seq1 = pF1KB6854.tfa, 582 bp
seq2 = pF1KB6854/gi568815576f_40964052.tfa (gi568815576f:40964052_41164633), 200582 bp

>pF1KB6854 582
>gi568815576f:40964052_41164633 (Chr22)

1-582  (100001-100582)   97%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCAGTGGCCCGGAGCTGGGTTTGTCGCAAAACTTATGTGACCCCGCG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
 100001 ATGCCAGTGGCCCGGAGCTGGGTTTGTCGCAAAACTTACGTGACCCCGCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAGACCCTTCGAGAAATCTCGTCTCGACCAAGAGCTGAAGCTGATCGGCG
        |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |
 100051 GAGATCCTTTGAGAAATCTCGTCTCGACCAAGAGCTGAAGCTGATCGAAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGTATGGGCTCCGGAACAAACGTGAGGTCTGGAGGGTCAAATTTACCCTG
        |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGTATGGGCTCCGGAATAAACGTGAGGTCTGGAGGGTCAAATTTACCCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCCAAGATCCGCAAGGCCGCCCGGGAACTGCTGACGCTTGATGAGAAGGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
 100151 GCCAAGATCCGCAAGGCCGCCCGGGAACTGCTGACGCTTGATCAGAAGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCCACGGCGTCTGTTCGAAGGCAACGCCCTGCTGCGGCGGCTGGTCCGCA
        |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||
 100201 CCCACGGCGTCTGTTCGAAGGCAATGCCCTGCTGTGGCGGCTGGTCTGCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TTGGGGTGCTGGATGAGGGCAAGATGAAGCTGGATTACATCCTGGGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TTGGGGTGCTGGATGAGGGCAAGATGAAGCTGGATTACATCCTGGGCCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AAGATAGAGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
 100301 AAGATAGAGGATTTCTTAGAGAGACGCCTACAGACCCAGGTCTTCAAGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGGCTTGGCCAAGTCCATCCACCACGCTCGCGTGCTGATCCGCCAGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGGCTTGGCCAAGTCCATCCACCACGCTCGCGTGCTGATCCGCCAGCGCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ATATCAGGGTCCGCAAGCAGGTGGTGAACATCCCGTCCTTCATTGTCCGC
        || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ATTTCAGGGTCCGCAAGCAGGTGGTGAACATCCCGTCCTTCATTGTCCGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CTGGATTCCCAGAAGCACATCGACTTCTCTCTGCGCTCTCCCTACGGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||
 100451 CTGGATTCCCAGAAGCACATCGACTTCTCTCTGTGCTCTCCCTATGGGGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TGGCCGCCCGGGCCGCGTGAAGAGGAAGAATGCCAAGAAGGGCCAGGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TGGCCGCCCGGGCCGCGTGAAGAGGAAGAATGCCAAGAAGGGCCAGGGTG

    550     .    :    .    :    .    :
    551 GGGCTGGGGCTGGAGACGACGAGGAGGAGGAT
        ||||||||||||||||| || |||||||||||
 100551 GGGCTGGGGCTGGAGACCACAAGGAGGAGGAT