seq1 = pF1KB6631.tfa, 1212 bp
seq2 = pF1KB6631/gi568815579r_7643042.tfa (gi568815579r:7643042_7847511), 204470 bp

>pF1KB6631 1212
>gi568815579r:7643042_7847511 (Chr19)

(complement)

1-46  (100001-100046)   100% ->
47-106  (100147-100206)   100% ->
107-178  (100981-101052)   100% ->
179-748  (101425-101994)   100% ->
749-900  (102420-102571)   100% ->
901-1013  (103293-103405)   100% ->
1014-1212  (104272-104470)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGTGACTCCAAGGAACCAAGACTGCAGCAGCTGGGCCTCCTGG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 100001 ATGAGTGACTCCAAGGAACCAAGACTGCAGCAGCTGGGCCTCCTGGGTG.

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     47      AGGAGGAACAGCTGAGAGGCCTTGGATTCCGACAGACTCGAGGAT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ..CAGAGGAGGAACAGCTGAGAGGCCTTGGATTCCGACAGACTCGAGGAT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ACAAGAGCTTAGCAG         GGTGTCTTGGCCATGGTCCCCTGGTG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 100192 ACAAGAGCTTAGCAGGTA...CAGGGTGTCTTGGCCATGGTCCCCTGGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 CTGCAACTCCTCTCCTTCACGCTCTTGGCTGGGCTCCTTGTCCAAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 101007 CTGCAACTCCTCTCCTTCACGCTCTTGGCTGGGCTCCTTGTCCAAGGTC.

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    179      TGTCCAAGGTCCCCAGCTCCATAAGTCAGGAACAATCCAGGCAAG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101057 ..CAGTGTCCAAGGTCCCCAGCTCCATAAGTCAGGAACAATCCAGGCAAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 ACGCGATCTACCAGAACCTGACCCAGCTTAAAGCTGCAGTGGGTGAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101470 ACGCGATCTACCAGAACCTGACCCAGCTTAAAGCTGCAGTGGGTGAGCTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 TCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCAGCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101520 TCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCAGCTGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCTGCAGGAGATCTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101570 GGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCTGCAGGAGATCTACC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101620 AGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCTGGCTGAAGGCTGCAGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101670 AAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCTGGCTGAAGGCTGCAGTGGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGATGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101720 TGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGATGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCAGCAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101770 GGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCAGCAGGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 ATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101820 ATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GAAATCTAAGCAGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101870 GAAATCTAAGCAGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 CAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCAGCAGGAGATCTACCAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101920 CAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCAGCAGGAGATCTACCAGGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 CTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGTGG         AACGCCTGTGCCACCC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 101970 CTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTG...CAGAACGCCTGTGCCACCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CTGTCCCTGGGAATGGACATTCTTCCAAGGAAACTGTTACTTCATGTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102436 CTGTCCCTGGGAATGGACATTCTTCCAAGGAAACTGTTACTTCATGTCTA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 ACTCCCAGCGGAACTGGCACGACTCCATCACCGCCTGCAAAGAAGTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102486 ACTCCCAGCGGAACTGGCACGACTCCATCACCGCCTGCAAAGAAGTGGGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 GCCCAGCTCGTCGTAATCAAAAGTGCTGAGGAGCAG         AACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 102536 GCCCAGCTCGTCGTAATCAAAAGTGCTGAGGAGCAGGTA...CAGAACTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 CCTACAGCTGCAGTCTTCCAGAAGTAACCGCTTCACCTGGATGGGACTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103298 CCTACAGCTGCAGTCTTCCAGAAGTAACCGCTTCACCTGGATGGGACTTT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 CAGATCTAAATCAGGAAGGCACGTGGCAATGGGTGGACGGCTCACCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103348 CAGATCTAAATCAGGAAGGCACGTGGCAATGGGTGGACGGCTCACCTCTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 TTGCCCAG         CTTCAAGCAGTATTGGAACAGAGGAGAGCCCAA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 103398 TTGCCCAGGTA...CAGCTTCAAGCAGTATTGGAACAGAGGAGAGCCCAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 CAACGTTGGGGAGGAAGACTGCGCGGAATTTAGTGGCAATGGCTGGAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104305 CAACGTTGGGGAGGAAGACTGCGCGGAATTTAGTGGCAATGGCTGGAACG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 ACGACAAATGTAATCTTGCCAAATTCTGGATCTGCAAAAAGTCCGCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104355 ACGACAAATGTAATCTTGCCAAATTCTGGATCTGCAAAAAGTCCGCAGCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 TCCTGCTCCAGGGATGAAGAACAGTTTCTTTCTCCAGCCCCTGCCACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104405 TCCTGCTCCAGGGATGAAGAACAGTTTCTTTCTCCAGCCCCTGCCACCCC

   1250     .    :    .
   1197 AAACCCCCCTCCTGCG
        ||||||||||||||||
 104455 AAACCCCCCTCCTGCG