seq1 = pF1KB6387.tfa, 825 bp
seq2 = pF1KB6387/gi568815589r_37680682.tfa (gi568815589r:37680682_37885044), 204363 bp

>pF1KB6387 825
>gi568815589r:37680682_37885044 (Chr9)

(complement)

1-324  (100001-100324)   100% ->
325-474  (100982-101131)   100% ->
475-626  (102908-103059)   99% ->
627-825  (104165-104363)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCGAACCTGCGTCTGTCGCGGCTGAATCTCTCGCGGGCAGCAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCGAACCTGCGTCTGTCGCGGCTGAATCTCTCGCGGGCAGCAGGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCGCGCTGCACGCACAGTACTAGGTCAGGTGGTGCTCCCGGGTGAGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCGCGCTGCACGCACAGTACTAGGTCAGGTGGTGCTCCCGGGTGAGGAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGCTCCTGCCGGAACAGGAGGACGCGGAAGGCCCTGGGGGTGCAGTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGCTCCTGCCGGAACAGGAGGACGCGGAAGGCCCTGGGGGTGCAGTGGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGACCGTTGAGCCTGAATGCTAGAGCGTGCTCGCGGGTGCGCGTTGTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CGACCGTTGAGCCTGAATGCTAGAGCGTGCTCGCGGGTGCGCGTTGTATG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGGTCCGGGCCTTCGGCGCTGTGGGGACCGCCTGCTGGTCACCAAGTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGGTCCGGGCCTTCGGCGCTGTGGGGACCGCCTGCTGGTCACCAAGTGCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCCGCCTCCGTCACAAGGAGCCCGGCAGTGGCAGCGGCGGCGGTGTTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCCGCCTCCGTCACAAGGAGCCCGGCAGTGGCAGCGGCGGCGGTGTTTAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TGGGTGGACTCTCAGCAGAAGCGG         TATGTTCCAGTAAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 100301 TGGGTGGACTCTCAGCAGAAGCGGGTG...TAGTATGTTCCAGTAAAAGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 AGACCATGTGATTGGCATAGTGACAGCTAAATCTGGAGATATATTCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100999 AGACCATGTGATTGGCATAGTGACAGCTAAATCTGGAGATATATTCAAAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TTGATGTTGGAGGGAGTGAGCCAGCTTCTTTGTCTTACTTGTCATTTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101049 TTGATGTTGGAGGGAGTGAGCCAGCTTCTTTGTCTTACTTGTCATTTGAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GGTGCAACTAAAAGAAACAGACCAAATGTGCAG         GTTGGAGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 101099 GGTGCAACTAAAAGAAACAGACCAAATGTGCAGGTA...TAGGTTGGAGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 TCTCATCTATGGCCAATTTGTGGTTGCTAATAAAGACATGGAACCAGAGA
        ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102916 TCTCATCTATGGCCAGTTTGTGGTTGCTAATAAAGACATGGAACCAGAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TGGTCTGTATTGACAGCTGTGGACGAGCCAATGGAATGGGTGTCATTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102966 TGGTCTGTATTGACAGCTGTGGACGAGCCAATGGAATGGGTGTCATTGGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 CAGGATGGTCTGCTTTTTAAAGTGACTCTGGGCTTAATTAGAAA      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 103016 CAGGATGGTCTGCTTTTTAAAGTGACTCTGGGCTTAATTAGAAAGTA...

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    627    GCTATTAGCTCCAGATTGTGAAATCATACAGGAAGTGGGAAAACTCT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104162 CAGGCTATTAGCTCCAGATTGTGAAATCATACAGGAAGTGGGAAAACTCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 ATCCACTGGAGATAGTATTTGGAATGAATGGAAGAATATGGGTTAAGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104212 ATCCACTGGAGATAGTATTTGGAATGAATGGAAGAATATGGGTTAAGGCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 AAAACCATCCAGCAGACTTTAATTTTGGCAAACATTTTAGAAGCTTGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104262 AAAACCATCCAGCAGACTTTAATTTTGGCAAACATTTTAGAAGCTTGTGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 ACACATGACGTCAGATCAAAGAAAACAGATCTTCTCCAGATTGGCAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104312 ACACATGACGTCAGATCAAAGAAAACAGATCTTCTCCAGATTGGCAGAAA

    850 
    824 GT
        ||
 104362 GT