seq1 = pF1KB6834.tfa, 567 bp
seq2 = pF1KB6834/gi568815587r_432639.tfa (gi568815587r:432639_634322), 201684 bp

>pF1KB6834 567
>gi568815587r:432639_634322 (Chr11)

(complement)

1-111  (100001-100111)   99% ->
112-290  (100379-100557)   100% ->
291-450  (100711-100870)   100% ->
451-567  (101568-101684)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACGGAATATAAGCTGGTGGTGGTGGGCGCCGGCGGTGTGGGCAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACGGAATATAAGCTGGTGGTGGTGGGCGCCGGCGGTGTGGGCAAGAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGCGCTGACCATCCAGCTGATCCAGAACCACTTTGTGGACGAATACGACC
        |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
 100051 TGCGCTGACCATCCAGCTGATCCAGAACCATTTTGTGGACGAATACGACC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCACTATAGAG         GATTCCTACCGGAAGCAGGTGGTCATTGAT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCACTATAGAGGTG...CAGGATTCCTACCGGAAGCAGGTGGTCATTGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGGGAGACGTGCCTGTTGGACATCCTGGATACCGCCGGCCAGGAGGAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100409 GGGGAGACGTGCCTGTTGGACATCCTGGATACCGCCGGCCAGGAGGAGTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CAGCGCCATGCGGGACCAGTACATGCGCACCGGGGAGGGCTTCCTGTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100459 CAGCGCCATGCGGGACCAGTACATGCGCACCGGGGAGGGCTTCCTGTGTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGTTTGCCATCAACAACACCAAGTCTTTTGAGGACATCCACCAGTACAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 100509 TGTTTGCCATCAACAACACCAAGTCTTTTGAGGACATCCACCAGTACAGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    291         GGAGCAGATCAAACGGGTGAAGGACTCGGATGACGTGCCCAT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100559 TG...CAGGGAGCAGATCAAACGGGTGAAGGACTCGGATGACGTGCCCAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GGTGCTGGTGGGGAACAAGTGTGACCTGGCTGCACGCACTGTGGAATCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100753 GGTGCTGGTGGGGAACAAGTGTGACCTGGCTGCACGCACTGTGGAATCTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GGCAGGCTCAGGACCTCGCCCGAAGCTACGGCATCCCCTACATCGAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100803 GGCAGGCTCAGGACCTCGCCCGAAGCTACGGCATCCCCTACATCGAGACC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TCGGCCAAGACCCGGCAG         GGAGTGGAGGATGCCTTCTACAC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 100853 TCGGCCAAGACCCGGCAGGTG...CAGGGAGTGGAGGATGCCTTCTACAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GTTGGTGCGTGAGATCCGGCAGCACAAGCTGCGGAAGCTGAACCCTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101591 GTTGGTGCGTGAGATCCGGCAGCACAAGCTGCGGAAGCTGAACCCTCCTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :
    524 ATGAGAGTGGCCCCGGCTGCATGAGCTGCAAGTGTGTGCTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101641 ATGAGAGTGGCCCCGGCTGCATGAGCTGCAAGTGTGTGCTCTCC