seq1 = pF1KB6483.tfa, 984 bp
seq2 = pF1KB6483/gi568815579f_49428473.tfa (gi568815579f:49428473_49643210), 214738 bp

>pF1KB6483 984
>gi568815579f:49428473_49643210 (Chr19)

1-242  (100001-100242)   100% ->
243-445  (105721-105923)   100% ->
446-618  (108561-108733)   100% ->
619-679  (110647-110707)   100% ->
680-879  (114081-114280)   100% ->
880-984  (114634-114738)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATGTGGCGACCATCAGTTCTGCTGCTTCTGTTGCTACTGAGGCACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATGTGGCGACCATCAGTTCTGCTGCTTCTGTTGCTACTGAGGCACGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCCCAGGGGAAGCCATCCCCAGACGCAGGCCCTCATGGCCAGGGGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCCCAGGGGAAGCCATCCCCAGACGCAGGCCCTCATGGCCAGGGGAGGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGCACCAGGCGGCCCCCCTGAGCGACGCTCCCCATGATGACGCCCACGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGCACCAGGCGGCCCCCCTGAGCGACGCTCCCCATGATGACGCCCACGGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AACTTCCAGTACGACCATGAGGCTTTCCTGGGACGGGAAGTGGCCAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AACTTCCAGTACGACCATGAGGCTTTCCTGGGACGGGAAGTGGCCAAGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 ATTCGACCAACTCACCCCAGAGGAAAGCCAGGCCCGTCTGGG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 100201 ATTCGACCAACTCACCCCAGAGGAAAGCCAGGCCCGTCTGGGGTA...TA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    243  GCGGATCGTGGACCGCATGGACCGCGCGGGGGACGGCGACGGCTGGGTG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105720 GGCGGATCGTGGACCGCATGGACCGCGCGGGGGACGGCGACGGCTGGGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TCGCTGGCCGAGCTTCGCGCGTGGATCGCGCACACGCAGCAGCGGCACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105770 TCGCTGGCCGAGCTTCGCGCGTGGATCGCGCACACGCAGCAGCGGCACAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 ACGGGACTCGGTGAGCGCGGCCTGGGACACGTACGACACGGACCGCGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105820 ACGGGACTCGGTGAGCGCGGCCTGGGACACGTACGACACGGACCGCGACG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GGCGTGTGGGTTGGGAGGAGCTGCGCAACGCCACCTATGGCCACTACGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105870 GGCGTGTGGGTTGGGAGGAGCTGCGCAACGCCACCTATGGCCACTACGCG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CCCG         GTGAAGAATTTCATGACGTGGAGGATGCAGAGACCTA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105920 CCCGGTA...CAGGTGAAGAATTTCATGACGTGGAGGATGCAGAGACCTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CAAAAAGATGCTGGCTCGGGACGAGCGGCGTTTCCGGGTGGCCGACCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108598 CAAAAAGATGCTGGCTCGGGACGAGCGGCGTTTCCGGGTGGCCGACCAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 ATGGGGACTCGATGGCCACTCGAGAGGAGCTGACAGCCTTCCTGCACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108648 ATGGGGACTCGATGGCCACTCGAGAGGAGCTGACAGCCTTCCTGCACCCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GAGGAGTTCCCTCACATGCGGGACATCGTGATTGCT         GAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 108698 GAGGAGTTCCCTCACATGCGGGACATCGTGATTGCTGTG...CAGGAAAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CCTGGAGGACCTGGACAGAAACAAAGATGGCTATGTCCAGGTGGAGGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110652 CCTGGAGGACCTGGACAGAAACAAAGATGGCTATGTCCAGGTGGAGGAGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 ACATCG         CGGATCTGTACTCAGCCGAGCCTGGGGAGGAGGAG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110702 ACATCGGTG...CAGCGGATCTGTACTCAGCCGAGCCTGGGGAGGAGGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 CCGGCGTGGGTGCAGACGGAGAGGCAGCAGTTCCGGGACTTCCGGGATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114116 CCGGCGTGGGTGCAGACGGAGAGGCAGCAGTTCCGGGACTTCCGGGATCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 GAACAAGGATGGGCACCTGGATGGGAGTGAGGTGGGCCACTGGGTGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114166 GAACAAGGATGGGCACCTGGATGGGAGTGAGGTGGGCCACTGGGTGCTGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 CCCCTGCCCAGGACCAGCCCCTGGTGGAAGCCAACCACCTGCTGCACGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114216 CCCCTGCCCAGGACCAGCCCCTGGTGGAAGCCAACCACCTGCTGCACGAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 AGCGACACGGACAAG         GATGGGCGGCTGAGCAAAGCGGAAAT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 114266 AGCGACACGGACAAGGTG...CAGGATGGGCGGCTGAGCAAAGCGGAAAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 CCTGGGTAATTGGAACATGTTTGTGGGCAGTCAGGCCACCAACTATGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114660 CCTGGGTAATTGGAACATGTTTGTGGGCAGTCAGGCCACCAACTATGGCG

   1000     .    :    .    :    .
    956 AGGACCTGACCCGGCACCACGATGAGCTG
        |||||||||||||||||||||||||||||
 114710 AGGACCTGACCCGGCACCACGATGAGCTG