seq1 = pF1KB6563.tfa, 1122 bp
seq2 = pF1KB6563/gi568815579f_3036451.tfa (gi568815579f:3036451_3263016), 226566 bp

>pF1KB6563 1122
>gi568815579f:3036451_3263016 (Chr19)

1-145  (100001-100145)   100% ->
146-330  (112141-112325)   100% ->
331-485  (113681-113835)   100% ->
486-614  (115257-115385)   100% ->
615-744  (119373-119502)   100% ->
745-898  (121278-121431)   100% ->
899-1122  (126343-126566)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCCGCTCGCTGACCTGGCGCTGCTGCCCCTGGTGCCTGACGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCCGCTCGCTGACCTGGCGCTGCTGCCCCTGGTGCCTGACGGAGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGAGAAGGCCGCCGCCCGGGTGGACCAGGAGATCAACAGGATCCTCTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGAGAAGGCCGCCGCCCGGGTGGACCAGGAGATCAACAGGATCCTCTTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGCAGAAGAAGCAGGACCGCGGGGAGCTGAAGCTGCTGCTTTTGG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 100101 AGCAGAAGAAGCAGGACCGCGGGGAGCTGAAGCTGCTGCTTTTGGGTG..

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    146     GCCCAGGCGAGAGCGGGAAGAGCACCTTCATCAAGCAGATGCGGAT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 .CAGGCCCAGGCGAGAGCGGGAAGAGCACCTTCATCAAGCAGATGCGGAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CATCCACGGCGCCGGCTACTCGGAGGAGGAGCGCAAGGGCTTCCGGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112187 CATCCACGGCGCCGGCTACTCGGAGGAGGAGCGCAAGGGCTTCCGGCCCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGGTCTACCAGAACATCTTCGTGTCCATGCGGGCCATGATCGAGGCCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112237 TGGTCTACCAGAACATCTTCGTGTCCATGCGGGCCATGATCGAGGCCATG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GAGCGGCTGCAGATTCCATTCAGCAGGCCCGAGAGCAAG         CA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 112287 GAGCGGCTGCAGATTCCATTCAGCAGGCCCGAGAGCAAGGTG...CAGCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CCACGCTAGCCTGGTCATGAGCCAGGACCCCTATAAAGTGACCACGTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113683 CCACGCTAGCCTGGTCATGAGCCAGGACCCCTATAAAGTGACCACGTTTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AGAAGCGCTACGCTGCGGCCATGCAGTGGCTGTGGAGGGATGCCGGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113733 AGAAGCGCTACGCTGCGGCCATGCAGTGGCTGTGGAGGGATGCCGGCATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CGGGCCTGCTATGAGCGTCGGCGGGAATTCCACCTGCTCGATTCAGCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113783 CGGGCCTGCTATGAGCGTCGGCGGGAATTCCACCTGCTCGATTCAGCCGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GTA         CTACCTGTCCCACCTGGAGCGCATCACCGAGGAGGGCT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113833 GTAGTG...CAGCTACCTGTCCCACCTGGAGCGCATCACCGAGGAGGGCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 ACGTCCCCACAGCTCAGGACGTGCTCCGCAGCCGCATGCCCACCACTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115295 ACGTCCCCACAGCTCAGGACGTGCTCCGCAGCCGCATGCCCACCACTGGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 ATCAACGAGTACTGCTTCTCCGTGCAGAAAACCAACCTGCG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 115345 ATCAACGAGTACTGCTTCTCCGTGCAGAAAACCAACCTGCGGTG...TAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GATCGTGGACGTCGGGGGCCAGAAGTCAGAGCGTAAGAAATGGATCCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119373 GATCGTGGACGTCGGGGGCCAGAAGTCAGAGCGTAAGAAATGGATCCATT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 GTTTCGAGAACGTGATCGCCCTCATCTACCTGGCCTCACTGAGTGAATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119423 GTTTCGAGAACGTGATCGCCCTCATCTACCTGGCCTCACTGAGTGAATAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GACCAGTGCCTGGAGGAGAACAACCAGGAG         AACCGCATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 119473 GACCAGTGCCTGGAGGAGAACAACCAGGAGGTG...CAGAACCGCATGAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GGAGAGCCTCGCATTGTTTGGGACTATCCTGGAACTACCCTGGTTCAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121289 GGAGAGCCTCGCATTGTTTGGGACTATCCTGGAACTACCCTGGTTCAAAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 GCACATCCGTCATCCTCTTTCTCAACAAAACCGACATCCTGGAGGAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121339 GCACATCCGTCATCCTCTTTCTCAACAAAACCGACATCCTGGAGGAGAAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 ATCCCCACCTCCCACCTGGCTACCTATTTCCCCAGTTTCCAGG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 121389 ATCCCCACCTCCCACCTGGCTACCTATTTCCCCAGTTTCCAGGGTA...C

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    899   GCCCTAAGCAGGATGCTGAGGCAGCCAAGAGGTTCATCCTGGACATGT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126341 AGGCCCTAAGCAGGATGCTGAGGCAGCCAAGAGGTTCATCCTGGACATGT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 ACACGAGGATGTACACCGGGTGCGTGGACGGCCCCGAGGGCAGCAAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126391 ACACGAGGATGTACACCGGGTGCGTGGACGGCCCCGAGGGCAGCAAGAAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 GGCGCACGATCCCGACGCCTCTTCAGCCACTACACATGTGCCACAGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126441 GGCGCACGATCCCGACGCCTCTTCAGCCACTACACATGTGCCACAGACAC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 ACAGAACATCCGCAAGGTCTTCAAGGACGTGCGGGACTCGGTGCTCGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126491 ACAGAACATCCGCAAGGTCTTCAAGGACGTGCGGGACTCGGTGCTCGCCC

   1150     .    :    .    :    .
   1097 GCTACCTGGACGAGATCAACCTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||
 126541 GCTACCTGGACGAGATCAACCTGCTG