seq1 = pF1KB6580.tfa, 1209 bp
seq2 = pF1KB6580/gi568815589r_33575443.tfa (gi568815589r:33575443_33776649), 201207 bp

>pF1KB6580 1209
>gi568815589r:33575443_33776649 (Chr9)

(complement)

1-1209  (99999-101207)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACAGCCATCATCAAAGAGATCGTTAGCAGAAACAAAAGGAGATATCA
        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99999 AGGACAGCCATCATCAAAGAGATCGTTAGCAGAAACAAAAGGAGATATCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGAGGATGGATTCGACTTAGACTTGACCTATATTTATCCAAACATTATTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
 100049 AGAGGATGGATTCGACTTAGACTTGACCTATATTTATCTAAACATTATTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTATGGGATTTCCTGCAGAAAGACTTGAAGGCGTATACAGGAACAATATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100099 CTATGGGATTTCCTGCAGAAAGACTTGAAGGCGTATACAGGAACAATATT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GATGATGTAGTAAGGTTTTTGGATTCAAAGCATAAAAACCATTACAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100149 GATGATGTAGTAAGGTTTTTGGATTCAAAGCATAAAAACCATTACAAGAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 ATACAATCTTTGTGCTGAAAGACATTATGACACCGCCAAATTTAATTGCA
        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||
 100199 ACACAATCTTTGTGCTGAAAGACATTATGACACCGCCAAATCTAATTACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GAGTTGCACAATATCCTTTTGAAGACCATAACCCACCACAGCTAGAACTT
        ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100249 GAGTTGCGCAATATCCTTTTGAAGACCATAACCCACCACAGCTAGAACTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATCAAACCCTTTTGTGAAGATCTTGACCAATGGCTAAGTGAAGATGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100299 ATCAAACCCTTTTGTGAAGATCTTGACCAATGGCTAAGTGAAGATGACAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TCATGTTGCAGCAATTCACTGTAAAGCTGGAAAGGGACGAACTGGTGTAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
 100349 TCATGTTGCAGCAATTCACTGTAAAGCTGGAAAGGGACGAACTGGTATAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGATATGTGCATATTTATTACATCGGGGCAAATTTTTAAAGGCACAAGAG
        |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100399 TGATTTATGCATATTTATTACATCGGGGCAAATTTTTAAAGGCACAAGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GCCCTAGATTTCTATGGGGAAGTAAGGACCAGAGACAAAAAGGGAGTAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100449 GCCCTAGATTTCTATGGGGAAGTAAGGACCAGAGACAAAAAGGGAGTAAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TATTCCCAGTCAGAGGCGCTATGTGTATTATTATAGCTACCTGTTAAAGA
        |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||
 100499 TATTCCCAGTCAGAGGCGCTATGTGTATTACTATAGCTACCTGGTAAAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ATCATCTGGATTATAGACCAGTGGCACTGTTGTTTCACAAGATGATGTTT
        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100549 ATCATGTGGATTATAGACCAGTGGCACTGTTGTTTCACAAGATGATGTTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GAAACTATTCCAATGTTCAGTGGCGGAACTTGCAATCCTCAGTTTGTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100599 GAAACTATTCCAATGTTCAGTGGCGGAACTTGCAATCCTCAGTTTGTGGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTGCCAGCTAAAGGTGAAGATATATTCCTCCAATTCAGGACCCACACGAC
        ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| 
 100649 CTGCCAGCTAAAGGTGAAGATGTATTCCTCCAATTCAGGACCCACACGAT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GGGAAGACAAGTTCATGTACTTTGAGTTCCCTCAGCCGTTACCTGTGTGT
        |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
 100699 GGGAGGACAAGTTCATGTATTTTGAGTTCCCTCAGCCGTTACCTGTGTGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GGTGATATCAAAGTAGAGTTCTTCCACAAACAGAACAAGATGCTAAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100749 GGTGATATCAAAGTAGAGTTCTTCCACAAACAGAACAAGATGCTAAAAAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GGACAAAATGTTTCACTTTTGGGTAAATACATTCTTCATACCAGGACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100799 GGACAAAATGTTTCACTTTTGGGTAAATACATTCTTCATACCAGGACCAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 AGGAAACCTCAGAAAAAGTAGAAAATGGAAGTCTATGTGATCAAGAAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
 100849 AGGAAACCTCAGAAAAAGTAGAAAATGGAAGTCTATGTGATCAAGAAATT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GATAGCATTTGCAGTATAGAGCGTGCAGATAATGACAAGGAATATCTAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
 100899 GATAGCATTTGCAGTATAGAGCGTGCAGATAATGACAAGGAGTATCTAGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 ACTTACTTTAACAAAAAATGATCTTGACAAAGCAAATAAAGACAAAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100949 ACTTACTTTAACAAAAAATGATCTTGACAAAGCAAATAAAGACAAAGCCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 ACCGATACTTTTCTCCAAATTTTAAGGTGAAGCTGTACTTCACAAAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100999 ACCGATACTTTTCTCCAAATTTTAAGGTGAAGCTGTACTTCACAAAAACA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GTAGAGGAGCCGTCAAATCCAGAGGCTAGCAGTTCAACTTCTGTAACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101049 GTAGAGGAGCCGTCAAATCCAGAGGCTAGCAGTTCAACTTCTGTAACACC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 AGATGTTAGTGACAATGAACCTGATCATTATAGATATTCTGACACCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101099 AGATGTTAGTGACAATGAACCTGATCATTATAGATATTCTGACACCACTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 ACTCTGATCCAGAGAATGAACCTTTTGATGAAGATCAGCATACACAAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101149 ACTCTGATCCAGAGAATGAACCTTTTGATGAAGATCAGCATACACAAATT

   1200     .
   1201 ACAAAAGTC
        |||||||||
 101199 ACAAAAGTC