seq1 = pF1KB6457.tfa, 954 bp
seq2 = pF1KB6457/gi568815592r_89229682.tfa (gi568815592r:89229682_89443757), 214076 bp

>pF1KB6457 954
>gi568815592r:89229682_89443757 (Chr6)

(complement)

1-31  (91189-91219)   100% ->
32-105  (100002-100075)   100% ->
106-237  (101303-101434)   100% ->
238-322  (105215-105299)   100% ->
323-428  (105448-105553)   100% ->
429-558  (108327-108456)   100% ->
559-678  (110553-110672)   100% ->
679-954  (113801-114076)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGACCCGCTACAACCTGAAGAGTCCGG         CTGTTAAACG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
  91189 ATGGAGACCCGCTACAACCTGAAGAGTCCGGGTG...TAGCTGTTAAACG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 TTTAATGAAAGAAGCGGCAGAATTGAAAGATCCAACAGATCATTACCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100012 TTTAATGAAAGAAGCGGCAGAATTGAAAGATCCAACAGATCATTACCATG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CGCAGCCTTTAGAG         GATAACCTTTTTGAATGGCACTTCACG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 100062 CGCAGCCTTTAGAGGTT...CAGGATAACCTTTTTGAATGGCACTTCACG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 GTTAGAGGGCCCCCAGACTCCGATTTTGATGGAGGAGTTTATCACGGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101330 GTTAGAGGGCCCCCAGACTCCGATTTTGATGGAGGAGTTTATCACGGGCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GATAGTACTGCCACCAGAGTATCCCATGAAACCACCAAGCATTATTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101380 GATAGTACTGCCACCAGAGTATCCCATGAAACCACCAAGCATTATTCTCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TAACG         GCTAATGGTCGATTTGAAGTGGGCAAGAAAATCTGT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101430 TAACGGTA...CAGGCTAATGGTCGATTTGAAGTGGGCAAGAAAATCTGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 TTGAGCATCTCAGGCCATCATCCTGAAACTTGGCAGCCTTCGTGGAGTA 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 105251 TTGAGCATCTCAGGCCATCATCCTGAAACTTGGCAGCCTTCGTGGAGTAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    323         TAAGGACAGCATTATTAGCCATCATTGGGTTTATGCCAACAA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105301 TA...CAGTAAGGACAGCATTATTAGCCATCATTGGGTTTATGCCAACAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 AAGGAGAGGGAGCCATAGGTTCTCTAGATTACACTCCTGAGGAAAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105490 AAGGAGAGGGAGCCATAGGTTCTCTAGATTACACTCCTGAGGAAAGAAGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GCACTTGCCAAAAA         ATCACAAGATTTCTGTTGTGAAGGATG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 105540 GCACTTGCCAAAAAGTA...TAGATCACAAGATTTCTGTTGTGAAGGATG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 TGGCTCTGCCATGAAGGATGTCCTGTTGCCTTTAAAATCTGGAAGCGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108354 TGGCTCTGCCATGAAGGATGTCCTGTTGCCTTTAAAATCTGGAAGCGATT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 CAAGCCAAGCTGACCAAGAAGCCAAAGAACTGGCTAGGCAAATAAGCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108404 CAAGCCAAGCTGACCAAGAAGCCAAAGAACTGGCTAGGCAAATAAGCTTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 AAG         GCAGAAGTCAATTCATCTGGAAAGACTATCTCTGAGTC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108454 AAGGTA...TAGGCAGAAGTCAATTCATCTGGAAAGACTATCTCTGAGTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 AGACTTAAACCACTCTTTTTCACTAACTGATTTACAAGATGATATACCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110591 AGACTTAAACCACTCTTTTTCACTAACTGATTTACAAGATGATATACCTA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 CAACATTCCAGGGTGCTACGGCCAGTACATCG         TACGGAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||| ||
 110641 CAACATTCCAGGGTGCTACGGCCAGTACATCGGTA...TAGTACGGACTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 CAGAATTCCTCAGCAGCATCCTTTCATCAACCTACCCAACCTGTAGCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113810 CAGAATTCCTCAGCAGCATCCTTTCATCAACCTACCCAACCTGTAGCTAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 GAATACCTCCATGAGCCCTCGACAGCGCCGGGCCCAGCAGCAGAGTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113860 GAATACCTCCATGAGCCCTCGACAGCGCCGGGCCCAGCAGCAGAGTCAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 GAAGGTTGTCTACTTCACCAGATGTAATCCAGGGCCACCAGCCAAGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113910 GAAGGTTGTCTACTTCACCAGATGTAATCCAGGGCCACCAGCCAAGAGAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 AACCACACTGATCATGGTGGGTCAGCTGTACTGATTGTCATCCTGACTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113960 AACCACACTGATCATGGTGGGTCAGCTGTACTGATTGTCATCCTGACTTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 GGCATTGGCAGCTCTTATATTCCGACGAATATATCTGGCAAACGAATACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114010 GGCATTGGCAGCTCTTATATTCCGACGAATATATCTGGCAAACGAATACA

   1000     .    :    .
    938 TATTTGACTTTGAGTTA
        |||||||||||||||||
 114060 TATTTGACTTTGAGTTA