seq1 = pF1KB6822.tfa, 558 bp
seq2 = pF1KB6822/gi568815589r_34513785.tfa (gi568815589r:34513785_34720464), 206680 bp

>pF1KB6822 558
>gi568815589r:34513785_34720464 (Chr9)

(complement)

1-96  (100001-100096)   100% ->
97-181  (101705-101789)   100% ->
182-268  (102494-102580)   100% ->
269-352  (104352-104435)   100% ->
353-411  (105697-105755)   100% ->
412-471  (106364-106423)   100% ->
472-558  (106594-106680)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGGTCTGACTGACTTGCAGCGGCTACAGGCCCGAGTGGAAGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGGTCTGACTGACTTGCAGCGGCTACAGGCCCGAGTGGAAGAGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAGCGCTGGGTGTACGGGCCGGGCGGGGCGCGCGGCTCACGGAAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 100051 GGAGCGCTGGGTGTACGGGCCGGGCGGGGCGCGCGGCTCACGGAAGGTG.

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     97      GTGGCTGACGGCCTGGTCAAGGTGCAGGTGGCTTTGGGGAACATT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ..CAGGTGGCTGACGGCCTGGTCAAGGTGCAGGTGGCTTTGGGGAACATT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TCCAGCAAGAGGGAGAGGGTGAAGATTCTCTACAAAAAGA         T
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 101750 TCCAGCAAGAGGGAGAGGGTGAAGATTCTCTACAAAAAGAGTA...TAGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TGAAGATCTGATCAAGTACCTGGATCCTGAGTACATCGACCGCATTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102495 TGAAGATCTGATCAAGTACCTGGATCCTGAGTACATCGACCGCATTGCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TACCTGATGCCTCTAAGCTGCAATTCATCCTAGCAG         AGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 102545 TACCTGATGCCTCTAAGCTGCAATTCATCCTAGCAGGTA...TAGAGGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 CAGTTTATCCTTTCCCAGGTTGCACTCCTGGAGCAGGTGAATGCCTTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104357 CAGTTTATCCTTTCCCAGGTTGCACTCCTGGAGCAGGTGAATGCCTTGGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GCCCATGCTGGACAGTGCTCACATCAAAG         CCGTTCCTGAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 104407 GCCCATGCTGGACAGTGCTCACATCAAAGGTA...CAGCCGTTCCTGAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 ATGCTGCCCGCCTGCAGCGCTTGGCCCAGATCCACATTCAGCAGCAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 105709 ATGCTGCCCGCCTGCAGCGCTTGGCCCAGATCCACATTCAGCAGCAGGTA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    412       GACCAGTGTGTGGAAATCACTGAGGAGTCCAAGGCTCTCCTGGA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105759 ...CAGGACCAGTGTGTGGAAATCACTGAGGAGTCCAAGGCTCTCCTGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 GGAATACAACAAGACT         ACAATGCTTCTCTCCAAGCAATTCG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 106408 GGAATACAACAAGACTGTA...CAGACAATGCTTCTCTCCAAGCAATTCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    497 TGCAGTGGGATGAGCTACTTTGCCAGCTAGAGGCCGCCACGCAAGTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106619 TGCAGTGGGATGAGCTACTTTGCCAGCTAGAGGCCGCCACGCAAGTGAAG

    600     .    :
    547 CCAGCAGAGGAG
        ||||||||||||
 106669 CCAGCAGAGGAG