seq1 = pF1KB6671.tfa, 1278 bp
seq2 = pF1KB6671/gi568815591r_100543249.tfa (gi568815591r:100543249_100755881), 212633 bp

>pF1KB6671 1278
>gi568815591r:100543249_100755881 (Chr7)

(complement)

1-25  (99528-99552)   100% ->
26-102  (100003-100079)   100% ->
103-268  (100296-100461)   100% ->
269-369  (100763-100863)   100% ->
370-467  (105747-105844)   100% ->
468-562  (107059-107153)   100% ->
563-669  (107220-107326)   100% ->
670-759  (108349-108438)   100% ->
760-821  (108598-108659)   98% ->
822-936  (108797-108911)   100% ->
937-1017  (109051-109131)   100% ->
1018-1113  (109236-109331)   100% ->
1114-1200  (109547-109633)   100% ->
1201-1278  (112556-112633)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGCGGGGGCGTCTACGGCGGAG         ATGAGGTGGGGGCGCT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
  99528 ATGAGCGGGGGCGTCTACGGCGGAGGTG...CAGATGAGGTGGGGGCGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 GGTCTTTGACATTGGCTCCTTCTCAGTCCGCGCTGGGTACGCTGGGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100019 GGTCTTTGACATTGGCTCCTTCTCAGTCCGCGCTGGGTACGCTGGGGAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ACTGTCCCAAG         GCTGACTTCCCCACCACAGTGGGGCTGCTG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 100069 ACTGTCCCAAGGTG...CAGGCTGACTTCCCCACCACAGTGGGGCTGCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 GCCGCGGAGGAGGGGGGCGGGCTGGAGCTGGAGGGGGACAAAGAGAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100326 GCCGCGGAGGAGGGGGGCGGGCTGGAGCTGGAGGGGGACAAAGAGAAGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 AGGGAAGATCTTCCACATCGACACCAATGCCCTGCACGTGCCTCGGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100376 AGGGAAGATCTTCCACATCGACACCAATGCCCTGCACGTGCCTCGGGATG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GAGCGGAGGTCATGTCGCCCCTCAAGAATGGCATGA         TCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 100426 GAGCGGAGGTCATGTCGCCCCTCAAGAATGGCATGAGTA...CAGTCGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GACTGGGAGTGCTTCCGAGCCATCCTGGATCACACCTACAGCAAACACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100768 GACTGGGAGTGCTTCCGAGCCATCCTGGATCACACCTACAGCAAACACGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CAAGTCTGAGCCAAACCTGCACCCAGTGCTCATGTCCGAGGCTCCG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 100818 CAAGTCTGAGCCAAACCTGCACCCAGTGCTCATGTCCGAGGCTCCGGTG.

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    370      TGGAACACACGGGCCAAGCGGGAGAAGCTGACAGAGCTGATGTTC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100868 ..CAGTGGAACACACGGGCCAAGCGGGAGAAGCTGACAGAGCTGATGTTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GAGCAGTACAACATTCCTGCCTTCTTCTTATGCAAGACGGCTGTGCTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105792 GAGCAGTACAACATTCCTGCCTTCTTCTTATGCAAGACGGCTGTGCTCAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CGC         CTTTGCAAACGGGCGGTCCACTGGCCTCGTGCTGGACA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105842 CGCGTA...CAGCTTTGCAAACGGGCGGTCCACTGGCCTCGTGCTGGACA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 GTGGAGCCACCCACACCACGGCCATTCCAGTACATGACGGCTACGTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107097 GTGGAGCCACCCACACCACGGCCATTCCAGTACATGACGGCTACGTTCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 CAGCAAG         GCATCGTCAAGTCCCCTCTGGCAGGGGACTTCAT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107147 CAGCAAGGTG...TAGGCATCGTCAAGTCCCCTCTGGCAGGGGACTTCAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 CTCCATGCAGTGCCGGGAGCTGTTCCAGGAGATGGCCATTGACATCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107254 CTCCATGCAGTGCCGGGAGCTGTTCCAGGAGATGGCCATTGACATCATCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 CACCTTACATGATCGCAGCCAAG         GAGCCTGTCCGGGAGGGT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 107304 CACCTTACATGATCGCAGCCAAGGTG...CAGGAGCCTGTCCGGGAGGGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 GCCCCCCCAAACTGGAAGAAGAAGGAGAAGCTACCCCAGGTCTCCAAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108367 GCCCCCCCAAACTGGAAGAAGAAGGAGAAGCTACCCCAGGTCTCCAAGTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 CTGGCATAACTACATGTGTAAT         GAGGTGATCCAGGACTTCC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 108417 CTGGCATAACTACATGTGTAATGTG...CAGGAGGTGATCCAGGACTTCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 AGGCCTCTGTGCTGCAGGTCTCAGACTCCCCCTACGATGAACA       
        ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 108617 AGGCCTCCGTGCTGCAGGTCTCAGACTCCCCCTACGATGAACAGTG...T

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    822   GGTGGCTGCACAAATGCCCACAGTGCACTACGAGATGCCCAATGGCTA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108795 AGGGTGGCTGCACAAATGCCCACAGTGCACTACGAGATGCCCAATGGCTA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    870 CAATACAGACTACGGCGCCGAGCGACTCCGCATCCCTGAGGGCCTGTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108845 CAATACAGACTACGGCGCCGAGCGACTCCGCATCCCTGAGGGCCTGTTTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 ATCCCTCGAACGTCAAG         GGCCTGTCGGGGAACACCATGTTG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 108895 ATCCCTCGAACGTCAAGGTT...CAGGGCCTGTCGGGGAACACCATGTTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    961 GGTGTGGGCCACGTGGTGACCACCAGCATCGGCATGTGTGACATTGATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109075 GGTGTGGGCCACGTGGTGACCACCAGCATCGGCATGTGTGACATTGATAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1011 TCGCCCG         GGCCTGTACGGGAGTGTCATTGTCACCGGCGGGA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109125 TCGCCCGGTG...CAGGGCCTGTACGGGAGTGTCATTGTCACCGGCGGGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1052 ACACACTGCTGCAGGGCTTCACTGACAGGCTCAATCGAGAGCTTTCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109270 ACACACTGCTGCAGGGCTTCACTGACAGGCTCAATCGAGAGCTTTCCCAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1102 AAGACCCCACCG         AGCATGCGACTGAAACTCATTGCCAGCAA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 109320 AAGACCCCACCGGTA...CAGAGCATGCGACTGAAACTCATTGCCAGCAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1143 CAGCACCATGGAGCGCAAGTTCAGCCCCTGGATCGGGGGTTCCATCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109576 CAGCACCATGGAGCGCAAGTTCAGCCCCTGGATCGGGGGTTCCATCCTGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1193 CCTCACTG         GGCACTTTCCAGCAGATGTGGATCTCCAAGCAG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 109626 CCTCACTGGTG...CAGGGCACTTTCCAGCAGATGTGGATCTCCAAGCAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1234 GAATATGAGGAGGGCGGGAAGCAGTGCGTGGAGCGAAAGTGCCCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112589 GAATATGAGGAGGGCGGGAAGCAGTGCGTGGAGCGAAAGTGCCCC