seq1 = pF1KB6894.tfa, 606 bp
seq2 = pF1KB6894/gi568815576r_30143654.tfa (gi568815576r:30143654_30344936), 201283 bp

>pF1KB6894 606
>gi568815576r:30143654_30344936 (Chr22)

(complement)

1-19  (98242-98260)   100% ->
20-198  (100004-100182)   100% ->
199-606  (100876-101283)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGGTCTTGGCGGCAG         GAGTTGTGCCCCTGCTGTTGGT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
  98242 ATGAAGGTCTTGGCGGCAGGTA...CAGGAGTTGTGCCCCTGCTGTTGGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 TCTGCACTGGAAACATGGGGCGGGGAGCCCCCTCCCCATCACCCCTGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100026 TCTGCACTGGAAACATGGGGCGGGGAGCCCCCTCCCCATCACCCCTGTCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ACGCCACCTGTGCCATACGCCACCCATGTCACAACAACCTCATGAACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100076 ACGCCACCTGTGCCATACGCCACCCATGTCACAACAACCTCATGAACCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATCAGGAGCCAACTGGCACAGCTCAATGGCAGTGCCAATGCCCTCTTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100126 ATCAGGAGCCAACTGGCACAGCTCAATGGCAGTGCCAATGCCCTCTTTAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TCTCTAT         TACACAGCCCAGGGGGAGCCGTTCCCCAACAACC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100176 TCTCTATGTA...CAGTACACAGCCCAGGGGGAGCCGTTCCCCAACAACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TGGACAAGCTATGTGGCCCCAACGTGACGGACTTCCCGCCCTTCCACGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100910 TGGACAAGCTATGTGGCCCCAACGTGACGGACTTCCCGCCCTTCCACGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AACGGCACGGAGAAGGCCAAGCTGGTGGAGCTGTACCGCATAGTCGTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100960 AACGGCACGGAGAAGGCCAAGCTGGTGGAGCTGTACCGCATAGTCGTGTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CCTTGGCACCTCCCTGGGCAACATCACCCGGGACCAGAAGATCCTCAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101010 CCTTGGCACCTCCCTGGGCAACATCACCCGGGACCAGAAGATCCTCAACC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CCAGTGCCCTCAGCCTCCACAGCAAGCTCAACGCCACCGCCGACATCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101060 CCAGTGCCCTCAGCCTCCACAGCAAGCTCAACGCCACCGCCGACATCCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CGAGGCCTCCTTAGCAACGTGCTGTGCCGCCTGTGCAGCAAGTACCACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101110 CGAGGCCTCCTTAGCAACGTGCTGTGCCGCCTGTGCAGCAAGTACCACGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GGGCCATGTGGACGTGACCTACGGCCCTGACACCTCGGGTAAGGATGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101160 GGGCCATGTGGACGTGACCTACGGCCCTGACACCTCGGGTAAGGATGTCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TCCAGAAGAAGAAGCTGGGCTGTCAACTCCTGGGGAAGTATAAGCAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101210 TCCAGAAGAAGAAGCTGGGCTGTCAACTCCTGGGGAAGTATAAGCAGATC

    600     .    :    .    :
    583 ATCGCCGTGTTGGCCCAGGCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||
 101260 ATCGCCGTGTTGGCCCAGGCCTTC