seq1 = pF1KB6605.tfa, 1179 bp
seq2 = pF1KB6605/gi568815594r_78080869.tfa (gi568815594r:78080869_78282046), 201178 bp

>pF1KB6605 1179
>gi568815594r:78080869_78282046 (Chr4)

(complement)

1-1179  (100001-101178)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCTGGGCACTTACAGGAAGGCTTCGGCTGCGTGGTCACCAACCGATT
        |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
 100001 ATGCCTGGGCACTTACAGGAAGGCTTCGGCTGTGTGGTCACCAACCGATT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGACCAGTTATTTGACGACGAATCGGACCCCTTCGAGGTGCTGAAGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGACCAGTTATTTGACGACGAATCGGACCCCTTCGAGGTGCTGAAGGCAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CAGAGAACAAGAAAAAAGAAGCCGGCGGGGGCGGCGTTGGGGGCCCTGGG
        | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||
 100101 CGGAGAACAAGAAAAAAGAAGCCGGCAGGGGTGGCGTTGGGGGCCCTGGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCCAAGAGCGCAGCTCAGGCCGCGGCCCAGACCAACTCCAACGCGGCAGG
        |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCCAAGAGCGCAGCTCAGGCGGCGGCCCAGACCAACTCCAACGCGGCAGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAAACAGCTGCGCAAGGAGTCCCAGAAAGACCGCAAGAACCCGCTGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAAACAGCTGCGCAAGGAGTCCCAGAAAGACCGCAAGAACCCGCTGCCCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCAGCGTTGGCGTGGTTGACAAGAAAGAGGAGACGCAGCCGCCCGTGGCG
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCAGCGTTGGCGTGGTTGACAAGAAAGAGGAGACGCAGCCGCCCGTGGCG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTTAAGAAAGAAGGAATAAGACGAGTTGGAAGAAGACCTGATCAACAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTTAAGAAAGAAGGAATAAGACGAGTTGGAAGAAGACCTGATCAACAACT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TCAGGGTGAAGGGAAAATAATTGATAGAAGACCAGAAAGGCGACCACCTC
        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| 
 100351 TCAGGGTGAGGGGAAAATAATTGATAGAAGACCAGAAAGGCAACCACCTT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GTGAACGAAGATTCGAAAAGCCACTTGAAGAAAAGGGTGAAGGAGGCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
 100401 GTGAACGAAGATTCGAAAAGCCACTTGAAGAAAAGGGTGAAGGAGGCTAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TTTTCAGTTGATAGACCGATTATTGACCGACCTATTCGAGGTCGTGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TTTTCAGTTGATAGACCGATTATTGACCGACCTATTCGAGGTCGTGGTGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TCTTGGAAGAGGTCGAGGGGGCCGTGGACGTGGAATGGGCCGAGGAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TCTTGGAAGAGGTCGAGGGGGCCGTGGACGTGGAATGGGCCGAGGAGATG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GATTTGATTCTCGTGGCAAACGTGAATTTGATAGGCATAGTGGAAGTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GATTTGATTCTCGTGGCAAACGTGAATTTGATAGGCATAGTGGAAGTGAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 AGATCTTCTTTTTCACATTACAGTGGCCTGAAGCACGAGGACAAACGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 AGATCTTCTTTTTCACATTACAGTGGCCTGAAGCACGAGGACAAACGTGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 AGGTAGCGGATCTCACAACTGGGGAACTGTCAAAGACGAATTAACTGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 AGGTAGCGGATCTCACAACTGGGGAACTGTCAAAGACGAATTAACTGACT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TGGATCAATCAAATGTGACTGAGGAAACACCTGAAGGTGAAGAACATCAT
        |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
 100701 TGGATCAATCAAATGTGACTGACGAAACACCTGAAGGTGAAGAACATCAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CCAGTGGCAGACACTGAAAATAAGGAGAATGAAGTTGAAGAGGTAAAAGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
 100751 CCAGTGGCAGACACTGAAAATAAGGAGAATGATGTTGAAGAGGTAAAAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GGAGGGTCCAAAAGAGATGACTTTGGATGAGTGGAAGGCTATTCAAAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GGAGGGTCCAAAAGAGATGACTTTGGATGAGTGGAAGGCTATTCAAAATA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 AGGACCGGGCAAAAGTAGAATTTAATATCCGAAAACCAAATGAAGGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
 100851 AGGACCGGGCAAAAGTAGAATTTAATATCTGAAAACCAAATGAAGGTGCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GATGGGCAGTGGAAGAAGGGATTTGTTCTTCATAAATCAAAGAGTGAAGA
        |||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||
 100901 GATGGGCAGTGGAAGAAGGGATTTGTT TTCATAAATCAAAGAGTGAAGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GGCTCATGCTGAAGATTCGGTTATGGACCATCATTTCCGGAAGCCAGCAA
        |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||
 100950 GGCTTATGCTGAGGATTCAGTTATGGACCATCATTTCCAGAAGCCAGCAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 ATGATATAACGTCTCAGCTGGAGATCAATTTTGGAGACCTTGGCCGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101000 ATGATATAACGTCTCAGCTGGAGATCAATTTTGGAGACCTTGGCCGCCCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GGACGTGGCGGCAGGGGAGGACGAGGTGGACGTGGGCGTGGTGGGCGCCC
        |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||
 101050 GGACGTGGCGGCAGGGGAGGACAAGGTGGACATGGGCGTGGTGGGCGCCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 AAACCGTGGCAGCAGGACCGACAAGTCAAGTGCTTCTGCTCCTGATGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
 101100 AAACCGTGGCAGCAGGACCGACAAGTCAAGTACTTCTGCTCCTGATGTGG

   1150     .    :    .    :    .
   1151 ATGACCCAGAGGCATTCCCAGCTCTGGCT
        ||||||||||||||||||||| |||||||
 101150 ATGACCCAGAGGCATTCCCAGTTCTGGCT