seq1 = pF1KB6784.tfa, 459 bp
seq2 = pF1KB6784/gi568815593f_132574051.tfa (gi568815593f:132574051_132782584), 208534 bp

>pF1KB6784 459
>gi568815593f:132574051_132782584 (Chr5)

1-135  (100001-100135)   100% ->
136-183  (100409-100456)   100% ->
184-360  (105664-105840)   100% ->
361-459  (108436-108534)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGTCTCACCTCCCAACTGCTTCCCCCTCTGTTCTTCCTGCTAGCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGTCTCACCTCCCAACTGCTTCCCCCTCTGTTCTTCCTGCTAGCATG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGCCGGCAACTTTGTCCACGGACACAAGTGCGATATCACCTTACAGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGCCGGCAACTTTGTCCACGGACACAAGTGCGATATCACCTTACAGGAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCATCAAAACTTTGAACAGCCTCACAGAGCAGAAG         ACTCTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 100101 TCATCAAAACTTTGAACAGCCTCACAGAGCAGAAGGTG...AAGACTCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TGCACCGAGTTGACCGTAACAGACATCTTTGCTGCCTCCAAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 100415 TGCACCGAGTTGACCGTAACAGACATCTTTGCTGCCTCCAAGGTA...CA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    184  AACACAACTGAGAAGGAAACCTTCTGCAGGGCTGCGACTGTGCTCCGGC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105663 GAACACAACTGAGAAGGAAACCTTCTGCAGGGCTGCGACTGTGCTCCGGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGTTCTACAGCCACCATGAGAAGGACACTCGCTGCCTGGGTGCGACTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105713 AGTTCTACAGCCACCATGAGAAGGACACTCGCTGCCTGGGTGCGACTGCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CAGCAGTTCCACAGGCACAAGCAGCTGATCCGATTCCTGAAACGGCTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105763 CAGCAGTTCCACAGGCACAAGCAGCTGATCCGATTCCTGAAACGGCTCGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CAGGAACCTCTGGGGCCTGGCGGGCTTG         AATTCCTGTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 105813 CAGGAACCTCTGGGGCCTGGCGGGCTTGGTA...CAGAATTCCTGTCCTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TGAAGGAAGCCAACCAGAGTACGTTGGAAAACTTCTTGGAAAGGCTAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108449 TGAAGGAAGCCAACCAGAGTACGTTGGAAAACTTCTTGGAAAGGCTAAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .
    424 ACGATCATGAGAGAGAAATATTCAAAGTGTTCGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108499 ACGATCATGAGAGAGAAATATTCAAAGTGTTCGAGC