seq1 = pF1KB6840.tfa, 573 bp
seq2 = pF1KB6840/gi568815593r_170278707.tfa (gi568815593r:170278707_170485447), 206741 bp

>pF1KB6840 573
>gi568815593r:170278707_170485447 (Chr5)

(complement)

1-134  (100001-100134)   100% ->
135-306  (101598-101769)   100% ->
307-573  (106475-106741)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTGAAGAAGCTGGTGATGGCCCAGAAGCGGGGAGAGACACGAGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTGAAGAAGCTGGTGATGGCCCAGAAGCGGGGAGAGACACGAGCCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTGCCTGGGTGTAACCATGGTGGTGTGTGCCGTCATCACCTACTACATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTGCCTGGGTGTAACCATGGTGGTGTGTGCCGTCATCACCTACTACATCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGGTCACGACTGTGCTGCCCCTCTACCAGAAAAG         CGTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 100101 TGGTCACGACTGTGCTGCCCCTCTACCAGAAAAGGTA...CAGCGTGTGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACCCAGGAATCCAAGTGCCACCTGATTGAGACCAACATCAGGGACCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101605 ACCCAGGAATCCAAGTGCCACCTGATTGAGACCAACATCAGGGACCAGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGAGCTGAAGGGCAAGAAGGTGCCCCAGTACCCATGCCTGTGGGTCAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101655 GGAGCTGAAGGGCAAGAAGGTGCCCCAGTACCCATGCCTGTGGGTCAACG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGTCAGCTGCCGGCAGGTGGGCTGTGCTGTACCACACGGAGGACACTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101705 TGTCAGCTGCCGGCAGGTGGGCTGTGCTGTACCACACGGAGGACACTCGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GACCAGAACCAGCAG         TGCTCCTACATCCCAGGCAGCGTGGA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 101755 GACCAGAACCAGCAGGTA...CAGTGCTCCTACATCCCAGGCAGCGTGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CAATTACCAGACGGCCCGGGCCGACGTGGAGAAGGTCAGAGCCAAATTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106501 CAATTACCAGACGGCCCGGGCCGACGTGGAGAAGGTCAGAGCCAAATTCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AAGAGCAGCAGGTCTTCTACTGCTTCTCCGCACCTCGGGGGAACGAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106551 AAGAGCAGCAGGTCTTCTACTGCTTCTCCGCACCTCGGGGGAACGAAACC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AGCGTCCTATTCCAGCGCCTCTACGGGCCCCAGGCCCTCCTCTTCTCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106601 AGCGTCCTATTCCAGCGCCTCTACGGGCCCCAGGCCCTCCTCTTCTCCCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CTTCTGGCCCACCTTCCTGCTGACCGGTGGCCTCCTCATTATCGCCATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106651 CTTCTGGCCCACCTTCCTGCTGACCGGTGGCCTCCTCATTATCGCCATGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TGAAGAGCAACCAGTACCTGTCCATCCTGGCGGCCCAGAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106701 TGAAGAGCAACCAGTACCTGTCCATCCTGGCGGCCCAGAAG