seq1 = pF1KB6856.tfa, 582 bp
seq2 = pF1KB6856/gi568815581f_28367822.tfa (gi568815581f:28367822_28568403), 200582 bp

>pF1KB6856 582
>gi568815581f:28367822_28568403 (Chr17)

1-582  (100001-100582)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTCAGTTCGAGCGCCAAGATCGTGAAGCCCAATGGCGAGAAGCCGGA
        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTCAGTTCGAGCGCCAAGATTGTGAAGCCCAATGGCGAGAAGCCGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGAGTTCGAGTCCGGCATCTCCCAGGCTCTTCTGGAGCTGGAGATGAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGAGTTCGAGTCCGGCATCTCCCAGGCTCTTCTGGAGCTGGAGATGAACT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGGACCTCAAGGCTCAGCTCAGGGAGCTGAATATTACGGCAGCTAAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGGACCTCAAGGCTCAGCTCAGGGAGCTGAATATTACGGCAGCTAAGGAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATTGAAGTTGGTGGTGGTCGGAAAGCTATCATAATCTTTGTTCCCGTTCC
        ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATTGAAGTTGGTGGTGGTCAGAAAGCTATCATAATCTTTGTTCCCGTTCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TCAACTGAAATCTTTCCAGAAAATCCAAGTCCGGCTAGTACGCGAATTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TCAACTGAAATCTTTCCAGAAAATCCAAGTCCGGCTAGTACGCGAATTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGAAAAAGTTCAGTGGGAAGCATGTCGTCTTTATCGCTCAGAGGAGAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGAAAAAGTTCAGTGGGAAGCATGTCGTCTTTATCGCTCAGAGGAGAATT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGCCTAAGCCAACTCGAAAAAGCCGTACAAAAAATAAGCAAAAGCGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTGCCTAAGCCAACTCGAAAAAGCCGTACAAAAAATAAGCAAAAGCGTCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CAGGAGCCGTACTCTGACAGCTGTGCACGATGCCATCCTTGAGGACTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
 100351 CAGGAGCCGTACTCTGACAGCTGTGCACGATGCCATCCTCGAGGACTTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCTTCCCAAGCGAAATTGTGGGCAAGAGAATCCGCGTCAAACTAGATGGC
        ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TCTTCCCAAGCGAAATTGTGGTCAAGAGAATCCGCGTCAAACTAGATGGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AGCCGGCTCATAAAGGTTCATTTGGACAAAGCACAGCAGAACAATGTGGA
        |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AGCCGGCTCATAAAGGCTCATTTGGACAAAGCACAGCAGAACAATGTGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 ACACAAGGTTGAAACTTTTTCTGGTGTCTATAAGAAGCTCACGGGCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 ACACAAGGTTGAAACTTTTTCTGGTGTCTATAAGAAGCTCACGGGCAAGG

    550     .    :    .    :    .    :
    551 ATGTTAATTTTGAATTCCCAGAGTTTCAATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ATGTTAATTTTGAATTCCCAGAGTTTCAATTG