seq1 = pF1KB6482.tfa, 1068 bp
seq2 = pF1KB6482/gi568815579f_38800033.tfa (gi568815579f:38800033_39008829), 208797 bp

>pF1KB6482 1068
>gi568815579f:38800033_39008829 (Chr19)

1-179  (100001-100179)   100% ->
180-285  (104983-105088)   100% ->
286-619  (105170-105503)   100% ->
620-708  (107189-107277)   100% ->
709-969  (107367-107627)   100% ->
970-1068  (108699-108797)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGGGGTCGCGTGCTTGGGAAAAGCTGCCGACGCAGATGAATGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTGGGGTCGCGTGCTTGGGAAAAGCTGCCGACGCAGATGAATGGTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGACAGCGGCCTGGGCTCCCTGGGTCCGGACGCAGCGGCCCCCGGAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGACAGCGGCCTGGGCTCCCTGGGTCCGGACGCAGCGGCCCCCGGAGGAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTGGGTTGGGCGCGGAGTTGGGCCCGGGGCTGTCGTGGGCTCCCCTCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTGGGTTGGGCGCGGAGTTGGGCCCGGGGCTGTCGTGGGCTCCCCTCGTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTCGGCTACGTCACTGAGGATGGGGACAC         GGCACTGCACTT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100151 TTCGGCTACGTCACTGAGGATGGGGACACGTG...CAGGGCACTGCACTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGCTGTGATTCATCAGCATGAACCCTTCCTGGATTTTCTTCTAGGCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104995 GGCTGTGATTCATCAGCATGAACCCTTCCTGGATTTTCTTCTAGGCTTCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CGGCCGGCACTGAGTACATGGACCTGCAGAATGACCTAGGCCAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 105045 CGGCCGGCACTGAGTACATGGACCTGCAGAATGACCTAGGCCAGGTG...

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    286    ACAGCCCTGCACCTGGCAGCCATCCTGGGGGAGACATCCACGGTGGA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105167 CAGACAGCCCTGCACCTGGCAGCCATCCTGGGGGAGACATCCACGGTGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GAAGCTGTACGCAGCAGGCGCCGGGCTGTGTGTGGCGGAGCGTAGGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105217 GAAGCTGTACGCAGCAGGCGCCGGGCTGTGTGTGGCGGAGCGTAGGGGCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ACACGGCGCTGCACCTGGCCTGCCGTGTGGGGGCACACGCCTGTGCCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105267 ACACGGCGCTGCACCTGGCCTGCCGTGTGGGGGCACACGCCTGTGCCCGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GCCCTGCTTCAGCCCCGCCCCCGGCGCCCCAGGGAAGCCCCCGACACCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105317 GCCCTGCTTCAGCCCCGCCCCCGGCGCCCCAGGGAAGCCCCCGACACCTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CCTCGCTCAGGGCCCTGACCGTACTCCCGACACCAACCATACCCCTGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105367 CCTCGCTCAGGGCCCTGACCGTACTCCCGACACCAACCATACCCCTGTCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CCTTGTACCCCGATTCCGACTTGGAGAAGGAAGAAGAGGAGAGTGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105417 CCTTGTACCCCGATTCCGACTTGGAGAAGGAAGAAGAGGAGAGTGAGGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GACTGGAAGCTGCAGCTGGAGGCTGAAAACTACGAGG         GCCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 105467 GACTGGAAGCTGCAGCTGGAGGCTGAAAACTACGAGGGTG...CAGGCCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CACCCCACTCCACGTGGCCGTTATCCACAAAGATGTGGAGATGGTCCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107193 CACCCCACTCCACGTGGCCGTTATCCACAAAGATGTGGAGATGGTCCGGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 TGCTCCGAGATGCTGGAGCTGACCTTGACAAACCG         GAGCCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 107243 TGCTCCGAGATGCTGGAGCTGACCTTGACAAACCGGTG...CAGGAGCCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 ACGTGCGGCCGGAGCCCCCTTCATTTGGCAGTGGAGGCCCAGGCAGCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107373 ACGTGCGGCCGGAGCCCCCTTCATTTGGCAGTGGAGGCCCAGGCAGCCGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 TGTGCTGGAGCTTCTCCTGAGGGCAGGCGCGAACCCTGCTGCCCGCATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107423 TGTGCTGGAGCTTCTCCTGAGGGCAGGCGCGAACCCTGCTGCCCGCATGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 ACGGTGGCCGCACCCCACTCGGCAGTGCCATGCTCCGGCCCAACCCCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107473 ACGGTGGCCGCACCCCACTCGGCAGTGCCATGCTCCGGCCCAACCCCATC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 CTCGCCCGCCTCCTCCGTGCACACGGAGCCCCTGAGCCCGAGGGCGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107523 CTCGCCCGCCTCCTCCGTGCACACGGAGCCCCTGAGCCCGAGGGCGAGGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 CGAGAAATCCGGCCCCTGCAGCAGCAGTAGCGACAGCGACAGCGGAGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107573 CGAGAAATCCGGCCCCTGCAGCAGCAGTAGCGACAGCGACAGCGGAGACG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 AGGGC         GATGAATACGACGACATTGTGGTTCACAGCAGCCGC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107623 AGGGCGTG...CAGGATGAATACGACGACATTGTGGTTCACAGCAGCCGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 AGCCAAACCCGGCTGCCTCCCACCCCAGCCTCAAAACCTCTTCCTGACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108735 AGCCAAACCCGGCTGCCTCCCACCCCAGCCTCAAAACCTCTTCCTGACGA

   1100     .    :
   1056 CCCCCGCCCCGTG
        |||||||||||||
 108785 CCCCCGCCCCGTG