seq1 = pF1KB6601.tfa, 1221 bp
seq2 = pF1KB6601/gi568815579r_3494839.tfa (gi568815579r:3494839_3700634), 205796 bp

>pF1KB6601 1221
>gi568815579r:3494839_3700634 (Chr19)

(complement)

1-786  (100001-100786)   99% ->
787-983  (104702-104898)   100% ->
984-1221  (105559-105796)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTGGCCCAACGGCAGTTCCCTGGGGCCCTGTTTCCGGCCCACAAACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTGGCCCAACGGCAGTTCCCTGGGGCCCTGTTTCCGGCCCACAAACAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TACCCTGGAGGAGAGACGGCTGATCGCCTCGCCCTGGTTCGCCGCCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TACCCTGGAGGAGAGACGGCTGATCGCCTCGCCCTGGTTCGCCGCCTCCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCTGCGTGGTGGGCCTGGCCTCCAACCTGCTGGCCCTGAGCGTGCTGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCTGCGTGGTGGGCCTGGCCTCCAACCTGCTGGCCCTGAGCGTGCTGGCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGCGCGCGGCAGGGGGGTTCGCACACGCGCTCCTCCTTCCTCACCTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGCGCGCGGCAGGGGGGTTCGCACACGCGCTCCTCCTTCCTCACCTTCCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTGCGGCCTCGTCCTCACCGACTTCCTGGGGCTGCTGGTGACCGGTACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTGCGGCCTCGTCCTCACCGACTTCCTGGGGCTGCTGGTGACCGGTACCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCGTGGTGTCCCAGCACGCCGCGCTCTTCGAGTGGCACGCCGTGGACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCGTGGTGTCCCAGCACGCCGCGCTCTTCGAGTGGCACGCCGTGGACCCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGCTGCCGTCTCTGTCGCTTCATGGGCGTCGTCATGATCTTCTTCGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGCTGCCGTCTCTGTCGCTTCATGGGCGTCGTCATGATCTTCTTCGGCCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GTCCCCGCTGCTGCTGGGGGCCGCCATGGCCTCAGAGCGCTACCTGGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GTCCCCGCTGCTGCTGGGGGCCGCCATGGCCTCAGAGCGCTACCTGGGTA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCACCCGGCCCTTCTCGCGCCCGGCGGTCGCCTCGCAGCGCCGCGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TCACCCGGCCCTTCTCGCGCCCGGCGGTCGCCTCGCAGCGCCGCGCCTGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GCCACCGTGGGGCTGGTGTGGGCGGCCGCGCTGGCGCTGGGTCTGCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
 100451 GCCACCGTGGGGCTGGTGTGGGCGGCCGCGCTGGCGCTGGGCCTGCTGCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CCTGCTGGGCGTGGGTCGCTACACCGTGCAATACCCGGGGTCCTGGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CCTGCTGGGCGTGGGTCGCTACACCGTGCAATACCCGGGGTCCTGGTGCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TCCTGACGCTGGGCGCCGAGTCCGGGGACGTGGCCTTCGGGCTGCTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TCCTGACGCTGGGCGCCGAGTCCGGGGACGTGGCCTTCGGGCTGCTCTTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TCCATGCTGGGCGGCCTCTCGGTCGGGCTGTCCTTCCTGCTGAACACGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TCCATGCTGGGCGGCCTCTCGGTCGGGCTGTCCTTCCTGCTGAACACGGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CAGCGTGGCCACCCTGTGCCACGTCTACCACGGGCAGGAGGCGGCCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CAGCGTGGCCACCCTGTGCCACGTCTACCACGGGCAGGAGGCGGCCCAGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AGCGTCCCCGGGACTCCGAGGTGGAGATGATGGCTCAGCTCCTGGGGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AGCGTCCCCGGGACTCCGAGGTGGAGATGATGGCTCAGCTCCTGGGGATC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 ATGGTGGTGGCCAGCGTGTGTTGGCTGCCCCTTCTG         GTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 100751 ATGGTGGTGGCCAGCGTGTGTTGGCTGCCCCTTCTGGTG...CAGGTCTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 CATCGCCCAGACAGTGCTGCGAAACCCGCCTGCCATGAGCCCCGCCGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104707 CATCGCCCAGACAGTGCTGCGAAACCCGCCTGCCATGAGCCCCGCCGGGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 AGCTGTCCCGCACCACGGAGAAGGAGCTGCTCATCTACTTGCGCGTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104757 AGCTGTCCCGCACCACGGAGAAGGAGCTGCTCATCTACTTGCGCGTGGCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 ACCTGGAACCAGATCCTGGACCCCTGGGTGTATATCCTGTTCCGCCGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104807 ACCTGGAACCAGATCCTGGACCCCTGGGTGTATATCCTGTTCCGCCGCGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 CGTGCTCCGGCGTCTCCAGCCTCGCCTCAGCACCCGGCCCAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 104857 CGTGCTCCGGCGTCTCCAGCCTCGCCTCAGCACCCGGCCCAGGTC...TA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    984  ACGGAGTCTCACTCTGTGGCCCAGCCTGGAGTACAGTGGCACGATCTCG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105558 GACGGAGTCTCACTCTGTGGCCCAGCCTGGAGTACAGTGGCACGATCTCG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 GCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCGTGCCTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105608 GCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCGTGCCTCAGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 CTCCCGAGCAGCTGGGATTACAGGCGTAAGCCACTGCGCCCGGCCTTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105658 CTCCCGAGCAGCTGGGATTACAGGCGTAAGCCACTGCGCCCGGCCTTGCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 TGCTCTTTGACCCTGAATTTGACCTACTTGCTGGGGTACAGTTGCTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105708 TGCTCTTTGACCCTGAATTTGACCTACTTGCTGGGGTACAGTTGCTTCCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .
   1183 TTTGAACCTCCAACAGGGAAGGCTCTGTCCAGAAAGGAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105758 TTTGAACCTCCAACAGGGAAGGCTCTGTCCAGAAAGGAT