTGGTTATACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGTGTTCAGTTCAGAAACTGGTTGTAGTTATCTCAAATATTGAAAGTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104652 AGTGTTCAGTTCAGAAACTGGTTGTAGTTATCTCAAATATTGAAAGTGGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GAGGTCCTGGAAAGATGGCAGTTTGATATTGAGTGTGACAAGACTGCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104702 GAGGTCCTGGAAAGATGGCAGTTTGATATTGAGTGTGACAAGACTGCAAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AGATGACAG         TGCACCCAGAGAAAAGTCTCAGAAAGCTATCC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 104752 AGATGACAGGTA...CAGTGCACCCAGAGAAAAGTCTCAGAAAGCTATCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGGATGAAATCCGTTCAGTGATCAGACAGATCACAGCTACGGTGACATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105790 AGGATGAAATCCGTTCAGTGATCAGACAGATCACAGCTACGGTGACATTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CTGCCACTGTTGGAAGTTTCTT         GTTCATTTGATCTGCTGAT
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 105840 CTGCCACTGTTGGAAGTTTCTTGTA...TAGGTTCATTTGATCTGCTGAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TTATACAGACAAAGATTTGGTTGTACCTGAAAAATGGGAAGAGTCGGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106464 TTATACAGACAAAGATTTGGTTGTACCTGAAAAATGGGAAGAGTCGGGAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CACAGTTTATTACCAATTCTGAGGAAGTCCGCCTTCGTTCATTTACTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106514 CACAGTTTATTACCAATTCTGAGGAAGTCCGCCTTCGTTCATTTACTACT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 ACAATCCACAAAGTAAATAGCATGGTGGCCTACAAAATTCCTGTCAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106564 ACAATCCACAAAGTAAATAGCATGGTGGCCTACAAAATTCCTGTCAATGA

    650 
    615 C
        |
 106614 C