seq1 = pF1KB6605.tfa, 1179 bp
seq2 = pF1KB6605/gi568815597r_67313210.tfa (gi568815597r:67313210_67530300), 217091 bp

>pF1KB6605 1179
>gi568815597r:67313210_67530300 (Chr1)

(complement)

1-313  (100001-100313)   100% ->
314-464  (104016-104166)   100% ->
465-605  (105078-105218)   100% ->
606-695  (105324-105413)   100% ->
696-773  (106024-106101)   100% ->
774-951  (110115-110292)   100% ->
952-1125  (114962-115135)   100% ->
1126-1179  (117038-117091)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCTGGGCACTTACAGGAAGGCTTCGGCTGCGTGGTCACCAACCGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCTGGGCACTTACAGGAAGGCTTCGGCTGCGTGGTCACCAACCGATT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGACCAGTTATTTGACGACGAATCGGACCCCTTCGAGGTGCTGAAGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGACCAGTTATTTGACGACGAATCGGACCCCTTCGAGGTGCTGAAGGCAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CAGAGAACAAGAAAAAAGAAGCCGGCGGGGGCGGCGTTGGGGGCCCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CAGAGAACAAGAAAAAAGAAGCCGGCGGGGGCGGCGTTGGGGGCCCTGGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCCAAGAGCGCAGCTCAGGCCGCGGCCCAGACCAACTCCAACGCGGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCCAAGAGCGCAGCTCAGGCCGCGGCCCAGACCAACTCCAACGCGGCAGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAAACAGCTGCGCAAGGAGTCCCAGAAAGACCGCAAGAACCCGCTGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAAACAGCTGCGCAAGGAGTCCCAGAAAGACCGCAAGAACCCGCTGCCCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCAGCGTTGGCGTGGTTGACAAGAAAGAGGAGACGCAGCCGCCCGTGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CCAGCGTTGGCGTGGTTGACAAGAAAGAGGAGACGCAGCCGCCCGTGGCG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTTAAGAAAGAAG         GAATAAGACGAGTTGGAAGAAGACCTGA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTTAAGAAAGAAGGTA...TAGGAATAAGACGAGTTGGAAGAAGACCTGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TCAACAACTTCAGGGTGAAGGGAAAATAATTGATAGAAGACCAGAAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104044 TCAACAACTTCAGGGTGAAGGGAAAATAATTGATAGAAGACCAGAAAGGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GACCACCTCGTGAACGAAGATTCGAAAAGCCACTTGAAGAAAAGGGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104094 GACCACCTCGTGAACGAAGATTCGAAAAGCCACTTGAAGAAAAGGGTGAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GGAGGCGAATTTTCAGTTGATAG         ACCGATTATTGACCGACC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 104144 GGAGGCGAATTTTCAGTTGATAGGTA...TAGACCGATTATTGACCGACC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 TATTCGAGGTCGTGGTGGTCTTGGAAGAGGTCGAGGGGGCCGTGGACGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105096 TATTCGAGGTCGTGGTGGTCTTGGAAGAGGTCGAGGGGGCCGTGGACGTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 GAATGGGCCGAGGAGATGGATTTGATTCTCGTGGCAAACGTGAATTTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105146 GAATGGGCCGAGGAGATGGATTTGATTCTCGTGGCAAACGTGAATTTGAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 AGGCATAGTGGAAGTGATAGATC         TTCTTTTTCACATTACAG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 105196 AGGCATAGTGGAAGTGATAGATCGTA...TAGTTCTTTTTCACATTACAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 TGGCCTGAAGCACGAGGACAAACGTGGAGGTAGCGGATCTCACAACTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105342 TGGCCTGAAGCACGAGGACAAACGTGGAGGTAGCGGATCTCACAACTGGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 GAACTGTCAAAGACGAATTAAC         TGACTTGGATCAATCAAAT
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 105392 GAACTGTCAAAGACGAATTAACGTT...CAGTGACTTGGATCAATCAAAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GTGACTGAGGAAACACCTGAAGGTGAAGAACATCATCCAGTGGCAGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106043 GTGACTGAGGAAACACCTGAAGGTGAAGAACATCATCCAGTGGCAGACAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 TGAAAATAA         GGAGAATGAAGTTGAAGAGGTAAAAGAGGAGG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 106093 TGAAAATAAGTA...CAGGGAGAATGAAGTTGAAGAGGTAAAAGAGGAGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 GTCCAAAAGAGATGACTTTGGATGAGTGGAAGGCTATTCAAAATAAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110147 GTCCAAAAGAGATGACTTTGGATGAGTGGAAGGCTATTCAAAATAAGGAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 CGGGCAAAAGTAGAATTTAATATCCGAAAACCAAATGAAGGTGCTGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110197 CGGGCAAAAGTAGAATTTAATATCCGAAAACCAAATGAAGGTGCTGATGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 GCAGTGGAAGAAGGGATTTGTTCTTCATAAATCAAAGAGTGAAGAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 110247 GCAGTGGAAGAAGGGATTTGTTCTTCATAAATCAAAGAGTGAAGAGGTA.

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    952      GCTCATGCTGAAGATTCGGTTATGGACCATCATTTCCGGAAGCCA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110297 ..TAGGCTCATGCTGAAGATTCGGTTATGGACCATCATTTCCGGAAGCCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 GCAAATGATATAACGTCTCAGCTGGAGATCAATTTTGGAGACCTTGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115007 GCAAATGATATAACGTCTCAGCTGGAGATCAATTTTGGAGACCTTGGCCG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 CCCAGGACGTGGCGGCAGGGGAGGACGAGGTGGACGTGGGCGTGGTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115057 CCCAGGACGTGGCGGCAGGGGAGGACGAGGTGGACGTGGGCGTGGTGGGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 GCCCAAACCGTGGCAGCAGGACCGACAAG         TCAAGTGCTTCT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 115107 GCCCAAACCGTGGCAGCAGGACCGACAAGGTA...CAGTCAAGTGCTTCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 GCTCCTGATGTGGATGACCCAGAGGCATTCCCAGCTCTGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117050 GCTCCTGATGTGGATGACCCAGAGGCATTCCCAGCTCTGGCT