seq1 = pF1KB6368.tfa, 894 bp
seq2 = pF1KB6368/gi568815578f_31376446.tfa (gi568815578f:31376446_31584427), 207982 bp

>pF1KB6368 894
>gi568815578f:31376446_31584427 (Chr20)

1-340  (100001-100340)   100% ->
341-423  (101383-101465)   100% ->
424-625  (105842-106043)   100% ->
626-894  (107714-107982)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACACTCAACACCGAGCAGGAAGCAAAGACCCCTCTGCACCGGCGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACACTCAACACCGAGCAGGAAGCAAAGACCCCTCTGCACCGGCGAGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAGCACCCCACTGCCCCTGTCCCCACGGGGCCACCAGCCTGGCCGCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAGCACCCCACTGCCCCTGTCCCCACGGGGCCACCAGCCTGGCCGCCTGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCACAGTGCCTTCCACTCAATCCCAGCATCCCCGGCTGGGCCAATCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCACAGTGCCTTCCACTCAATCCCAGCATCCCCGGCTGGGCCAATCAGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCCCTCAACCCTCCCACCCAGAAACCTTCACCTGCCCCAGATGATTGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCCCTCAACCCTCCCACCCAGAAACCTTCACCTGCCCCAGATGATTGGTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TTCTGAATCCAGCGACTCTGAAGGCTCCTGGGAGGCTCTCTACCGTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TTCTGAATCCAGCGACTCTGAAGGCTCCTGGGAGGCTCTCTACCGTGTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGCTACTTGGAGATCCTGGAGTGGGGAAGACCAGCTTGGCCAGCCTCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGCTACTTGGAGATCCTGGAGTGGGGAAGACCAGCTTGGCCAGCCTCTTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GCAGGGAAGCAAGAGAGGGACCTCCATGAACAGCTGGGAG         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 100301 GCAGGGAAGCAAGAGAGGGACCTCCATGAACAGCTGGGAGGTA...CAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 AGATGTATATGAGAGGACCCTCACGGTGGATGGAGAAGACACCACACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101384 AGATGTATATGAGAGGACCCTCACGGTGGATGGAGAAGACACCACACTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TGGTCGTGGACACCTGGGAGGCCGAGAAACTG         GATAAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 101434 TGGTCGTGGACACCTGGGAGGCCGAGAAACTGGTA...CAGGATAAAAGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TGGAGCCAGGAGTCATGCCTGCAGGGGGGCAGTGCCTATGTCATCGTATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105851 TGGAGCCAGGAGTCATGCCTGCAGGGGGGCAGTGCCTATGTCATCGTATA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CTCCATCGCAGACCGAGGCAGCTTTGAGAGTGCCTCTGAGCTCCGCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105901 CTCCATCGCAGACCGAGGCAGCTTTGAGAGTGCCTCTGAGCTCCGCATCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 AGCTGCGGCGCACACATCAGGCAGACCATGTGCCCATCATCCTCGTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105951 AGCTGCGGCGCACACATCAGGCAGACCATGTGCCCATCATCCTCGTGGGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 AACAAGGCAGACTTGGCCCGCTGCCGAGAAGTCTCTGTGGAAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 106001 AACAAGGCAGACTTGGCCCGCTGCCGAGAAGTCTCTGTGGAAGGTG...T

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    626   AGGGCCGCGCCTGCGCTGTGGTGTTCGACTGTAAATTCATCGAGACAT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107712 AGAGGGCCGCGCCTGCGCTGTGGTGTTCGACTGTAAATTCATCGAGACAT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 CCGCCACGCTGCAGCACAATGTGGCCGAGCTCTTCGAGGGCGTGGTGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107762 CCGCCACGCTGCAGCACAATGTGGCCGAGCTCTTCGAGGGCGTGGTGCGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 CAACTGCGCTTGCGCCGCCGGGACAGTGCGGCCAAGGAACCCCCAGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107812 CAACTGCGCTTGCGCCGCCGGGACAGTGCGGCCAAGGAACCCCCAGCACC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 CCGACGGCCGGCCAGCCTAGCCCAGCGCGCTCGTCGCTTCCTGGCACGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107862 CCGACGGCCGGCCAGCCTAGCCCAGCGCGCTCGTCGCTTCCTGGCACGCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 TGACAGCCCGCAGCGCACGCCGCCGGGCACTCAAGGCCCGCTCCAAGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107912 TGACAGCCCGCAGCGCACGCCGCCGGGCACTCAAGGCCCGCTCCAAGTCC

    900     .    :    .    :
    874 TGCCACAATCTGGCCGTGCTC
        |||||||||||||||||||||
 107962 TGCCACAATCTGGCCGTGCTC