seq1 = pF1KB6452.tfa, 1050 bp
seq2 = pF1KB6452/gi568815582r_58064074.tfa (gi568815582r:58064074_58297736), 233663 bp

>pF1KB6452 1050
>gi568815582r:58064074_58297736 (Chr16)

(complement)

1-104  (100001-100104)   100% ->
105-216  (100893-101004)   100% ->
217-318  (110881-110982)   100% ->
319-369  (113427-113477)   100% ->
370-429  (123227-123286)   100% ->
430-513  (129044-129127)   100% ->
514-624  (129942-130052)   100% ->
625-726  (130429-130530)   100% ->
727-827  (131053-131153)   100% ->
828-976  (132029-132177)   100% ->
977-1050  (133590-133663)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCCGGCCCGGCCGCGGGCAGCAGGGCCCGGGTCTACGCCGAGGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCCGGCCCGGCCGCGGGCAGCAGGGCCCGGGTCTACGCCGAGGTGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAGTCTGAGGAGCCGCGAGTACTGGGACTACGAGGCTCACGTCCCGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAGTCTGAGGAGCCGCGAGTACTGGGACTACGAGGCTCACGTCCCGAGCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGGG         TAATCAAGATGATTACCAACTGGTTCGAAAACTTGGT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGGGGTA...CAGTAATCAAGATGATTACCAACTGGTTCGAAAACTTGGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CGGGGAAAATATAGTGAAGTATTTGAGGCCATTAATATCACCAACAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100930 CGGGGAAAATATAGTGAAGTATTTGAGGCCATTAATATCACCAACAATGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GAGAGTGGTTGTAAAAATCCTGAAG         CCAGTGAAGAAAAAGA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 100980 GAGAGTGGTTGTAAAAATCCTGAAGGTG...AAGCCAGTGAAGAAAAAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGATAAAACGAGAGGTTAAGATTCTGGAGAACCTTCGTGGTGGAACAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110897 AGATAAAACGAGAGGTTAAGATTCTGGAGAACCTTCGTGGTGGAACAAAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ATCATTAAGCTGATTGACACTGTAAAGGACCCCGTG         TCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 110947 ATCATTAAGCTGATTGACACTGTAAAGGACCCCGTGGTA...CAGTCAAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GACACCAGCTTTGGTATTTGAATATATCAATAATACAGATTTTAAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 113432 GACACCAGCTTTGGTATTTGAATATATCAATAATACAGATTTTAAGGTG.

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    370      CAACTCTACCAGATCCTGACAGACTTTGATATCCGGTTTTATATG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113482 ..CAGCAACTCTACCAGATCCTGACAGACTTTGATATCCGGTTTTATATG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 TATGAACTACTTAAA         GCTCTGGATTACTGCCACAGCAAGGG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 123272 TATGAACTACTTAAAGTA...TAGGCTCTGGATTACTGCCACAGCAAGGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 AATCATGCACAGGGATGTGAAACCTCACAATGTCATGATAGATCACCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129070 AATCATGCACAGGGATGTGAAACCTCACAATGTCATGATAGATCACCAAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 AGAAAAAG         CTGCGACTGATAGATTGGGGTCTGGCAGAATTC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 129120 AGAAAAAGGTA...TAGCTGCGACTGATAGATTGGGGTCTGGCAGAATTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 TATCATCCTGCTCAGGAGTACAATGTTCGTGTAGCCTCAAGGTACTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129975 TATCATCCTGCTCAGGAGTACAATGTTCGTGTAGCCTCAAGGTACTTCAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 GGGACCAGAGCTCCTCGTGGACTATCAG         ATGTATGATTATA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 130025 GGGACCAGAGCTCCTCGTGGACTATCAGGTA...CAGATGTATGATTATA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 GCTTGGACATGTGGAGTTTGGGCTGTATGTTAGCAAGCATGATCTTTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130442 GCTTGGACATGTGGAGTTTGGGCTGTATGTTAGCAAGCATGATCTTTCGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 AGGGAACCATTCTTCCATGGACAGGACAACTATGACCAG         CT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 130492 AGGGAACCATTCTTCCATGGACAGGACAACTATGACCAGGTG...CAGCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    729 TGTTCGCATTGCCAAGGTTCTGGGTACAGAAGAACTGTATGGGTATCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131055 TGTTCGCATTGCCAAGGTTCTGGGTACAGAAGAACTGTATGGGTATCTGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 AGAAGTATCACATAGACCTAGATCCACACTTCAACGATATCCTGGGACA 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 131105 AGAAGTATCACATAGACCTAGATCCACACTTCAACGATATCCTGGGACAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    828         ACATTCACGGAAACGCTGGGAAAACTTTATCCATAGTGAGAA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131155 TA...CAGACATTCACGGAAACGCTGGGAAAACTTTATCCATAGTGAGAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    870 CAGACACCTTGTCAGCCCTGAGGCCCTAGATCTTCTGGACAAACTTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132071 CAGACACCTTGTCAGCCCTGAGGCCCTAGATCTTCTGGACAAACTTCTGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 GATACGACCATCAACAGAGACTGACTGCCAAAGAGGCCATGGAGCACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132121 GATACGACCATCAACAGAGACTGACTGCCAAAGAGGCCATGGAGCACCCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 TACTTCT         ACCCTGTGGTGAAGGAGCAGTCCCAGCCTTGTGC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132171 TACTTCTGTG...CAGACCCTGTGGTGAAGGAGCAGTCCCAGCCTTGTGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :
   1011 AGACAATGCTGTGCTTTCCAGTGGTCTCACGGCAGCACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133624 AGACAATGCTGTGCTTTCCAGTGGTCTCACGGCAGCACGA