seq1 = pF1KB6895.tfa, 552 bp
seq2 = pF1KB6895/gi568815588f_47606203.tfa (gi568815588f:47606203_47806755), 200553 bp

>pF1KB6895 552
>gi568815588f:47606203_47806755 (Chr10)

1-552  (100001-100553)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCGCAGTCCAAGTCCCGGAAGATCGCGATCCTGGGCTACCGGTCTGT
        ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCGCAGTCAAAGTCCCGGAAGATCGCGATCCTGGGCTACCGGTCTGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGGGAAATCCTCATTGACGATTCAATTTGTTGAAGGCCAATTTGTGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGGGAAATCCTCATTGACGATTCAATTTGTTGAAGGCCAATTTGTGGACT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCTACGATCCAACCATAGAAAACACTTTTACAAAGTTGATCACAGTAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCTACGATCCAACCATAGAAAACACTTTTACAAAGTTGATCACAGTAAAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGACAAGAATATCATCTTCAACTTGTAGACACAGCCGGGCAAGATGAATA
        |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGACAAGAATATCATCTTTAACTTGTAGACACAGCCGGGCAAGATGAATA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TTCTATCTTTCCTCAGACATACTCCATAGATATTAATGGCTATATTCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TTCTATCTTTCCTCAGACATACTCCATAGATATTAATGGCTATATTCTTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGTATTCTGTTACATCAATCAAAAGTTTTGAAGTGATTAAAGTTATCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGTATTCTGTTACATCAATCAAAAGTTTTGAAGTGATTAAAGTTATCCAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGCAAATTGTTGGATATGGTGGGGAAAGTACAAATACCTATTATGTTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGCAAATTGTTGGATATGGTGGGGAAAGTACAAATACCTATTATGTTGGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGGGAATAAGAAAGACCTGCATATGGAAAGGGTGATCAGTTATGAAGAAG
        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TGGAAATAAGAAAGACCTGCATATGGAAAGGGTGATCAGTTATGAAGAAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GGAAAGCTTTGGCAGAATCTTGGAATGCAGCTTTTTTGGAATCTTCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GGAAAGCTTTGGCAGAATCTTGGAATGCAGCTTTTTTGGAATCTTCTGCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AAAGAAAATCAGACTGCTGTGGATGTTTTTCGAAGGATAATTTTGGAGGC
        |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||
 100451 AAAGAAAATCAGACTGCTGTTGATGTTTTTCGAAGGATGATTTTGGAGGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 AGAAAAAATGGACGGGG CAGCTTCACAAGGCAAGTCTTCATGCTCGGTG
        |||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 AGAAAAAATGGACGGGGGCAGCTTCACAAGGCAAGTCTTCATGCTCGGTG

    550 
    550 ATG
        |||
 100551 ATG