seq1 = pF1KB6480.tfa, 1011 bp
seq2 = pF1KB6480/gi568815577f_33303544.tfa (gi568815577f:33303544_33536959), 233416 bp

>pF1KB6480 1011
>gi568815577f:33303544_33536959 (Chr21)

1-73  (100001-100073)   100% ->
74-206  (111345-111477)   100% ->
207-412  (117937-118142)   100% ->
413-561  (123341-123489)   100% ->
562-721  (128634-128793)   100% ->
722-879  (129171-129328)   100% ->
880-1011  (133285-133416)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCGACCGACGCTGCTGTGGTCGCTGCTGCTGCTGCTCGGAGTCTTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCGACCGACGCTGCTGTGGTCGCTGCTGCTGCTGCTCGGAGTCTTCGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGCCGCCGCCGCGGCCCCGCCAG         ACCCTCTTTCCCAGCTGC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100051 CGCCGCCGCCGCGGCCCCGCCAGGTG...AAGACCCTCTTTCCCAGCTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CCGCTCCTCAGCACCCGAAGATTCGCCTGTACAACGCAGAGCAGGTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111363 CCGCTCCTCAGCACCCGAAGATTCGCCTGTACAACGCAGAGCAGGTCCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AGTTGGGAGCCAGTGGCCCTGAGCAATAGCACGAGGCCTGTTGTCTACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111413 AGTTGGGAGCCAGTGGCCCTGAGCAATAGCACGAGGCCTGTTGTCTACCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGTGCAGTTTAAATA         CACCGACAGTAAATGGTTCACGGCCG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 111463 AGTGCAGTTTAAATAGTA...CAGCACCGACAGTAAATGGTTCACGGCCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ACATCATGTCCATAGGGGTGAATTGTACACAGATCACAGCAACAGAGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117963 ACATCATGTCCATAGGGGTGAATTGTACACAGATCACAGCAACAGAGTGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GACTTCACTGCCGCCAGTCCCTCAGCAGGCTTCCCAATGGATTTCAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118013 GACTTCACTGCCGCCAGTCCCTCAGCAGGCTTCCCAATGGATTTCAATGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CACTCTACGCCTTCGAGCTGAGCTGGGAGCACTCCATTCTGCCTGGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118063 CACTCTACGCCTTCGAGCTGAGCTGGGAGCACTCCATTCTGCCTGGGTGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CAATGCCTTGGTTTCAACACTATCGGAATG         TGACTGTCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 118113 CAATGCCTTGGTTTCAACACTATCGGAATGGTA...CAGTGACTGTCGGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CCTCCAGAAAACATTGAGGTGACCCCAGGAGAAGGCTCCCTCATCATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123352 CCTCCAGAAAACATTGAGGTGACCCCAGGAGAAGGCTCCCTCATCATCAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GTTCTCCTCTCCCTTTGACATCGCTGATACCTCCACGGCCTTTTTTTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123402 GTTCTCCTCTCCCTTTGACATCGCTGATACCTCCACGGCCTTTTTTTGTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 ATTATGTCCATTACTGGGAAAAAGGAGGAATCCAACAG         GTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 123452 ATTATGTCCATTACTGGGAAAAAGGAGGAATCCAACAGGCA...CAGGTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 AAAGGCCCTTTCAGAAGCAACTCCATTTCATTGGATAACTTAAAACCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128637 AAAGGCCCTTTCAGAAGCAACTCCATTTCATTGGATAACTTAAAACCCTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CAGAGTGTACTGTTTACAAGTCCAGGCACAACTGCTTTGGAACAAAAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128687 CAGAGTGTACTGTTTACAAGTCCAGGCACAACTGCTTTGGAACAAAAGTA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 ACATCTTTAGAGTCGGGCATTTAAGCAACATATCTTGCTACGAAACAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128737 ACATCTTTAGAGTCGGGCATTTAAGCAACATATCTTGCTACGAAACAATG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GCAGATG         CCTCCACTGAGCTTCAGCAAGTCATCCTGATCTC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128787 GCAGATGGTA...TAGCCTCCACTGAGCTTCAGCAAGTCATCCTGATCTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CGTGGGAACATTTTCGTTGCTGTCGGTGCTGGCAGGAGCCTGTTTCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129205 CGTGGGAACATTTTCGTTGCTGTCGGTGCTGGCAGGAGCCTGTTTCTTCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TGGTCCTGAAATATAGAGGCCTGATTAAATACTGGTTTCACACTCCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129255 TGGTCCTGAAATATAGAGGCCTGATTAAATACTGGTTTCACACTCCACCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 AGCATCCCATTACAGATAGAAGAG         TATTTAAAAGACCCAAC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 129305 AGCATCCCATTACAGATAGAAGAGGTA...AAGTATTTAAAAGACCCAAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 TCAGCCCATCTTAGAGGCCTTGGACAAGGACAGCTCACCAAAGGATGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133302 TCAGCCCATCTTAGAGGCCTTGGACAAGGACAGCTCACCAAAGGATGACG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 TCTGGGACTCTGTGTCCATTATCTCGTTTCCGGAAAAGGAGCAAGAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133352 TCTGGGACTCTGTGTCCATTATCTCGTTTCCGGAAAAGGAGCAAGAAGAT

   1050     .    :    .
    997 GTTCTCCAAACGCTT
        |||||||||||||||
 133402 GTTCTCCAAACGCTT