seq1 = pF1KB6711.tfa, 237 bp
seq2 = pF1KB6711/gi568815597f_154874746.tfa (gi568815597f:154874746_155078774), 204029 bp

>pF1KB6711 237
>gi568815597f:154874746_155078774 (Chr1)

1-59  (100001-100059)   100% ->
60-187  (103242-103369)   100% ->
188-237  (103980-104029)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCGCACAAACAAATTTACTATTCGGACAAATACGACGACGAGGAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCGCACAAACAAATTTACTATTCGGACAAATACGACGACGAGGAGTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGAGTATCG         ACATGTCATGCTGCCCAAGGACATAGCCAAGC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGAGTATCGGTT...CAGACATGTCATGCTGCCCAAGGACATAGCCAAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGGTCCCTAAAACCCATCTGATGTCTGAATCTGAATGGAGGAATCTTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103274 TGGTCCCTAAAACCCATCTGATGTCTGAATCTGAATGGAGGAATCTTGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTTCAGCAGAGTCAGGGATGGGTCCATTATATGATCCATGAACCAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 103324 GTTCAGCAGAGTCAGGGATGGGTCCATTATATGATCCATGAACCAGGTC.

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    188      AACCTCACATCTTGCTGTTCCGGCGCCCACTACCCAAGAAACCAA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103374 ..CAGAACCTCACATCTTGCTGTTCCGGCGCCCACTACCCAAGAAACCAA

    250     .
    233 AGAAA
        |||||
 104025 AGAAA