seq1 = pF1KB6550.tfa, 1176 bp
seq2 = pF1KB6550/gi568815591f_139260262.tfa (gi568815591f:139260262_139522337), 262076 bp

>pF1KB6550 1176
>gi568815591f:139260262_139522337 (Chr7)

1-61  (100001-100061)   100% ->
62-156  (115801-115895)   100% ->
157-255  (138338-138436)   100% ->
256-366  (141876-141986)   100% ->
367-510  (145383-145526)   100% ->
511-687  (146913-147089)   100% ->
688-779  (149302-149393)   100% ->
780-809  (152290-152319)   100% ->
810-1001  (157277-157468)   100% ->
1002-1176  (161902-162076)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCGGCGCAGGCCCAGATGCGCGCGATGCTGGACCAGTTGATGGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCGGCGCAGGCCCAGATGCGCGCGATGCTGGACCAGTTGATGGGCAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTCCCGGGACG         GAGATACAACTCGTCAACGAATCAAATTCA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTCCCGGGACGGTA...CAGGAGATACAACTCGTCAACGAATCAAATTCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GTGATGACAGAGTATGCAAGAGTCACCTTCTCAACTGTTGTCCTCATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115831 GTGATGACAGAGTATGCAAGAGTCACCTTCTCAACTGTTGTCCTCATGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTCCTTTCTGGAACT         AGAATGGATCTTGGAGAATGTCTGAA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 115881 GTCCTTTCTGGAACTGTA...CAGAGAATGGATCTTGGAGAATGTCTGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 AGTCCATGACCTGGCTTTAAGAGCGGATTATGAAATTGCATCCAAAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138364 AGTCCATGACCTGGCTTTAAGAGCGGATTATGAAATTGCATCCAAAGAAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AAGATTTTTTCTTTGAACTTGAT         GCCATGGATCATCTGCAG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 138414 AAGATTTTTTCTTTGAACTTGATGTA...TAGGCCATGGATCATCTGCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 TCATTCATTGCAGATTGTGATCGTAGAACAGAAGTGGCCAAGAAAAGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141894 TCATTCATTGCAGATTGTGATCGTAGAACAGAAGTGGCCAAGAAAAGATT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 AGCAGAAACTCAAGAAGAGATTAGTGCTGAAGTAGCAGCAAAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 141944 AGCAGAAACTCAAGAAGAGATTAGTGCTGAAGTAGCAGCAAAGGTA...T

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    367   GCAGAACGTGTTCATGAGTTAAATGAAGAAATTGGTAAATTGTTAGCC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145381 AGGCAGAACGTGTTCATGAGTTAAATGAAGAAATTGGTAAATTGTTAGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 AAGGTGGAACAACTAGGAGCTGAAGGGAATGTGGAGGAATCCCAGAAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145431 AAGGTGGAACAACTAGGAGCTGAAGGGAATGTGGAGGAATCCCAGAAAGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 AATGGATGAAGTAGAGAAAGCACGGGCAAAGAAAAGAGAAGCAGAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 145481 AATGGATGAAGTAGAGAAAGCACGGGCAAAGAAAAGAGAAGCAGAGGTA.

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    511      GAAGTTTATCGGAATTCTATGCCAGCTTCCAGTTTTCAGCAGCAG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145531 ..TAGGAAGTTTATCGGAATTCTATGCCAGCTTCCAGTTTTCAGCAGCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 AAACTTCGAGTCTGTGAAGTCTGCTCTGCCTATTTAGGACTTCATGATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146958 AAACTTCGAGTCTGTGAAGTCTGCTCTGCCTATTTAGGACTTCATGATAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TGACAGACGACTGGCTGATCATTTTGGGGGTAAACTGCACCTGGGATTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147008 TGACAGACGACTGGCTGATCATTTTGGGGGTAAACTGCACCTGGGATTTA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TTGAAATAAGAGAGAAGCTTGAAGAATTAAAG         AGAGTCGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 147058 TTGAAATAAGAGAGAAGCTTGAAGAATTAAAGGTA...AAGAGAGTCGTA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 GCTGAGAAGCAGGAGAAAAGAAACCAGGAACGGCTGAAACGAAGAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149311 GCTGAGAAGCAGGAGAAAAGAAACCAGGAACGGCTGAAACGAAGAGAAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 GAGAGAGAGAGAAGAAAGGGAGAAGCTGAGGAG         GTCCCGAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 149361 GAGAGAGAGAGAAGAAAGGGAGAAGCTGAGGAGGTA...TAGGTCCCGAT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 CACACAGCAAGAATCCAAAAAG         ATCCAGGTCCAGAGAGCAT
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 152298 CACACAGCAAGAATCCAAAAAGGTA...TAGATCCAGGTCCAGAGAGCAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 CGCAGACATCGATCTCGCTCCATGTCACGTGAACGCAAGAGGAGAACTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157296 CGCAGACATCGATCTCGCTCCATGTCACGTGAACGCAAGAGGAGAACTCG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 ATCCAAATCTCGGGAGAAACGCCATCGCCACAGGTCCCGCTCCAGCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157346 ATCCAAATCTCGGGAGAAACGCCATCGCCACAGGTCCCGCTCCAGCAGCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 GTAGCCGCAGCCGTAGCCACCAGAGAAGTCGGCACAGTTCTAGAGATAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157396 GTAGCCGCAGCCGTAGCCACCAGAGAAGTCGGCACAGTTCTAGAGATAGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 AGCAGAGAACGATCCAAGAGGAG         ATCCTCAAAAGAAAGATT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 157446 AGCAGAGAACGATCCAAGAGGAGGTA...CAGATCCTCAAAAGAAAGATT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 CAGAGACCAAGACTTAGCATCATGTGACAGAGACAGGAGTTCAAGAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161920 CAGAGACCAAGACTTAGCATCATGTGACAGAGACAGGAGTTCAAGAGACA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 GATCACCTCGTGACAGAGATCGGAAAGATAAGAAGCGGTCCTATGAGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161970 GATCACCTCGTGACAGAGATCGGAAAGATAAGAAGCGGTCCTATGAGAGT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 GCTAATGGCAGATCAGAAGACAGGAGGAGCTCTGAAGAGCGCGAAGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162020 GCTAATGGCAGATCAGAAGACAGGAGGAGCTCTGAAGAGCGCGAAGCAGG

   1250     .
   1170 GGAGATC
        |||||||
 162070 GGAGATC