seq1 = pF1KB6681.tfa, 1281 bp
seq2 = pF1KB6681/gi568815592r_30630018.tfa (gi568815592r:30630018_30842189), 212172 bp

>pF1KB6681 1281
>gi568815592r:30630018_30842189 (Chr6)

(complement)

1-43  (100001-100043)   100% ->
44-119  (100323-100398)   100% ->
120-210  (100486-100576)   100% ->
211-354  (100857-101000)   100% ->
355-474  (101392-101511)   100% ->
475-570  (101599-101694)   100% ->
571-723  (101880-102032)   100% ->
724-905  (111090-111271)   100% ->
906-951  (111463-111508)   100% ->
952-1089  (111625-111762)   100% ->
1090-1254  (112004-112168)   100% ->
1255-1281  (114045-114071)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTTTTCACTTGTGGCCCAAATGAGGCCATGGTGGTCTCCG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 100001 ATGTTTTTCACTTGTGGCCCAAATGAGGCCATGGTGGTCTCCGGTA...C

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     44   GGTTCTGCCGAAGCCCCCCAGTCATGGTGGCTGGAGGGCGTGTCTTTG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100321 AGGGTTCTGCCGAAGCCCCCCAGTCATGGTGGCTGGAGGGCGTGTCTTTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TCCTGCCCTGCATCCAACAGATCCAGAG         GATCTCTCTCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 100371 TCCTGCCCTGCATCCAACAGATCCAGAGGTA...TAGGATCTCTCTCAAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 ACACTGACCCTCAATGTCAAGAGTGAAAAGGTTTACACTCGCCATGGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100499 ACACTGACCCTCAATGTCAAGAGTGAAAAGGTTTACACTCGCCATGGGGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CCCCATCTCAGTCACTGGCATTGCCCAG         GTAAAAATCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 100549 CCCCATCTCAGTCACTGGCATTGCCCAGGTG...CAGGTAAAAATCCAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 GGCAGAACAAGGAGATGTTGGCGGCCGCCTGTCAGATGTTCCTGGGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100870 GGCAGAACAAGGAGATGTTGGCGGCCGCCTGTCAGATGTTCCTGGGGAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 ACGGAGGCTGAGATTGCCCACATTGCCCTGGAGACGTTAGAGGGCCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100920 ACGGAGGCTGAGATTGCCCACATTGCCCTGGAGACGTTAGAGGGCCACCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GAGGGCCATCATGGCCCACATGACTGTGGAG         GAGATCTATA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 100970 GAGGGCCATCATGGCCCACATGACTGTGGAGGTT...CAGGAGATCTATA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 AGGACAGGCAGAAATTCTCAGAACAGGTTTTCAAAGTGGCCTCCTCAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101402 AGGACAGGCAGAAATTCTCAGAACAGGTTTTCAAAGTGGCCTCCTCAGAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 CTGGTCAACATGGGCATCAGTGTGGTTAGCTACACTCTGAAGGACATTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101452 CTGGTCAACATGGGCATCAGTGTGGTTAGCTACACTCTGAAGGACATTCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CGATGACCAG         GACTATTTGCACTCTTTGGGGAAGGCTCGAA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 101502 CGATGACCAGGTA...CAGGACTATTTGCACTCTTTGGGGAAGGCTCGAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 CAGCTCAAGTCCAAAAAGATGCACGGATTGGAGAAGCAGAGGCCAAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101630 CAGCTCAAGTCCAAAAAGATGCACGGATTGGAGAAGCAGAGGCCAAGAGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GATGCTGGGATCCGG         GAAGCTAAAGCCAAGCAGGAAAAGGT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 101680 GATGCTGGGATCCGGGTG...CAGGAAGCTAAAGCCAAGCAGGAAAAGGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 GTCTGCTCAGTACCTGAGTGAGATCGAGATGGCCAAGGCACAGAGAGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101906 GTCTGCTCAGTACCTGAGTGAGATCGAGATGGCCAAGGCACAGAGAGATT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 ACGAACTGAAGAAGGCCGCCTATGACATCGAGGTCAACACCCGCCGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101956 ACGAACTGAAGAAGGCCGCCTATGACATCGAGGTCAACACCCGCCGAGCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 CAGGCTGACCTGGCCTATCAGCTTCAG         GTGGCCAAGACTAA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 102006 CAGGCTGACCTGGCCTATCAGCTTCAGGTC...CAGGTGGCCAAGACTAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 GCAGCAGATTGAGGAGCAGCGGGTGCAGGTGCAGGTGGTGGAGCGGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111104 GCAGCAGATTGAGGAGCAGCGGGTGCAGGTGCAGGTGGTGGAGCGGGCCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 AGCAGGTGGCAGTGCAGGAGCAGGAGATCGCCCGGCGGGAGAAGGAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111154 AGCAGGTGGCAGTGCAGGAGCAGGAGATCGCCCGGCGGGAGAAGGAGCTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 GAGGCCCGGGTGCGGAAGCCAGCGGAAGCGGAGCGCTACAAGCTGGAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111204 GAGGCCCGGGTGCGGAAGCCAGCGGAAGCGGAGCGCTACAAGCTGGAGCG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 CCTAGCCGAGGCAGAGAA         GTCCCAACTAATTATGCAGGCGG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 111254 CCTAGCCGAGGCAGAGAAGTA...CAGGTCCCAACTAATTATGCAGGCGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 AGGCAGAAGCCGCGTCTGTGCGG         ATGCGTGGGGAAGCTGAG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 111486 AGGCAGAAGCCGCGTCTGTGCGGGTG...CAGATGCGTGGGGAAGCTGAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 GCCTTTGCCATAGGGGCCCGAGCCCGAGCCGAGGCTGAGCAGATGGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111643 GCCTTTGCCATAGGGGCCCGAGCCCGAGCCGAGGCTGAGCAGATGGCCAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 GAAGGCAGAAGCCTTCCAGCTGTACCAAGAGGCTGCTCAGCTGGACATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111693 GAAGGCAGAAGCCTTCCAGCTGTACCAAGAGGCTGCTCAGCTGGACATGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 TGCTAGAGAAGCTGCCCCAG         GTGGCAGAGGAGATCAGTGGT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 111743 TGCTAGAGAAGCTGCCCCAGGTC...CAGGTGGCAGAGGAGATCAGTGGT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 CCCTTGACTTCAGCCAATAAGATCACACTGGTGTCCAGCGGCAGTGGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112025 CCCTTGACTTCAGCCAATAAGATCACACTGGTGTCCAGCGGCAGTGGGAC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 CATGGGGGCAGCCAAAGTGACTGGGGAAGTACTGGACATTCTAACTCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112075 CATGGGGGCAGCCAAAGTGACTGGGGAAGTACTGGACATTCTAACTCGCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 TGCCAGAGAGTGTGGAAAGACTCACAGGCGTGAGCATCTCCCAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 112125 TGCCAGAGAGTGTGGAAAGACTCACAGGCGTGAGCATCTCCCAGGTG...

   1350     .    :    .    :    .    :
   1255    GTGAATCACAAGCCTTTGAGAACAGCC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||
 114042 CAGGTGAATCACAAGCCTTTGAGAACAGCC