seq1 = pF1KB6745.tfa, 303 bp
seq2 = pF1KB6745/gi568815594r_73881207.tfa (gi568815594r:73881207_74081953), 200747 bp

>pF1KB6745 303
>gi568815594r:73881207_74081953 (Chr4)

(complement)

1-91  (100001-100091)   100% ->
92-218  (100411-100537)   100% ->
219-303  (100663-100747)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGCTCCGCAGCCGGGTTCTGCGCCTCACGCCCCGGGCTGCTGTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGCTCCGCAGCCGGGTTCTGCGCCTCACGCCCCGGGCTGCTGTTCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGGGTTGCTGCTCCTGCCACTTGTGGTCGCCTTCGCCAGCG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 100051 GGGGTTGCTGCTCCTGCCACTTGTGGTCGCCTTCGCCAGCGGTG...CAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CTGAAGCTGAAGAAGATGGGGACCTGCAGTGCCTGTGTGTGAAGACCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100411 CTGAAGCTGAAGAAGATGGGGACCTGCAGTGCCTGTGTGTGAAGACCACC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TCCCAGGTCCGTCCCAGGCACATCACCAGCCTGGAGGTGATCAAGGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100461 TCCCAGGTCCGTCCCAGGCACATCACCAGCCTGGAGGTGATCAAGGCCGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 ACCCCACTGCCCCACTGCCCAACTGAT         AGCCACGCTGAAGA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 100511 ACCCCACTGCCCCACTGCCCAACTGATGTG...CAGAGCCACGCTGAAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ATGGAAGGAAAATTTGCTTGGACCTGCAAGCCCCGCTGTACAAGAAAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100677 ATGGAAGGAAAATTTGCTTGGACCTGCAAGCCCCGCTGTACAAGAAAATA

    300     .    :    .    :
    283 ATTAAGAAACTTTTGGAGAGT
        |||||||||||||||||||||
 100727 ATTAAGAAACTTTTGGAGAGT