seq1 = pF1KB6918.tfa, 675 bp
seq2 = pF1KB6918/gi568815578f_16631703.tfa (gi568815578f:16631703_16841002), 209300 bp

>pF1KB6918 675
>gi568815578f:16631703_16841002 (Chr20)

1-64  (100001-100064)   100% ->
65-237  (100462-100634)   100% ->
238-378  (105559-105699)   99% ->
379-429  (107150-107200)   100% ->
430-518  (108623-108711)   100% ->
519-675  (109144-109300)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATATCAGACCAAATCATACAATTTATATCAACAATATGAATGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATATCAGACCAAATCATACAATTTATATCAACAATATGAATGACAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AATTAAAAAGGAAG         AATTGAAGAGATCCCTATATGCCCTGT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 100051 AATTAAAAAGGAAGGTA...CAGAATTGAAGAGATCCCTATATGCCCTGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TTTCTCAGTTTGGTCATGTGGTGGACATTGTGGCTTTAAAGACCATGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100489 TTTCTCAGTTTGGTCATGTGGTGGACATTGTGGCTTTAAAGACCATGAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATGAGGGGGCAGGCCTTTGTCATATTTAAGGAACTGGGCTCATCCACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100539 ATGAGGGGGCAGGCCTTTGTCATATTTAAGGAACTGGGCTCATCCACAAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGCCTTGAGACAGCTACAAGGATTTCCATTTTATGGTAAACCAATG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 100589 TGCCTTGAGACAGCTACAAGGATTTCCATTTTATGGTAAACCAATGGTA.

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    238      CGAATACAGTATGCAAAAACAGATTCGGATATAATATCAAAAATG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100639 ..CAGCGAATACAGTATGCAAAAACAGATTCGGATATAATATCAAAAATG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CGTGGAACTTTTGCTGACAAAGAAAAGAAAAAAGAAAAGAAAAAAGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105604 CGTGGAACTTTTGCTGACAAAGAAAAGAAAAAAGAAAAGAAAAAAGCCAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AACTGTGGAACAGACTGCAACAACCACAAACAAAAAGTCTGGCCAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||>>>.
 105654 AACTGTGGAACAGACTGCAACAACCACAAACAAAAAGCCTGGCCAGGTA.

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    379      GGAACTCCAAATTCAGCTAATACCCAAGGAAATTCAACACCAAAT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105704 ..TAGGGAACTCCAAATTCAGCTAATACCCAAGGAAATTCAACACCAAAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CCTCAG         GTCCCTGATTACCCTCCAAACTATATTTTATTCCT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107195 CCTCAGGTA...TAGGTCCCTGATTACCCTCCAAACTATATTTTATTCCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TAATAACTTACCAGAAGAGACTAATGAGATGATGTTATCCATGCTGTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108658 TAATAACTTACCAGAAGAGACTAATGAGATGATGTTATCCATGCTGTTTA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ATCA         GTTCCCTGGCTTCAAGGAAGTACGTCTGGTACCAGGG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108708 ATCAGTA...TAGGTTCCCTGGCTTCAAGGAAGTACGTCTGGTACCAGGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 AGGCATGACATTGCTTTTGTTGAATTTGAAAATGATGGGCAGGCTGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109181 AGGCATGACATTGCTTTTGTTGAATTTGAAAATGATGGGCAGGCTGGAGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TGCCAGGGATGCTTTACAGGGATTTAAGATCACACCGTCCCATGCTATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109231 TGCCAGGGATGCTTTACAGGGATTTAAGATCACACCGTCCCATGCTATGA

    700     .    :    .    :
    656 AGATCACCTATGCCAAGAAA
        ||||||||||||||||||||
 109281 AGATCACCTATGCCAAGAAA