seq1 = pF1KB6746.tfa, 432 bp
seq2 = pF1KB6746/gi568815593f_112761377.tfa (gi568815593f:112761377_112967507), 206131 bp

>pF1KB6746 432
>gi568815593f:112761377_112967507 (Chr5)

1-41  (100001-100041)   100% ->
42-117  (101132-101207)   100% ->
118-189  (103081-103152)   100% ->
190-301  (103245-103356)   100% ->
302-432  (106028-106158)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTTGCGCTGCCGCGCGGTCCCCGGCCGACCAGGACAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 100001 ATGGCTTGCGCTGCCGCGCGGTCCCCGGCCGACCAGGACAGGTG...CAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 GTTTATTTGTATCTATCCTGCTTATTTAAATAATAAGAAGACCATCGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101132 GTTTATTTGTATCTATCCTGCTTATTTAAATAATAAGAAGACCATCGCAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGGGAAGGCGAATCCCCATAAGTAAG         GCTGTTGAAAATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 101182 AGGGAAGGCGAATCCCCATAAGTAAGGTA...CAGGCTGTTGAAAATCCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 ACAGCTACAGAGATTCAAGATGTATGTTCAGCAGTTGGACTTAACGTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103096 ACAGCTACAGAGATTCAAGATGTATGTTCAGCAGTTGGACTTAACGTATT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TCTTGAG         AAAAATAAAATGTACTCTAGAGAATGGAATCGTG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103146 TCTTGAGGTA...TAGAAAAATAAAATGTACTCTAGAGAATGGAATCGTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 ATGTCCAATACAGAGGCAGAGTCCGGGTCCAGCTCAAACAGGAAGATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103279 ATGTCCAATACAGAGGCAGAGTCCGGGTCCAGCTCAAACAGGAAGATGGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 AGCCTCTGCCTTGTACAGTTCCCATCAC         GTAAGTCAGTAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 103329 AGCCTCTGCCTTGTACAGTTCCCATCACGTA...TAGGTAAGTCAGTAAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 GTTGTATGCAGCAGAAATGATACCTAAACTAAAAACAAGGACACAAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106041 GTTGTATGCAGCAGAAATGATACCTAAACTAAAAACAAGGACACAAAAAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 CAGGAGGTGCTGACCAAAGTCTTCAACAAGGAGAGGGAAGTAAAAAAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106091 CAGGAGGTGCTGACCAAAGTCTTCAACAAGGAGAGGGAAGTAAAAAAGGG

    450     .    :    .
    415 AAAGGAAAGAAAAAGAAG
        ||||||||||||||||||
 106141 AAAGGAAAGAAAAAGAAG