seq1 = pF1KB6643.tfa, 1161 bp
seq2 = pF1KB6643/gi568815580r_25932398.tfa (gi568815580r:25932398_26190569), 258172 bp

>pF1KB6643 1161
>gi568815580r:25932398_26190569 (Chr18)

(complement)

1-69  (100001-100069)   100% ->
70-146  (102993-103069)   100% ->
147-231  (112410-112494)   100% ->
232-385  (132828-132981)   100% ->
386-607  (137725-137946)   100% ->
608-775  (151114-151281)   100% ->
776-880  (151911-152015)   100% ->
881-1003  (155443-155565)   100% ->
1004-1137  (158038-158171)   100% ->
1138-1161  (172190-172213)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCTGTGGCTTTCGCGGCCCCGAGGCAGCGAGGCAAGGGGGAGATCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCTGTGGCTTTCGCGGCCCCGAGGCAGCGAGGCAAGGGGGAGATCAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCCCGCTGCGATTCAGAAG         ATGTTGGATGACAATAACCATC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100051 TCCCGCTGCGATTCAGAAGGTG...CAGATGTTGGATGACAATAACCATC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TTATTCAGTGTATAATGGACTCTCAGAATAAAGGAAAGACCTCAGAGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103015 TTATTCAGTGTATAATGGACTCTCAGAATAAAGGAAAGACCTCAGAGTGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TCTCA         GTATCAGCAGATGTTGCACACAAACTTGGTATACCT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103065 TCTCAGTA...TAGGTATCAGCAGATGTTGCACACAAACTTGGTATACCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TGCTACAATAGCAGATTCTAATCAAAATATGCAGTCTCTTTTACCAGCA 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 112446 TGCTACAATAGCAGATTCTAATCAAAATATGCAGTCTCTTTTACCAGCAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    232         CCACCCACACAGAATATGCCTATGGGTCCTGGAGGGATGAAT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112496 TA...CAGCCACCCACACAGAATATGCCTATGGGTCCTGGAGGGATGAAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 CAGAGCGGCCCTCCCCCACCTCCACGCTCTCACAACATGCCTTCAGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132870 CAGAGCGGCCCTCCCCCACCTCCACGCTCTCACAACATGCCTTCAGATGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 AATGGTAGGTGGGGGTCCTCCTGCACCGCACATGCAGAACCAGATGAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132920 AATGGTAGGTGGGGGTCCTCCTGCACCGCACATGCAGAACCAGATGAACG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GCCAGATGCCTG         GGCCTAACCATATGCCTATGCAGGGACCT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 132970 GCCAGATGCCTGGTA...AAGGGCCTAACCATATGCCTATGCAGGGACCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GGACCCAATCAACTCAATATGACAAACAGTTCCATGAATATGCCTTCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137754 GGACCCAATCAACTCAATATGACAAACAGTTCCATGAATATGCCTTCAAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TAGCCATGGATCCATGGGAGGTTACAACCATTCTGTGCCATCATCACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137804 TAGCCATGGATCCATGGGAGGTTACAACCATTCTGTGCCATCATCACAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GCATGCCAGTACAGAATCAGATGACAATGAGTCAGGGACAACCAATGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137854 GCATGCCAGTACAGAATCAGATGACAATGAGTCAGGGACAACCAATGGGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 AACTATGGTCCCAGACCAAATATGAGTATGCAGCCAAACCAAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 137904 AACTATGGTCCCAGACCAAATATGAGTATGCAGCCAAACCAAGGTA...C

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    608   GTCCAATGATGCATCAGCAGCCTCCTTCTCAGCAATACAATATGCCAC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151112 AGGTCCAATGATGCATCAGCAGCCTCCTTCTCAGCAATACAATATGCCAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 AGGGAGGCGGACAGCATTACCAAGGACAGCAGCCACCTATGGGAATGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151162 AGGGAGGCGGACAGCATTACCAAGGACAGCAGCCACCTATGGGAATGATG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GGTCAAGTTAACCAAGGCAATCATATGATGGGTCAGAGACAGATTCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151212 GGTCAAGTTAACCAAGGCAATCATATGATGGGTCAGAGACAGATTCCTCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CTATAGACCTCCTCAACAGG         GCCCACCACAGCAGTACTCAG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 151262 CTATAGACCTCCTCAACAGGGTA...CAGGCCCACCACAGCAGTACTCAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 GCCAGGAAGACTATTACGGGGACCAATACAGTCATGGTGGACAAGGTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151932 GCCAGGAAGACTATTACGGGGACCAATACAGTCATGGTGGACAAGGTCCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CCAGAAGGCATGAACCAGCAATATTACCCTGATG         GAAATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 151982 CCAGAAGGCATGAACCAGCAATATTACCCTGATGGTA...TAGGAAATTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 ACAGTATGGCCAACAGCAAGATGCATACCAGGGACCACCTCCACAACAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155450 ACAGTATGGCCAACAGCAAGATGCATACCAGGGACCACCTCCACAACAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 GATATCCACCCCAGCAGCAGCAGTACCCAGGGCAGCAAGGTTACCCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155500 GATATCCACCCCAGCAGCAGCAGTACCCAGGGCAGCAAGGTTACCCAGGA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 CAGCAGCAGGGCTACG         GTCCTTCACAGGGTGGTCCAGGTCC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 155550 CAGCAGCAGGGCTACGGTA...CAGGTCCTTCACAGGGTGGTCCAGGTCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 TCAGTATCCTAACTACCCACAGGGACAAGGTCAGCAGTATGGAGGATATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158063 TCAGTATCCTAACTACCCACAGGGACAAGGTCAGCAGTATGGAGGATATA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 GACCAACACAGCCTGGACCACCACAGCCACCCCAGCAGAGGCCTTATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158113 GACCAACACAGCCTGGACCACCACAGCCACCCCAGCAGAGGCCTTATGGA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 TATGACCAG         GGACAGTATGGAAATTACCAGCAG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 158163 TATGACCAGGTA...TAGGGACAGTATGGAAATTACCAGCAG