seq1 = pF1KB6807.tfa, 477 bp
seq2 = pF1KB6807/gi568815595r_51893752.tfa (gi568815595r:51893752_52095461), 201710 bp

>pF1KB6807 477
>gi568815595r:51893752_52095461 (Chr3)

(complement)

1-37  (100001-100037)   100% ->
38-102  (100356-100420)   100% ->
103-477  (101336-101710)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCAAGTCCAAGAACCACACCACACACAACCAGT         CCCG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100001 ATGGCCAAGTCCAAGAACCACACCACACACAACCAGTGTA...CAGCCCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 AAAATGGCACAGAAATGGTATCAAGAAACCCCGATCACAAAGATACGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100360 AAAATGGCACAGAAATGGTATCAAGAAACCCCGATCACAAAGATACGAAT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CTCTTAAGGGG         GTGGACCCCAAGTTCCTGAGGAACATGCGC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 100410 CTCTTAAGGGGGTG...CAGGTGGACCCCAAGTTCCTGAGGAACATGCGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 TTTGCCAAGAAGCACAACAAAAAGGGCCTAAAGAAGATGCAGGCCAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101366 TTTGCCAAGAAGCACAACAAAAAGGGCCTAAAGAAGATGCAGGCCAACAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TGCCAAGGCCATGAGTGCACGTGCCGAGGCTATCAAGGCCCTCGTAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101416 TGCCAAGGCCATGAGTGCACGTGCCGAGGCTATCAAGGCCCTCGTAAAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CCAAGGAGGTTAAGCCCAAGATCCCAAAGGGTGTCAGCCGCAAGCTCGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101466 CCAAGGAGGTTAAGCCCAAGATCCCAAAGGGTGTCAGCCGCAAGCTCGAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CGACTTGCCTACATTGCCCACCCCAAGCTTGGGAAGCGTGCTCGTGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101516 CGACTTGCCTACATTGCCCACCCCAAGCTTGGGAAGCGTGCTCGTGCCCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TATTGCCAAGGGGCTCAGGCTGTGCCGGCCAAAGGCCAAGGCCAAGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101566 TATTGCCAAGGGGCTCAGGCTGTGCCGGCCAAAGGCCAAGGCCAAGGCCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AGGCCAAGGATCAAACCAAGGCCCAGGCTGCAGCCCCAGCTTCAGTTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101616 AGGCCAAGGATCAAACCAAGGCCCAGGCTGCAGCCCCAGCTTCAGTTCCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    433 GCTCAGGCTCCCAAACGTACCCAGGCCCCTACAAAGGCTTCAGAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101666 GCTCAGGCTCCCAAACGTACCCAGGCCCCTACAAAGGCTTCAGAG