seq1 = pF1KB6770.tfa, 450 bp
seq2 = pF1KB6770/gi568815596r_231632955.tfa (gi568815596r:231632955_231881114), 248160 bp

>pF1KB6770 450
>gi568815596r:231632955_231881114 (Chr2)

(complement)

1-50  (100001-100050)   100% ->
51-139  (141927-142015)   100% ->
140-265  (142977-143102)   100% ->
266-371  (143823-143928)   100% ->
372-450  (148082-148160)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCAGCCAAGGACGAGCGGGCCAGGGAGATCCTGAGGGGCTTCAAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCAGCCAAGGACGAGCGGGCCAGGGAGATCCTGAGGGGCTTCAAACT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51          AAATTGGATGAACCTTCGGGATGCTGAGACAGGGAAGATAC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTA...CAGAAATTGGATGAACCTTCGGGATGCTGAGACAGGGAAGATAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TCTGGCAAGGAACAGAAGACCTGTCTGTCCCTGGTGTGGAGCATGAAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 141968 TCTGGCAAGGAACAGAAGACCTGTCTGTCCCTGGTGTGGAGCATGAAGGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    140        CCCGTGTTCCCAAGAAAATCCTCAAGTGCAAGGCAGTGTCTCG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142018 A...CAGCCCGTGTTCCCAAGAAAATCCTCAAGTGCAAGGCAGTGTCTCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 AGAACTTAATTTTTCTTCGACAGAACAAATGGAAAAATTCCGCCTGGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143020 AGAACTTAATTTTTCTTCGACAGAACAAATGGAAAAATTCCGCCTGGAAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AAAAAGTTTACTTCAAAGGGCAATGCCTAGAAG         AATGGTTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 143070 AAAAAGTTTACTTCAAAGGGCAATGCCTAGAAGGTA...CAGAATGGTTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 TTCGAGTTTGGCTTTGTGATCCCTAACTCCACAAATACCTGGCAGTCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143831 TTCGAGTTTGGCTTTGTGATCCCTAACTCCACAAATACCTGGCAGTCCTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GATAGAGGCAGCACCCGAGTCCCAGATGATGCCAGCAAGCGTCTTAAC  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 143881 GATAGAGGCAGCACCCGAGTCCCAGATGATGCCAGCAAGCGTCTTAACGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    372        TGGGAACGTTATCATAGAAACAAAGTTTTTTGACGACGATCTT
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143931 G...CAGTGGGAACGTTATCATAGAAACAAAGTTTTTTGACGACGATCTT

    450     .    :    .    :    .    :    .
    415 CTTGTAAGCACATCCAGAGTGAGACTTTTCTATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148125 CTTGTAAGCACATCCAGAGTGAGACTTTTCTATGTT