seq1 = pF1KB6819.tfa, 486 bp
seq2 = pF1KB6819/gi568815594f_141620468.tfa (gi568815594f:141620468_141832845), 212378 bp

>pF1KB6819 486
>gi568815594f:141620468_141832845 (Chr4)

8-110  (99996-100099)   99% ->
111-195  (101457-101541)   100% ->
196-240  (107473-107517)   100% ->
241-378  (109380-109517)   100% ->
379-486  (112271-112378)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      8 TTTC GAAACCACATTTGAGAAGTATTTCCATCCAGTGCTACTTGTGTTT
        ||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99996 TTTCAGAAACCACATTTGAGAAGTATTTCCATCCAGTGCTACTTGTGTTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     57 ACTTCTAAACAGTCATTTTCTAACTGAAGCTGGCATTCATGTCTTCATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100046 ACTTCTAAACAGTCATTTTCTAACTGAAGCTGGCATTCATGTCTTCATTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    107 TGGG         CTGTTTCAGTGCAGGGCTTCCTAAAACAGAAGCCAAC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100096 TGGGGTA...CAGCTGTTTCAGTGCAGGGCTTCCTAAAACAGAAGCCAAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    148 TGGGTGAATGTAATAAGTGATTTGAAAAAAATTGAAGATCTTATTCAA  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 101494 TGGGTGAATGTAATAAGTGATTTGAAAAAAATTGAAGATCTTATTCAAGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    196        TCTATGCATATTGATGCTACTTTATATACGGAAAGTGATGTTC
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101544 G...CAGTCTATGCATATTGATGCTACTTTATATACGGAAAGTGATGTTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    239 AC         CCCAGTTGCAAAGTAACAGCAATGAAGTGCTTTCTCTTG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107516 ACGTG...TAGCCCAGTTGCAAAGTAACAGCAATGAAGTGCTTTCTCTTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    280 GAGTTACAAGTTATTTCACTTGAGTCCGGAGATGCAAGTATTCATGATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109419 GAGTTACAAGTTATTTCACTTGAGTCCGGAGATGCAAGTATTCATGATAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    330 AGTAGAAAATCTGATCATCCTAGCAAACAACAGTTTGTCTTCTAATGGG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 109469 AGTAGAAAATCTGATCATCCTAGCAAACAACAGTTTGTCTTCTAATGGGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    379         AATGTAACAGAATCTGGATGCAAAGAATGTGAGGAACTGGAG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109519 TG...CAGAATGTAACAGAATCTGGATGCAAAGAATGTGAGGAACTGGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    421 GAAAAAAATATTAAAGAATTTTTGCAGAGTTTTGTACATATTGTCCAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112313 GAAAAAAATATTAAAGAATTTTTGCAGAGTTTTGTACATATTGTCCAAAT

    500     .    :    .
    471 GTTCATCAACACTTCT
        ||||||||||||||||
 112363 GTTCATCAACACTTCT