seq1 = pF1KB6818.tfa, 558 bp
seq2 = pF1KB6818/gi568815578r_18389767.tfa (gi568815578r:18389767_18597167), 207401 bp

>pF1KB6818 558
>gi568815578r:18389767_18597167 (Chr20)

(complement)

1-99  (100001-100099)   100% ->
100-142  (101288-101330)   100% ->
143-248  (103105-103210)   100% ->
249-334  (106688-106773)   100% ->
335-558  (107178-107401)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTTCTCCTAGCAAGGCAGTGATTGTTCCCGGGAACGGAGGCGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTTCTCCTAGCAAGGCAGTGATTGTTCCCGGGAACGGAGGCGGGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGTGACCACCCACGGCTGGTATGGCTGGGTGAAAAAGGAGCTGGAGAAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 100051 TGTGACCACCCACGGCTGGTATGGCTGGGTGAAAAAGGAGCTGGAGAAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    100         ATACCTGGTTTCCAGTGTTTGGCTAAAAACATGCCCGACCCA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TA...TAGATACCTGGTTTCCAGTGTTTGGCTAAAAACATGCCCGACCCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 A         TTACAGCACGAGAGAGCATCTGGCTGCCCTTCATGGAGAC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101330 AGTA...AAGTTACAGCACGAGAGAGCATCTGGCTGCCCTTCATGGAGAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 AGAGCTGCACTGTGATGAGAAGACTATCATCATTGGCCACAGTTCTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103145 AGAGCTGCACTGTGATGAGAAGACTATCATCATTGGCCACAGTTCTGGGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CCATCGCGGCCATGAG         GTATGCAGAAACACATCGAGTATAT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 103195 CCATCGCGGCCATGAGGTG...CAGGTATGCAGAAACACATCGAGTATAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GCTATTGTATTAGTGTCTGCGTACACATCAGACTTGGGGGATGAAAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106713 GCTATTGTATTAGTGTCTGCGTACACATCAGACTTGGGGGATGAAAATGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GCGTGCAAGTG         GATACTTCACCCGCCCCTGGCAGTGGGAGA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 106763 GCGTGCAAGTGGTA...TAGGATACTTCACCCGCCCCTGGCAGTGGGAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 AGATCAAGGCCAACTGCCCTTACATTGTGCAGTTTGGCTCTACTGACGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107208 AGATCAAGGCCAACTGCCCTTACATTGTGCAGTTTGGCTCTACTGACGAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 CCGTTCCTTCCCTGGAAGGAACAACAAGAAGTGGCCGATAGGTTGGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107258 CCGTTCCTTCCCTGGAAGGAACAACAAGAAGTGGCCGATAGGTTGGAAAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CAAATTGCACAAATTCACTGACTGTGGCCACTTTCAGAACACAGAGTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107308 CAAATTGCACAAATTCACTGACTGTGGCCACTTTCAGAACACAGAGTTTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ATGAACTGATTACTGTTGTAAAGTCTTTGCTGAAAGTACCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107358 ATGAACTGATTACTGTTGTAAAGTCTTTGCTGAAAGTACCAGCA