seq1 = pF1KB6773.tfa, 354 bp
seq2 = pF1KB6773/gi568815586r_6364890.tfa (gi568815586r:6364890_6566351), 201462 bp

>pF1KB6773 354
>gi568815586r:6364890_6566351 (Chr12)

(complement)

1-129  (99999-100127)   99% ->
130-288  (100352-100510)   99% ->
289-340  (101411-101462)   100% ->
341-354  (101866-101879)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCTGCTCCAGCTCAGCCACCTGCTGAAGGGACAGAAGGGACTGCCCC
        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99999 AGGTCTGCTCCAGCTCAGCCACCTGCTGAAGGGACAGAAGGGACTGCCCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGGTGGGGGTCCCCCTGGCCCTCCTCCTAACATGACCAGTAACAGACGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100049 AGGTGGGGGTCCCCCTGGCCCTCCTCCTAACATGACCAGTAACAGACGAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TACAGCAAACCCAGGCACAAGTGGAGGAG         GTGGTGGACATC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100099 TACAGCAAACCCAGGCACAAGTGGAGGAGGTA...CAGGTGGTGGACATC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATACGTGTGAACGTGGACAAGGTCCTGGAGAGGGACCAGAAGCTGTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100364 ATACGTGTGAACGTGGACAAGGTCCTGGAGAGGGACCAGAAGCTGTCAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCTGGATGACCGAGCTGATGCCTTGCAGGCAGGAGCATCACAATTTGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100414 GCTGGATGACCGAGCTGATGCCTTGCAGGCAGGAGCATCACAATTTGAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GCAGTGCTGCAAAGCTAAAGAGGAAGTATTGGTGGAAAAACTGCAAG   
        |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 100464 GCAGTGCTGCCAAGCTAAAGAGGAAGTATTGGTGGAAAAACTGCAAGGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    289       ATGATGATCATGCTGGGAGCCATCTGTGCCATCATCGTGGTAGT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100514 ...CAGATGATGATCATGCTGGGAGCCATCTGTGCCATCATCGTGGTAGT

    350     .    :    .    :    .    :
    333 TATTGTAA         TCTACTTTTTTACT
        ||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 101455 TATTGTAAGTA...CAGTCTACTTTTTTACT