seq1 = pF1KB6388.tfa, 903 bp
seq2 = pF1KB6388/gi568815579r_49455754.tfa (gi568815579r:49455754_49660691), 204938 bp

>pF1KB6388 903
>gi568815579r:49455754_49660691 (Chr19)

(complement)

1-70  (100001-100070)   100% ->
71-176  (100653-100758)   100% ->
177-258  (101714-101795)   100% ->
259-418  (103443-103602)   100% ->
419-537  (103699-103817)   100% ->
538-725  (103956-104143)   100% ->
726-834  (104267-104375)   100% ->
835-903  (104870-104938)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACGCGGCATGGCAAGAACTGCACCGCAGGGGCCGTCTACACCTACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACGCGGCATGGCAAGAACTGCACCGCAGGGGCCGTCTACACCTACCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGAGAAGAAGAAGGACACAG         CGGCCTCGGGCTATGGGACCC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100051 CGAGAAGAAGAAGGACACAGGTG...CAGCGGCCTCGGGCTATGGGACCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGAACATTCGACTGAGCCGGGATGCCGTGAAGGACTTCGACTGCTGTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100674 AGAACATTCGACTGAGCCGGGATGCCGTGAAGGACTTCGACTGCTGTTGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTCTCCCTGCAGCCTTGCCACGATCCTGTTGTCAC         CCCAGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 100724 CTCTCCCTGCAGCCTTGCCACGATCCTGTTGTCACGTG...CAGCCCAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TGGCTACCTGTATGAGCGTGAGGCCATCCTGGAGTACATTCTGCACCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101720 TGGCTACCTGTATGAGCGTGAGGCCATCCTGGAGTACATTCTGCACCAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGAAGGAGATTGCCCGGCAGATGAAG         GCCTACGAGAAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 101770 AGAAGGAGATTGCCCGGCAGATGAAGGTG...CAGGCCTACGAGAAGCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 CGGGGCACCCGGCGCGAGGAGCAGAAGGAGCTTCAGCGGGCGGCCTCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103458 CGGGGCACCCGGCGCGAGGAGCAGAAGGAGCTTCAGCGGGCGGCCTCGCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GGACCATGTGCGGGGCTTCCTGGAGAAGGAGTCGGCTATCGTGAGCCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103508 GGACCATGTGCGGGGCTTCCTGGAGAAGGAGTCGGCTATCGTGAGCCGGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CCCTCAACCCTTTCACAGCCAAGGCCCTCTCGGGCACCAGCCCAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 103558 CCCTCAACCCTTTCACAGCCAAGGCCCTCTCGGGCACCAGCCCAGGTG..

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    419     ATGATGTCCAACCTGGGCCCAGTGTGGGTCCTCCAAGTAAGGACAA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103608 .CAGATGATGTCCAACCTGGGCCCAGTGTGGGTCCTCCAAGTAAGGACAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GGACAAAGTGCTGCCCAGCTTCTGGATCCCGTCGCTGACGCCCGAAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103745 GGACAAAGTGCTGCCCAGCTTCTGGATCCCGTCGCTGACGCCCGAAGCCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AGGCCACCAAGCTGGAGAAGCCG         TCCCGCACGGTGACCTGC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 103795 AGGCCACCAAGCTGGAGAAGCCGGTG...CAGTCCCGCACGGTGACCTGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 CCCATGTCAGGGAAGCCCCTGCGCATGTCGGACCTGACGCCCGTGCACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103974 CCCATGTCAGGGAAGCCCCTGCGCATGTCGGACCTGACGCCCGTGCACTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CACACCGCTAGACAGCTCCGTGGACCGCGTGGGGCTCATCACCCGCAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104024 CACACCGCTAGACAGCTCCGTGGACCGCGTGGGGCTCATCACCCGCAGCG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 AGCGCTACGTGTGTGCCGTGACCCGCGACAGCCTGAGCAACGCCACCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104074 AGCGCTACGTGTGTGCCGTGACCCGCGACAGCCTGAGCAACGCCACCCCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 TGCGCTGTGCTGCGGCCCTC         TGGGGCTGTGGTCACCCTCGA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 104124 TGCGCTGTGCTGCGGCCCTCGTG...TAGTGGGGCTGTGGTCACCCTCGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 ATGCGTGGAGAAGCTGATTCGGAAGGACATGGTGGACCCTGTGACTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104288 ATGCGTGGAGAAGCTGATTCGGAAGGACATGGTGGACCCTGTGACTGGAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 ACAAACTCACAGACCGCGACATCATCGTGCTGCAGCGG         GGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 104338 ACAAACTCACAGACCGCGACATCATCGTGCTGCAGCGGGTA...CAGGGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 GGTACCGGCTTCGCGGGCTCCGGAGTGAAGCTGCAAGCGGAGAAATCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104873 GGTACCGGCTTCGCGGGCTCCGGAGTGAAGCTGCAAGCGGAGAAATCACG

    950     .    :    .
    888 GCCGGTGATGCAGGCC
        ||||||||||||||||
 104923 GCCGGTGATGCAGGCC