seq1 = pF1KB6771.tfa, 354 bp
seq2 = pF1KB6771/gi568815581r_8061473.tfa (gi568815581r:8061473_8262372), 200900 bp

>pF1KB6771 354
>gi568815581r:8061473_8262372 (Chr17)

(complement)

1-129  (99996-100124)   96% ->
130-288  (100607-100765)   100% ->
289-340  (100849-100900)   100% ->
341-354  (101502-101515)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACAGGTCTGCTACCGCTGCCACGGCCCCCCCTGCTGCCCCGGCTGG
         |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99996 CTCCTCAGGTCTGCTACCGCTGCCACGGCCCCCCCTGCTGCCCCGGCTGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAGGGTGGTCCCCCTGCACCCCCTCCAAACCTCACCAGTAACAGGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100046 GGAGGGTGGTCCCCCTGCACCCCCTCCAAACCTCACCAGTAACAGGAGAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGCAGCAGACCCAGGCCCAGGTGGATGAG         GTGGTGGACATC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100096 TGCAGCAGACCCAGGCCCAGGTGGATGAGGTG...CAGGTGGTGGACATC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATGAGGGTGAACGTGGACAAGGTCCTGGAGCGAGACCAGAAGCTGTCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100619 ATGAGGGTGAACGTGGACAAGGTCCTGGAGCGAGACCAGAAGCTGTCGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCTGGACGACCGTGCAGATGCACTCCAGGCGGGGGCCTCCCAGTTTGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100669 GCTGGACGACCGTGCAGATGCACTCCAGGCGGGGGCCTCCCAGTTTGAAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CAAGCGCAGCCAAGCTCAAGCGCAAATACTGGTGGAAAAACCTCAAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 100719 CAAGCGCAGCCAAGCTCAAGCGCAAATACTGGTGGAAAAACCTCAAGGTA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    289       ATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCAT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100769 ...CAGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCAT

    350     .    :    .    :    .    :
    333 CATCATAG         TTTACTTCAGCACT
        ||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 100893 CATCATAGGTG...CAGTTTACTTCAGCACT