seq1 = pF1KB6860.tfa, 561 bp
seq2 = pF1KB6860/gi568815582f_297223.tfa (gi568815582f:297223_500339), 203117 bp

>pF1KB6860 561
>gi568815582f:297223_500339 (Chr16)

1-91  (100001-100091)   100% ->
92-225  (101768-101901)   100% ->
226-327  (102157-102258)   100% ->
328-440  (102405-102517)   99% ->
441-561  (102997-103117)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCGGCCTCTTCTGGCGCTCCGCGCTGCGGGGGCTGCGCTGCGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGCGGCCTCTTCTGGCGCTCCGCGCTGCGGGGGCTGCGCTGCGGCCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCGGGCCCCGGGCCCGAGCCTGCTAGTGCGCCACGGCTCGG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 100051 GCGGGCCCCGGGCCCGAGCCTGCTAGTGCGCCACGGCTCGGGTG...AAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GAGGGCCCTCCTGGACCCGGGAGCGGACCCTGGTGGCGGTGAAGCCCGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101768 GAGGGCCCTCCTGGACCCGGGAGCGGACCCTGGTGGCGGTGAAGCCCGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGCGTGCAACGGCGGCTCGTTGGGGACGTGATCCAGCGCTTTGAGAGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101818 GGCGTGCAACGGCGGCTCGTTGGGGACGTGATCCAGCGCTTTGAGAGGCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGGCTTCACGCTGGTGGGGATGAAGATGCTGCAG         GCACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 101868 GGGCTTCACGCTGGTGGGGATGAAGATGCTGCAGGTA...CAGGCACCAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGAGCGTCCTTGCCGAGCACTACCAGGACCTGCGGAGGAAGCCCTTCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102164 AGAGCGTCCTTGCCGAGCACTACCAGGACCTGCGGAGGAAGCCCTTCTAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CCTGCCCTCATCCGCTACATGAGCTCTGGGCCTGTGGTGGCCATG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 102214 CCTGCCCTCATCCGCTACATGAGCTCTGGGCCTGTGGTGGCCATGGTA..

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    328     GTCTGGGAAGGGTACAATGTCGTCCGCGCCTCAAGGGCCATGATTG
        .>>>|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
 102264 .CAGGTCTGGGAAGGGTACAATGTCGTCCGCGCCTCGAGGGCCATGATTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GACACACCGACTCGGCTGAGGCTGCCCCAGGAACCATAAGGGGTGACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102451 GACACACCGACTCGGCTGAGGCTGCCCCAGGAACCATAAGGGGTGACTTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AGCGTCCACATCAGCAG         GAATGTCATCCACGCCAGCGACTC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 102501 AGCGTCCACATCAGCAGGTA...CAGGAATGTCATCCACGCCAGCGACTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CGTGGAGGGGGCCCAGCGGGAGATCCAGCTGTGGTTCCAGAGCAGTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103021 CGTGGAGGGGGCCCAGCGGGAGATCCAGCTGTGGTTCCAGAGCAGTGAGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    515 TGGTGAGCTGGGCAGATGGGGGCCAGCACAGCAGCATCCACCCAGCC
        |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
 103071 TGGTGAGCTGGGCAGACGGGGGCCAGCACAGCAGCATCCACCCAGCC